Um novo peixe euteleósteo do Cretáceo Inferior da Bacia do Tucano, Nordeste do Brasil

A new euteleostean fish, Britoichthys marizalensis gen. and sp.nov. is described from the Lower Cretaceous of Tucano basin, North-eastern Brazil, based on various almost complete and articulate specimens preserved in a yellowish siltstone yielded from Marizal Formation. This taxon is recognised by an unique combination of characters: an ethmoidean commissure on rostrodermethmoid bone; well- developed premaxilla with fang-like teeth; presence of a sinuous maxilla with oral border garnished of aligned conical teeth; massive mandible with straight oral border; reduced orbit bordered by large infraorbital bones; seven branchiostegals rays; three uroneurals, the first not extending forward beyond the preural centrum 1; ural centra not fused; membranous outgrowth (stegural) of first uroneural; leaf- like plates of bone associated with rudimentary neural arches of the first preural and ural vertebrae; non bifurcate epineurals, pattern 2 supraneurals, cycloid scales, and 36 vertebrae. The reduced number of vertebrae and branchiostegal rays, premaxilla shape, caudal endoskeleton pattern, simple epineurals, supraneural type, and the presence of a retroarticular in the corner of the lower jaw suggest affinities with euteleostean fishes. In so far as known, Britoichthys is unique in its combination of features and cannot be included in any known family.Um novo peixe euteleósteo, Britoichthys marizalensis gen. e sp.nov., é descrito do Cretáceo Inferior da Bacia do Tucano, Nordeste do Brasil, com base em espécimes praticamente completos e articulados preservados em um siltito amarelado produzido na Formação Marizal. Esse táxon é reconhecido por uma combinação única de caracteres: comissura etmoideana no rostrodermetmóide; pré-maxilar bem desenvolvido e com dentes agudos; presença de um maxilar sinuoso provido de dentes cônicos alinhados; mandíbula bem ossificada e com bordo oral reto; órbita reduzida e margeada de grandes ossos infraorbitais; sete raios branquiostégios; três uroneurais, o primeiro não se estendendo adiante além do primeiro centro preural; centros urais não fusionados; projeção membranosa (estegural) do primeiro uroneural; lâminas ósseas em forma de folha associadas com arcos neurais rudimentares dos primeiros centros pré-ural e ural; epineurais simples (não bifurcados); padrão tipo 2 de supraneurais; escamas ciclóides; e trinta e seis vértebras. O reduzido número de vértebras e raios branquiostégios, o formato do pré-maxilar, o padrão do endoesqueleto caudal, epineurais simples, o padrão de supraneural, e a presença de um retroarticular no canto da maxila inferior sugerem afinidades com peixes euteleósteos. Até onde se sabe, Britoichthys é único em sua combinação de caracteres e não pode ser incluído em qualquer família conhecida

Reavaliação da morfologia de Scombroclupeoides scutata Woodward, 1908, um teleósteo do Eocretáceo da Bahia, com comentários sobre suas afinidades

Scombroclupeoides scutata is a teleostean fish known from the Neocomian (non-marine lowermost Cretaceous) of the Morro do Barro Formation, Almada Basin, State of Bahia. This fish is very scarce in paleontological collections and most of available specimens are poorly preserved. In order to furnish additional morphological data as a framework for evaluating its systematic position, five complete and relatively well preserved specimens from the paleontological collection of the Departamento Nacional de Produção Mineral were studied. The result indicates presence of informative features suggesting that S. scutata is more advanced than so-called leptolepids and proleptolepids (e.g., absence of suborbitals, loss of fringing fulcra, reduced number of branchiostegals, absence of preopercular process of hyomandibula, subequal-sized dorsal and ventral hypohyals) and that, on the other hand, indicate putative affinities with primitive euteleostean fishes.Scombroclupeoides scutata é um peixe teleósteo conhecido do Neocomiano (depósito não marinho do Cretáceo Inferior) da Formação Morro do Barro, Bacia do Almada, Estado da Bahia. Este peixe é raro em coleções paleontológicas e a maior parte dos espécimes disponíveis estão precariamente preservados. Com o intuito de fornecer informações morfológicas para o esclarecimento de sua posição sistemática, foram estudados cinco espécimes completos e relativamente bem preservados pertencentes à coleção paleontológica do Departamento Nacional de Produção Mineral. Os resultados indicam a presença de aspectos anatômicos informativos sugerindo que S. scutata é avançado em relação a táxons comumente referidos na literatura com leptolepídeos e proleptolepídeos (e.g., ausência de suborbitais, perda das fulcras em franja, número reduzido de raios branquiostégios, ausência de processo preopercular do hiomandibular, hipiais dorsal e ventral de tamanho aproximado) e que, por outro lado, sugerem putativas afinidades com peixes euteleósteos primitivos

Hematócrito baixo compromete a remoção de CO2 da mucosa gástrica na hemodiluição normovolêmica intensa experimental

OBJECTIVE: The net effects of acute normovolemic hemodilution with different hemoglobin levels on splanchnic perfusion have not been elucidated. The hypothesis that during moderate and severe normovolemic hemodilution, systemic and splanchnic hemodynamic parameters, oxygen-derived variables, and biochemical markers of anaerobic metabolism do not reflect the adequacy of gastric mucosa, was tested in this study. METHODS: Twenty one anesthetized mongrel dogs (16 ± 1 kg) were randomized to controls (CT, n = 7, no hemodilution), moderate hemodilution (hematocrit 2 5% ± 3%, n = 7) or severe hemodilution (severe hemodilution, hematocrit 15% ± 3%, n = 7), through an isovolemic exchange of whole blood and 6% hydroxyethyl starch, at a 20 mL/min rate, to the target hematocrit. The animals were followed for 120 min after hemodilution. Cardiac output (CO, L/min), portal vein blood flow (PVF, mL/min), portal vein-arterial and gastric mucosa-arterial CO2 gradients (PV-artCO2 and PCO2 gap, mm Hg, respectively) were measured throughout the experiment. RESULTS: Exchange blood volumes were 33.9 ± 3.3 and 61.5 ± 5.8 mL/kg for moderate hemodilution and severe hemodilution, respectively. Arterial pressure and systemic and regional lactate levels remained stable in all groups. There were initial increases in cardiac output and portal vein blood flow in both moderate hemodilution and severe hemodilution; systemic and regional oxygen consumption remained stable largely due to increases in oxygen extraction rate. There was a significant increase in the PCO2-gap value only in severe hemodilution animals. CONCLUSION: Global and regional hemodynamic stability were maintained after moderate and severe hemodilution. However, a very low hematocrit induced gastric mucosal acidosis, suggesting that gastric mucosal CO2 monitoring may be useful during major surgery or following trauma.OBJETIVO: Os efeitos da hemodiluição normovolêmica com diferentes níveis de hemoglobina na perfusão esplâncnica são pouco conhecidos. Testamos a hipótese que durante a hemodiluição moderada e acentuada, os parâmetros hemodinâmicos sistêmicos e regionais e as variáveis relacionadas ao metabolismo de oxigênio não refletem a adequação da perfusão da mucosa gástrica. MÉTODOS: Vinte e um cães anestesiados com fentanil e vecurônio (16±1 kg) foram randomizados como controles (CT, n=7, sem hemodiluição normovolêmica), hemodiluição normovolêmica moderada (Ht 25±3%, n=7) ou hemodiluição normovolêmica acentuada (Ht 15±3%, n=7), pela troca isovolêmica entre o sangue total e hidroxietil amido a 6%, 20 mL/min até o hematócrito pré-estabelecido para cada grupo. Os animais foram acompanhados por 120 min após a hemodiluição normovolêmica. Durante todo o experimento foram medidos o débito cardíaco (CO, L/min), o fluxo de veia porta (PVF, mL/min), e os gradientes de CO2 veia porta-arterial e mucosa gástrica-arterial (PV-artCO2 and PCO2-gap, mmHg, respectivamente). RESULTADOS: O volume de sangue trocado foi de 33,9±3,3 mL/kg para hemodiluição normovolêmica moderada e de 61,5±5,8 mL/kg para a hemodiluição normovolêmica acentuada. A pressão arterial e os níveis de lactato sistêmico e regional permaneceram estáveis em todos os grupos. Houve aumentos iniciais de débito cardíaco e de fluxo de veia porta, tanto na hemodiluição normovolêmica moderada quanto na hemodiluição normovolêmica acentuada; o consumo de oxigênio sistêmico e regional permaneceram estáveis, principalmente por conta de aumentos na taxa de extração de oxigênio. O PCO2-gap apresentou aumento significativo apenas nos animais submetidos a hemodiluição normovolêmica acentuada. CONCLUSÃO: Ocorre estabilidade hemodinâmica global e regional tanto na hemodiluição normovolêmica moderada quanto na acentuada. Entretanto, o hematócrito de 15% induziu acidose moderada de mucosa gástrica, o que pode ser relevante em procedimentos cirúrgicos de grande porte ou no trauma

Efeito da idade relativa na antropometria, maturação biológica e desempenho em jovens futebolistas

O estudo teve como propósito investigar a presença do efeito da idade relativa e a influência do quartil de nascimento na antropometria, maturação biológica e desempenho físico e técnico de jovens futebolistas. Foram amostrados 119 futebolistas do sexo masculino, sendo 74 da categoria infantil (sub-15) e 45 da categoria juvenil (sub-17). A data de nascimento dos atletas foi dividida em quatro quartis. Foram avaliadas a massa corporal, a estatura e as dobras cutâneas. A maturação biológica foi acedida através da idade esquelética, pelo método de Fels. O desempenho físico incluiu testes de força de membros inferiores, velocidade, resistência aeróbica e potência anaeróbica. O desempenho técnico foi avaliado pelas provas de controle da bola, condução da bola e precisão de chute. No geral, 65,5% dos futebolistas nasceram no primeiro semestre do ano (c2=8,069, p=0,04), porém, na análise por categoria, não houve diferença significante na distribuição das datas de nascimento por quartil quando comparado com a população de referência (sub-15: c2=6,322, p=0,10; sub-17: c2=2,339, p=0,50). A MANCOVA não revelou diferenças significantes entre os quartis na antropometria, maturação biológica e desempenho físico e técnico em ambas as categorias competitivas. Estes resultados sugerem que existe maior proporção de jovens futebolistas brasileiros nascidos nos primeiros meses do ano, mas que o EIR não constitui necessariamente uma vantagem sob o ponto de vista antropométrico, físico e técnico. Os processos individuais de maturação biológica devem ser considerados pelos técnicos na seleção dos atletas

Microbiota analysis of biofilms on experimental abutments mimicking dental implants: an in vivo model

Background: the microbiota colonizing dental implants has been said to be similar to the microbiome surrounding teeth. In the absence of inflammation, a biofilm with pathologic bacteria can cover implant surfaces exposed to the oral cavity, for example, due to a remodeling process. The aim of the present study is to identify microbiota surrounding exposed dental implants in patients with and without a history of periodontitis through a deep-sequencing approach. Methods: an experimental abutment with the same surface and structure as a commercially available dental implant was used. Bacterial DNA was isolated, and the 16S ribosomal RNA gene was amplified and sequenced. Multiplexed tag-encoded sequencing of DNA from the samples was performed, and the reads were processed by metagenomic rapid annotation.Results: a wide variety of bacteria, 96 species, were identified. The most frequently found bacteria were Fusobacterium nucleatum and Prevotella denticola. Some species generally associated with periodontitis were found to a greater extent in patients without a history of periodontitis. Some bacteria that have never been described as part of the oral microbiome were identified in the present sample.Conclusions: analysis of data suggests that the bacteria surrounding exposed dental implants form a diverse microbiome regardless of the periodontal profile of patients. Further research is needed to clarify the role of these microorganisms in the oral environment

Análise Filogenética dos Dercetidae (Teleostei, Aulopiformes)

The family Dercetidae comprises marine long snouted teleosts with elongated and shallow body, bearing one or more rows of tripartite scutes along the flanks and one or two pairs of prominent transverse processes on each abdominal vertebral centrum. It is commonly found in Tethyan deposits from Europe, Asia, Africa, South America and Central America, ranging from the Late Cretaceous (Cenomanian) to the Paleocene (Danian). The phylogenetic position of the group is controverse. Since 1960’s, it has been included within different orders (e.g., Myctophiformes, Salmoniformes, Stomiiformes, and Aulopiformes). In all cases, the authors only used non-numerical methods in the phylogenetic reconstructions. A parsimony analysis was carried out using the computer programs Hennig86 and PAUP* 4.0b10, based on a data matrix built with 52 non-ordered characters and seven terminals for ingroup (i.e., Cyranichthys, Dercetis, Dercetoides, Hastichthys, Pelargorhynchus, Rhynchodercetis, and new dercetid of the Pelotas Basin). The rooting was made using as outgroup the taxa Ichthyotringa, Apateopholis, Cimolichthys, Eurypholis, Saurorhamphus, and Prionolepis. Using exact algorithms, only one tree was obtained with 126 steps, consistency index of 0.50, and retention index of 0.54. This analysis revealed that Dercetidae is a monophyletic group supported by two synapomorphies: reduced neural spine and absence of longitudinal opercular crest. The topology founded was: (Dercetis + (Pelargorhynchus + (new dercetid + Cyranichthys)) + (Dercetoides + (Hastichthys + Rhynchodercetis))). A família Dercetidae compreende peixes teleósteos marinhos, com focinho comprido, de corpo alongado e baixo, provido de uma ou mais fileiras de escudos tripartidos ao longo dos flancos e um ou dois pares de proeminentes processos transversos em cada centro vertebral da região abdominal. São encontrados em depósitos sedimentares tetianos da Europa, Ásia, África, América Central e do Sul, com amplitude temporal do Neocretáceo (Cenomaniano) ao Paleoceno (Daniano). Apesar de alguns trabalhos sobre o grupo, seu posicionamento filogenético ainda é controverso. A partir da década de 1960, a família foi incluída em distintas ordens (e.g., Myctophiformes, Salmoniformes, Stomiiformes e Aulopiformes). Em todos os casos, os autores utilizaram apenas métodos manuais de reconstrução filogenética. Uma análise de parcimônia foi realizada utilizando-se os programas Hennig86 e PAUP* 4.0b10, com base em uma matriz de dados construída a partir de 52 caracteres não ordenados e sete táxons terminais para o grupo interno (i.e., Cyranichthys, Dercetis, Dercetoides, Hastichthys,Pelargorhynchus, Rhynchodercetis e novo dercetídeo da Bacia de Pelotas). O enraizamento foi feito considerando-se como grupo externo os táxons Ichthyotringa, Apateopholis, Cimolichthys, Eurypholis, Saurorhamphus e Prionolepis. Utilizando-se algoritmos exatos, foi obtida uma única árvore com 126 passos, índice de consistência de 0,50 e índice de retenção de 0,54. A análise revelou que Dercetidae é um grupo monofilético suportado por duas sinapomorfias: espinho neural reduzido e ausência de crista longitudinal no opérculo. A topologia encontrada foi: (Dercetis + (Pelargorhynchus + (novo dercetídeo + Cyranichthys)) + (Dercetoides + (Hastichthys + Rhynchodercetis)))

PHYTOPLANKTON BIOMASS INCREASES IN A SILT-IMPACTED AREA IN AN AMAZONIAN FLOOD-PLAIN LAKE OVER 15 YEARS

Funding Information: We thank Mineração Rio do Norte S.A. and Limnologia/UFRJ for fieldwork support, Dr. Janet W. Reid (JWR Associates) for language revision, and Leonardo Preza Rodrigues for map charting. VLMH, JCN, FAE, RLB, and FR are partially supported by the National Council for Scientific and Technological Development (CNPq), Brazil, RLB, and FAE by FAPERJ, Brazil, and CGR financially supported by Sakari Alhopuro Foundation, Finland. Publisher Copyright: © 2022, Universidade Federal do Rio de Janeiro. All rights reserved.Tailings from bauxite mining in Porto Trombetas (Pará state, Central Amazonia, Brazil) was discharged (1979–1989) into Batata Lake affecting about 30% of its area. The lake belongs to a clear-water flood-plain system along the Trombetas River, a tributary of the Amazon River. Siltation is the main perceived factor impacting aquatic and flooded communities. Besides natural regeneration, a program to restore a section of igapó forest in the impacted area (IA) has been conducted since 1991. Decreased light is the main factor reducing total phytoplankton biomass (PhyBM) in IA. We hypothesized that PhyBM in IA increases over time because of the improvement of the underwater light conditions due to the natural regeneration and restoration. We sampled quarterly PhyBM and limnological variables (depth, transparency, temperature, pH, conductivity, dissolved oxygen, turbidity, suspended solids, total Kjeldahl nitrogen, and total phosphorus), over 15 years (2005–2019) at eight sampling sites in the two areas (N = 349). We also obtained daily climatic and hydrologic data. PhyBM was higher in NIA than in IA. The temporal trend in the annual mean of PhyBM increased significantly over time only in the IA, approximating the NIA values, confirming our general hypothesis. The increase of PhyBM in the IA was negatively related to the residual light attenuation caused by non-phytoplankton turbidity and to total phosphorus, and positively to air temperature and site depth (p < 0.05; Marginal r2 = 0.18; Conditional r2 = 0.29). Instead, in NIA, PhyBM was explained only by the increase in air temperature (p < 0.05; Marginal r2 = 0.15; Conditional r2 = 0.34). We concluded that the PhyBM in the IA positively responds to the synergy between increasing light availability, air temperature, and site depth, and decreasing total phosphorus concentrations, regardless of hydrologic phase.Peer reviewe

Computing the shortest elementary flux modes in genome-scale metabolic networks

This article is available open access through the publisher’s website through the link below. Copyright @ The Author 2009.Motivation: Elementary flux modes (EFMs) represent a key concept to analyze metabolic networks from a pathway-oriented perspective. In spite of considerable work in this field, the computation of the full set of elementary flux modes in large-scale metabolic networks still constitutes a challenging issue due to its underlying combinatorial complexity. Results: In this article, we illustrate that the full set of EFMs can be enumerated in increasing order of number of reactions via integer linear programming. In this light, we present a novel procedure to efficiently determine the K-shortest EFMs in large-scale metabolic networks. Our method was applied to find the K-shortest EFMs that produce lysine in the genome-scale metabolic networks of Escherichia coli and Corynebacterium glutamicum. A detailed analysis of the biological significance of the K-shortest EFMs was conducted, finding that glucose catabolism, ammonium assimilation, lysine anabolism and cofactor balancing were correctly predicted. The work presented here represents an important step forward in the analysis and computation of EFMs for large-scale metabolic networks, where traditional methods fail for networks of even moderate size. Contact: [email protected] Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online (http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/full/btp564/DC1).Fundação Calouste Gulbenkian, Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) and Siemens SA Portugal