175 research outputs found
Advances Towards Integrated Management of Fungal Grapevine Trunk Diseases
Programa Oficial de Doutoramento en Biotecnoloxía Avanzada. 5012V01[Abstract]
Grapevine trunk diseases (GTDs) are among the main biotic threats to the economic
sustainability of the grapevine industry worldwide, reducing yields, productivity and
longevity of vineyards. Several factors such as changes in vineyard cultural practices, low
sanitary quality of the grapevine propagation material, the ban of most effective chemical
active ingredients, and poor protection of pruning wounds have increased their incidence
over last years. Moreover, these diseases are very complex and involve a broad spectrum
of taxonomically unrelated fungi making their control very challenging. In this thesis, the
development and implementation of novel molecular techniques that lead to the
improvement of practical effective strategies to the GTD management were investigated.
The assessment of sustainable alternatives to the use of fungicides to increase vineyards
lifespan was also performed.
Initially, we comparatively assessed the accuracy, efficiency, and specificity of Droplet
Digital PCR (ddPCR) and real-time PCR (qPCR) techniques for the detection and
quantification of Ilyonectria liriodendri in bulk and rhizosphere soil, as well as, grapevine
endorhizosphere obtained from healthy young vines in La Rioja region. The results
revealed a strong correlation between both techniques with ddPCR being more sensitive
to very low pathogen concentrations. Roots of asymptomatic vines were found to be a
microbial niche that is inhabited by black-foot disease pathogens.
Then, the spatial dynamics of the fungal communities of these three soil-plant
compartments were also characterized by high-throughput amplicon sequencing (HTAS).
Soil fungal assemblages had extensive local homogeneity across small distances, and soils
with similar climatic and edaphic variables, thus suggesting that vineyard fungal
communities are partially conserved in La Rioja region. The diversity and composition of
the fungal communities were largely affected by the soil-plant compartment, with
diversity decreasing in the endorhizosphere and suggesting that the root tissues entail a
barrier for fungal colonization. The results of functional prediction suggested an increase
in the relative abundances of potential plant pathogens, endophytes and arbuscular
mycorrhiza, and a decrease in the relative abundance of potential wood and/or dung
saprotrophs were predicted from bulk soil towards the endorhizosphere. Once more, it
was found that the internal root tissues of asymptomatic vines are a microbial niche that
is inhabited by GTD fungi.
Abstract
xiv
The HTAS technique was also used to determine the effect of pruning time on the
fungal microbiome diversity and composition that colonized pruning wounds naturally
over two infection periods (November-February and February-May), in vineyards
belonging to three Denominations of Origin (D.O.) in Galicia (Spain). The fungal
communities colonizing grapevine pruning wounds were affected in their composition
and diversity by the D.O., whereas the spatial variation within each region was low. The
results showed the existence of a core community of fungal species conserved in grapevine
pruned canes regardless of the infection period. Higher abundances for most GTD genera
were detected after pruning in February (winter) than in November (mid-autumn),
therefore suggesting a seasonal effect on pruning wounds infections. Additionally, a
positive correlation was observed between the accumulated rainfall and the abundance of
the total fungal microbiome and Diaporthe genus over eighth and eleventh weeks after
pruning.
Planting tolerant grapevine cultivars is one of the alternatives to the use of fungicides
in controlling GTDs. The tolerance to Phaeomoniella chlamydospora infection of
commercial and minority grapevine cultivars from Spanish germplasm collections was
evaluated in a rapid and effective detached cutting assay under greenhouse conditions. All
cultivars developed internal wood lesions after artificial inoculation with the causal agent
of Petri disease and esca, indicating that there is no evidence of qualitative resistance to
this fungus. Nevertheless, the severity of internal wood symptoms varied considerably
amongst cultivars allowing to classify them according to varying signs of partial tolerance
to Pa. chlamydospora. The cultivars ‘Estaldiña’, ‘Albillo Mayor’ or ‘Castañal’ were classified
as the most tolerant based on mean lengths of wood discolouration. No foliar symptoms
were observed on artificially inoculated plants during the experiments.
Regarding disease management strategies, we assessed the effect of several biocontrol
agents (BCAs) applied as root treatments at pre- and post-planting to control natural
infections caused by black-foot and Petri diseases fungi, and their influence in plant
growth parameters. Results showed that BCA effectiveness was dependent on the plant
age and the plant part analyzed in reducing the incidence and severity of both diseases.
Under specific scenarios, Streptomyces sp. E1 + R4 significantly reduced Dactylonectria
torresensis and D. macrodidyma (black-foot) infections, while Pythium oligandrum Po37
and Trichoderma spp. significantly reduced Pa. chlamydospora and Phaeoacremonium
minimum (Petri disease) infections. BCAs treatments significantly reduced root weight
with respect to the control while no effect was observed on the shoot weight.
Abstract
xv
Finally, we comparatively evaluated the efficacy of various fungicide and BCA
formulations registered in Spain to act as pruning wound protectants against Diplodia
seriata and Pa. chlamydospora, in the two vineyards of the D.O. Valdeorras (Galicia,
Spain). Results showed that BCA-based treatments were less effective than fungicides. The
commercial formulation containing pyraclostrobin + boscalid provided a high control of
both GTD fungi while Trichoderma-based treatments showed a low efficacy. The poor
performance and implantation of treatments based on Trichoderma spp. it is further
discussed considering among other factors, the high spore load of GTD fungi used in the
artificial inoculations, the short period elapsed between the BCAs treatments application
and artificial inoculation with GTD fungi, the effect of unfavourable environmental
conditions for the implantation of Trichoderma or the possibility of a low affinity of these fungi for the cultivar 'Godello'.[Resumen]
Las enfermedades de la madera de la vid (EMV) se encuentran entre las principales
amenazas bióticas para la sostenibilidad económica de la industria vitivinícola mundial,
reduciendo el rendimiento, productividad y longevidad de los viñedos. Varios factores han
sido atribuidos al aumento de su incidencia en los últimos años, como son los cambios en
las prácticas culturales de los viñedos, la baja calidad sanitaria del material de propagación
de vid, la prohibición de las materias activas químicas más efectivas y la deficiente
protección de las heridas de poda. Además, estas enfermedades son muy complejas,
implicando un amplio espectro de hongos no relacionados taxonómicamente, lo que hace
que su control sea muy difícil. En esta tesis, se realizaron estudios para la puesta a punto
de nuevas técnicas moleculares para la mejora en la detección y gestión de las EMV, así
como, la evaluación de alternativas sostenibles al uso de fungicidas que permitan
aumentar la vida útil de los viñedos.
En primer lugar, se evaluó comparativamente la precisión, la eficiencia y la
especificidad de las técnicas de PCR digital (ddPCR) y PCR en tiempo real (qPCR) para la
detección y cuantificación de Ilyonectria liriodendri a partir de muestras de suelo, rizosfera
y endorizosfera de viñedos jóvenes y aparentemente sanos de La Rioja. Los resultados
revelaron una fuerte correlación entre ambas técnicas, siendo la ddPCR más sensible a
concentraciones muy bajas del patógeno. Se observó que las raíces de vides asintomáticas
son un nicho microbiano que está habitado por patógenos asociados a la enfermedad del
pie negro.
A continuación, se caracterizó la dinámica espacial de las comunidades fúngicas de
estos tres compartimentos, mediante la técnica de secuenciación masiva de amplicones
(HTAS), observándose que las comunidades de hongos fueron homogéneas entre viñedos.
Teniendo en cuenta que los estudios se realizaron en viñedos con variables climáticas y
edáficas similares, estos resultados indican que el microbioma del viñedo de La Rioja se
conserva parcialmente en la región. Sin embargo, el compartimento suelo-planta
constituyó la principal fuente de diversidad y composición de las comunidades fúngicas,
con una disminución de la diversidad en la endorizosfera, sugiriendo que los tejidos de la
raíz suponen una barrera para la colonización fúngica. El análisis predictivo de
funcionalidad mostró un aumento en la abundancia relativa de posibles patógenos de
plantas, endófitos y micorrizas arbusculares, y una disminución en la abundancia relativa
de posibles saprótrofos de la madera y/o estiércol, del suelo hacia la endorizosfera. Se
corrobora así mismo que los tejidos internos de la raíz de las vides asintomáticas son un
nicho microbiano que está habitado por hongos asociados a las EMV.
La HTAS también se empleó para determinar el efecto de la época de poda en la
diversidad y composición del microbioma fúngico que coloniza las heridas de poda de
forma natural durante dos períodos de infección (noviembre-febrero y febrero-mayo), en
viñedos pertenecientes a tres Denominaciones de Origen (D.O.) de Galicia (España). Las
comunidades fúngicas que colonizan las heridas de poda de la vid se vieron afectadas en
su composición y diversidad por la D.O., mientras que la variación espacial dentro de cada
región fue baja. Se constató la existencia de un microbioma fúngico estable en las heridas
de poda, independientemente del período de infección, con abundancias más altas para la
mayoría de los géneros de hongos asociados a EMV después de la poda de febrero
(invierno) que en la de noviembre (mediados de otoño), lo que sugiere un efecto estacional
en las infecciones de las heridas de poda. Además, se observó una correlación positiva
entre la lluvia acumulada y la abundancia del microbioma fúngico total, y del género
Diaporthe en particular, durante la octava y la undécima semana después de la poda.
Una de las alternativas al uso de fungicidas en el control de las EMV es la utilización de
cultivares menos sensibles a estos patógenos. En este sentido se evaluó, en un ensayo bajo
condiciones de invernadero, la tolerancia de cultivares de vid comerciales y minoritarios,
presentes en colecciones de germoplasma españolas, ante la infección de Phaeomoniella
chlamydospora, el principal agente causal de la enfermedad de Petri y la yesca. No se
observaron síntomas foliares en las plantas, si bien todos los cultivares desarrollaron
lesiones internas en la madera después de la inoculación artificial con el hongo, lo que
indica que no hay evidencia de que exista resistencia cualitativa a Pa. chlamydospora. Sin
embargo, la severidad de los síntomas internos de la madera varió considerablemente
entre los cultivares, lo que permitió clasificarlos en base a diversos grados de tolerancia
parcial a la infección fúngica. Los cultivares ‘Estaldiña’, ‘Albillo Mayor’ y ‘Castañal’ se
clasificaron como los más tolerantes en función de las longitudes medias de necrosis de la
madera.
En relación con las estrategias de manejo de estas enfermedades, se evaluó el efecto de
varios agentes de control biológico (ACBs), aplicados como tratamientos radiculares en
pre- y post-plantación, para controlar infecciones naturales causadas por hongos
asociados con las enfermedades del pie negro y de Petri, así como, su influencia en los
parámetros de crecimiento de la planta. La efectividad del ACB para reducir la incidencia
y la severidad de ambas enfermedades varió con la edad y la parte de la planta analizada.
Bajo escenarios específicos, Streptomyces sp. E1 + R4 redujo significativamente las
infecciones causadas por Dactylonectria torresensis y D. macrodidyma (pie negro),
mientras que Pythium oligandrum Po37 y Trichoderma spp. redujeron significativamente
las infecciones causadas por Pa. chlamydospora y Phaeoacremonium minimum
(enfermedad de Petri). Los tratamientos con ACB redujeron significativamente el peso de
la raíz con respecto al control, mientras que no se observó ningún efecto sobre el peso del
brote.
Finalmente, se evaluó la eficacia de diversas formulaciones fungicidas y de ACB,
registradas en España, como protectores de heridas de poda frente a infecciones artificiales
de Diplodia seriata y Pa. chlamydospora, en dos viñedos de la D.O. Valdeorras (Galicia,
España). Los resultados mostraron, en estas condiciones de estudio, que los tratamientos
basados en ACBs fueron menos efectivos que los fungicidas. La formulación comercial
basada en piraclostrobin + boscalida proporcionó un alto control de ambos hongos
asociados a las EMV, mientras que los tratamientos basados en Trichoderma mostraron
baja eficacia. El bajo rendimiento e implantación de los tratamientos basados en
Trichoderma spp. es discutido más a fondo, valorando entre otros factores, la elevada carga
de esporas utilizada en las inoculaciones artificiales de los hongos asociados con las EMV,
el corto periodo de tiempo transcurrido entre la aplicación del ACB y la inoculación
artificial de los mismos, el efecto de las condiciones ambientales adversas para la
implantación de Trichoderma o la posibilidad de una baja afinidad de estos hongos por el cultivar ‘Godello’.[Resumo]
As enfermidades da madeira da vide (EMV) atópanse entre as principais ameazas
bióticas para a sustentabilidade económica da industria vitivinícola mundial, reducindo o
rendemento, produtividade e lonxevidade dos viñedos. Varios factores foron atribuídos ao
aumento da súa incidencia nos últimos anos, como son os cambios nas prácticas culturais
dos viñedos, a baixa calidade sanitaria do material de propagación de vide, a prohibición
das materias activas químicas máis efectivas e a deficiente protección das feridas de poda.
Ademais, estas enfermidades son moi complexas, implicando un amplo espectro de fungos
non relacionados taxonómicamente, o que fai que o seu control sexa moi difícil. Nesta
tese, realizáronse estudos para a posta a punto de novas técnicas moleculares para a
mellora na detección e xestión das EMV, así como, a avaliación de alternativas sostibles ao
emprego de funxicidas que permitan aumentar a vida útil dos viñedos.
En primeiro lugar, avaliouse comparativamente a precisión, a eficiencia e a
especificidade das técnicas de PCR dixital (ddPCR) e PCR en tempo real (qPCR) para a
detección e cuantificación de Ilyonectria liriodendri en mostras de solo, rizosfera e
endorizosfera de viñedos novos e aparentemente sans de La Rioja. Os resultados revelaron
unha forte correlación entre ambas as técnicas, sendo a ddPCR máis sensible a
concentracións moi baixas do patóxeno. Observouse que as raíces de vides asintomáticas
son un nicho microbiano que está habitado por patóxenos asociados á enfermidade do pé
negro.
A continuación, caracterizouse a dinámica espacial das comunidades fúnxicas destes
tres compartimentos mediante a técnica de secuenciación masiva de amplicóns (HTAS),
observándose que as comunidades de fungos foron homoxéneas entre viñedos. Tendo en
conta que os estudos se realizaron en viñedos con variables climáticas e edáficas similares,
estes resultados indican que o microbioma do viñedo de La Rioja consérvase parcialmente
na rexión. Porén, o compartimento solo-planta constituíu a principal fonte de diversidade
e composición das comunidades fúnxicas, cunha diminución da diversidade na
endorizosfera, suxerindo que os tecidos da raíz supoñen unha barreira para a colonización
fúnxica. A análise preditiva de funcionalidade mostrou un aumento na abundancia relativa
de posibles patóxenos de plantas, endófitos e micorrizas arbusculares, e unha diminución
na abundancia relativa de posibles saprótrofos da madeira e/ou do esterco, do solo cara a
endorizosfera. Corrobórase así mesmo que os tecidos internos da raíz das vides
asintomáticas son un nicho microbiano que está habitado por fungos asociados ás EMV.
A HTAS empregouse tamén para determinar o efecto da época de poda na diversidade
e composición do microbioma fúnxico que coloniza as feridas de poda de forma natural
durante dous períodos de infección (novembro-febreiro e febreiro-maio), en viñedos
pertencentes a tres Denominacións de Orixe (D.O.) de Galicia (España). As comunidades
fúnxicas que colonizan as feridas de poda da vide víronse afectadas na súa composición e
diversidade pola D.O., mentres que a variación espacial dentro de cada rexión foi baixa.
Constatouse a existencia dun microbioma fúnxico estable nas feridas de poda,
independentemente do período de infección, con abundancias máis altas para a maioría
dos xéneros de fungos asociados ás EMV despois da poda de febreiro (inverno) que na de
novembro (mediados de outono), o que suxire un efecto estacional nas infeccións das
feridas de poda. Ademais, observouse unha correlación positiva entre a chuvia acumulada
e a abundancia do microbioma fúnxico total, e do xénero Diaporthe en particular, durante
a oitava e a undécima semana despois da poda.
Unha das alternativas ao emprego de funxicidas no control das EMV é a utilización de
cultivares menos sensibles a estes patóxenos. Neste sentido avaliouse, nun ensaio baixo
condicións de invernadoiro, a tolerancia de cultivares de vide comerciais e minoritarios
presentes en coleccións de xermoplasma españolas, ante a infección de Phaeomoniella
chlamydospora, principal axente causal da enfermidade de Petri e da iesca. Non se
observaron síntomas foliares nas plantas, se ben todos os cultivares desenvolveron lesións
internas na madeira despois da inoculación artificial co fungo, o que indica que non hai
evidencia de que exista resistencia cualitativa a Pa. chlamydospora. Porén, a severidade
dos síntomas internos da madeira variou considerablemente entre os cultivares, o que
permitiu clasificalos en base a diversos grados de tolerancia parcial á infección fúnxica. Os
cultivares ‘Estaldiña’, ‘Albillo Mayor’ e ‘Castañal’ clasificáronse como os máis tolerantes en
función das lonxitudes medias de necrose da madeira.
En relación coas estratexias de manexo destas enfermidades, avaliouse o efecto de
varios axentes de control biolóxico (ACBs), aplicados como tratamentos radiculares en
pre- e post-plantación para controlar infeccións naturais causadas por fungos asociados
coas enfermidades do pé negro e de Petri, así como, a súa influencia nos parámetros de
crecemento da planta. A efectividade do ACB para reducir a incidencia e a severidade de
ambas enfermidades variou coa idade e a parte da planta analizada. Baixo escenarios
específicos, Streptomyces sp. E1 + R4 reduciu significativamente as infeccións causadas por
Dactylonectria torresensis e D. macrodidyma (pé negro), mentres que Pythium oligandrum
Po37 e Trichoderma spp. reduciron significativamente as infeccións causadas por Pa.
chlamydospora e Phaeoacremonium minimum (enfermidade de Petri). Os tratamentos con
ACB reduciron significativamente o peso da raíz con respecto ao control, mentres que non
se observou ningún efecto sobre o peso do brote.
Finalmente, avaliouse a eficacia de diversas formulacións funxicidas e de ACB,
rexistradas en España, como protectores das feridas de poda fronte a infeccións artificiais
de Diplodia seriata e Pa. chlamydospora, en dous viñedos da D.O. Valdeorras (Galicia). Os
resultados amosaron, nestas condicións de estudo, que os tratamentos baseados en ACBs
foron menos efectivos que os funxicidas. A formulación comercial baseada en
piraclostrobin + boscalida proporcionou un alto control de ambos os fungos asociados ás
EMV, mentres que os tratamentos baseados en Trichoderma mostraron baixa eficacia. O
baixo rendemento e implantación dos tratamentos baseados en Trichoderma spp.
discútese máis a fondo, valorando entre outros factores, a elevada carga de esporas
empregada nas inoculacións artificiais dos fungos asociados coas EMV, o corto período de
tempo transcorrido entre a aplicación do ACB e a inoculación artificial dos mesmos, o
efecto das condicións ambientais adversas para a implantación de Trichoderma ou a posibilidade dunha baixa afinidade destes fungos polo cultivar ‘Godello’
Las pruebas diagnósticas desde la perspéctiva poblacional: epidemiología de la enfermedad renal crónica y la resistencia a la insulina
La definición de estados patológicos a partir de puntos de corte en la distribución de marcadores biológicos continuos está sujeta a importantes fuentes de variabilidad y de sesgo. Un adecuado estudio de fiabilidad y precisión del método utilizado en la estimación del biomarcador es imprescindible para la correcta clasificación diagnóstica de los individuos.
En la presente Tesis Doctoral se analiza el comportamiento poblacional de biomarcadores utilizados en el diagnostico de dos trastornos prevalentes de base inflamatoria como son la Enfermedad Renal Crónica, ERC, y la Resistencia a la Insulina, RI en una muestra aleatoria (n 2746) de la población española mayor de 20 años, estratificada por edad y sexo. Existe una importante variabilidad en los criterios utilizados para clasificación diagnóstica tanto de deterioro de la función renal como de resistencia a la insulina. La prevalencia poblacional en España de ERC es 9.16%. Se propone un instrumento de clasificación de riesgo de deterioro de ERC para su empleo en practica clínica. Se establece la distribución percentil de HOMA-I, proponiéndose el valor de 2 como punto de corte para identificar individuos con mayor riesgo cardiometabólico.
Previamente a la realización del proyecto objeto de esta Tesis Doctoral, no se conocía la prevalencia de ERC ni la distribución de valores de HOMA-IR en población general en España, por lo que los resultados pueden contribuir a un precoz diagnóstico y correcta clasificación del riesgo de eventos clínicamente relevantes en la población general. Además contribuyen a una utilización más segura y eficiente de los dispositivos sanitarios
Orientación psicopedagóxica e órganos de goberno dos centros públicos
[Resumo] Para que nos centros públicos poidan desenvolverse procesos pedagóxicos que presten atención á diversidade en tódalas súas dimensións e axuden ós alumnos a logra-la necesaria autodirección a partir dun completo autocoñecemento e correspondente dotación e equipamento no que respecta a habilidades sociais e de vida, cómpre que teña lugar nos mesmos unha orientación académica e profesional destinada a tódolos alumnos de conformidade cos pricipios de prevención, desenvolvemento e intervención no contexto social. Segundo datos recollidos recentemente dunha mostra de profesores titores de centros de Galicia, que deberán ser analizados con maior profundidade no futuro, pódese dicir que levar adiante un modelo de orientación como o que se propugna na lexislación vixente, non é algo que poida ser realidade únicamente coa encomenda dunha serie de funcións orientadoras ós Departamentos de Orientación, Xefes dos mesmos e titores, para que así se desenvolvan diferentes actividades de ámbito orientador que virían a engadirse ás que tradicionalmente están a face-los docentes. Introduci-la orientación nos centros conforme ó modelo de servicios internos actuando por programas, aínda que conten para facelo con apoios externos (EOE), esixe que os seus órganos de gobemo, asumindo os principios da orientación psicopedagóxica, se impliquen no deseño, aplicación e avaliación de proxectos ben dotados de contido orientador, xa que se ve como un modo totalmente acorde ca actual perfil organizativo dos centros, que desde logo contén as maiores posibilidades para que os alumnos, conforme ás súas potencialidades, melloren en materia de estratexias de aprendizaxe, hábitos de estudio, utocoñecemento, coñecemento das profesións, autoestima, habilidades sociais, de vida e de toma de decisións para a elección profesiona
Carcinoma of the cervix – risk factors, prevention, diagnosis and treatment
O câncer de colo uterino é o segundo tipo de câncer mais frequente entre as mulheresde todo o mundo e também no Brasil. Sua maior incidência se dá em mulheres entre45 e 49 anos de idade e estima-se que o rastreamento sistemático e o tratamento de lesõesprecursoras possam reduzir a mortalidade pela doença em até 80%. O principal fator de riscoé a infecção pelo Papiloma Vírus Humano (HPV) e já foram desenvolvidas vacinas contra osprincipais tipos oncogênicos do vírus. A redução da mortalidade decorrente dessa doençadepende da adoção de medidas de prevenção primária, de diagnóstico e tratamento de lesõesprecursoras bem como do diagnóstico e tratamento adequados das lesões invasivas.The cervical cancer is the second leading cause of cancer between womenaround the world, as in Brazil. The highest incidence is in women aged 45-49 years and themortality can be reduced by 80% with the systematic screening and treatment of precursorlesions. Human papillomavirus is the major risk factor and vaccines were recent developed.Strategies to reduction of cervical cancer mortality include prevention measures, diagnosis andtreatment of early and invasive lesions
Assessment of morbidity in gynaecologic oncology laparoscopy and identification of possible risk factors
BACKGROUND: The aim of this study was to ascertain the incidence of and the risk factors associated with morbidity in laparoscopy performed on patients with cervical cancer and endometrial cancer. METHODS: This was an observational study of a cohort of 128 women, 89 with endometrial cancer and 39 with cervical cancer from January 2000 to December 2011. We used the Student's t-test or the Mann-Whitney U test for continuous variables, and the Chi-square or Fisher's exact test for categorical variables. RESULTS: Complications were found in 44 patients (34.4%). After a multivariate analysis, among the risk factors associated with the presence of complications as the only type of surgery was found to be statistically significant (p = 0.043), more frequent in the most complex procedures such as Wertheim operation, trachelectomy, and para-aortic lymphadenectomy. Type of surgery (p = 0.003) and tumour type (p = 0.003) were risk factors associated with conversion to laparotomy. It was more frequent among the most complex procedures and cervical cancer cases. Regarding the need for transfusion, significant differences were observed in terms of surgery duration (p < 0.001), more frequent in longer surgery. CONCLUSION: Morbidity in laparoscopic surgical oncology is related to the surgery complexity, where the basal characteristics of the patient are not a factor of influence in the development of complications
Homologous recombination deficiency in ovarian cancer: a review of its epidemiology and management
Ovarian cancer patients with homologous recombination deficiencies exhibit specific clinical behaviors, and improved responses to treatments, such as platinum-based chemotherapy and poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibitors, have been observed. Germline mutations in the BRCA 1/2 genes are the most well-known mechanisms of homologous recombination deficiency. However, other mechanisms, such as germline and somatic mutations in other homologous recombination genes and epigenetic modifications, have also been implicated in homologous recombination deficiency. The epidemiology and implications of these other mechanisms need to be better understood to improve the treatment strategies for these patients. Furthermore, an evaluation of various diagnostic tests to investigate homologous recombination deficiency is essential. Comprehension of the role of homologous recombination deficiency in ovarian cancer also allows the development of therapeutic combinations that can improve the efficacy of treatment. In this review, we discuss the epidemiology and management of homologous recombination deficiency in ovarian cancer patients
Stafne?s bone defect in a metastatic prostate cancer patient : a diagnostic conundrum
Stafne?s bone defect (SBD) is an uncommon bone alteration that affects the mandible and usually presents as an asymptomatic radiolucency located in the posterior region of body or angle of the mandible, below the alveolar canal. Although clinical and radiographic features are more often sufficient for the diagnosis, other lesions and bone alterations have been described in the differential diagnosis and may lead to a misinterpretation and an incorrect diagnosis. Herein, we report a case of an 89-yearold man with metastatic prostate cancer to multiple bones, presenting an asymptomatic solitary well-defined radiolucent image on the right side of the posterior body of the mandible, in close contact with its inferior border. A bone depression was confirmed by computed tomography scans of the mandible and a metastatic inclusion was ruled out by bone scintigraphy with a final diagnosis of SBD. The aim of this report was to highlight the importance of differentiating SBD from metastases in cancer patients and to reinforce the usefulness of multiple imaging modalities in the differential diagnosis of SBD
The role of p21Waf 1/CIP1 as a Cip/Kip type cell-cycle regulator in oral squamous cell carcinoma: review
Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC) is biologically characterized by the accumulation of multiple genetic and
molecular alterations that end up clinically characterized as a malignant neoplasm through a phenomenon known
as multistep. The members of the Cip/Kip family, specifically p21
Waf 1/CIP1
, are responsible for cell cycle control,
blocking the transition from phase G1 to phase S. We made a search of articles of peer-reviewed Journals in
PubMed/ Medline, crossing the keywords. The goal of this paper is to determine the relationship between p21
Waf 1/
CIP1
expression and several clinical and pathological aspects of OSCC, their relationship with p53 and HPV, as well
as genetic alterations in their expression pattern, their use as a prognosis market in the evolution of precancer
-
ous lesions and their roles in anticancer treatments. The results of p21
WA F1/C I P1
expression in OSCC showed mixed
results in terms of positivity/negativity throughout different studies. It seems that, although p21
Waf 1/CIP1
expression
is controlled in a p53-dependent manner, coexpression of both in OSCC is not intrinsically related. Although the
presence of HPV viral oncoproteins increases p21
Waf 1/CIP1
levels, the small number of studies, have forced us to
disregard the hypothesis that HPV infected lesions that present better prognosis are due to a p21
Waf 1/CIP1
-dependent
control. The role of p21
WA F1/C I P1
as cell-cycle regulator has been well described; however, its relationship to OSCC, the clinical and pathological variables of tumors, HPV and different treatments are not entirely clear. Thus, it would
be very interesting to pursue further study of this protein, which may have a significant value for the diagnosis, prog
nosis and therapy of this type of tumors
Quantitative determination of c-myc facilitates the assessment of prognosis of OSCC patients
Myc genes are a family of proto-oncogenes whose proteins are implicated in the regulation of cell proliferation, differentiation and apoptosis, and in regulating the activity of genes involved in cell division. The aim of the present study was to establish a quantitative description of the expression of c-myc and evaluate its relationship with other clinical and prognostic factors, as well as to establish a multivariate survival prediction model. This is a retrospective study of 68 patients diagnosed with oral squamous cell carcinoma (OSCC). We constructed a tissue microarray for investigating the expression of c-myc by immunohistochemistry. Statistical analyses were carried out, and a multivariate model that predicts survival was established. The average expression of c-myc was 50.32 (SD, 26.05) with a range from 6.60 to 99.48; similar for initial and advanced tumor stages. Non-smoking patients had higher levels of c-myc, showing statistically significant differences (Kruskal-Wallis chi2=5.975; p=0.05). We found no statistically significant relationship between the quantitative expression of c-myc and any other clinical or pathological parameters. For each unit of increase of c-myc, the risk increased by 1.15 (p<0.001; HR, 1.150; 95% CI, 1062-1245). Further study of this protein, which may have a significant diagnostic, prognostic and therapeutic value is warranted. Its determination can be valuable when used together with other markers to assess the prognosis of OSCC patients
Insulin resistance (HOMA-IR) cut-off values and the metabolic syndrome in a general adult population: effect of gender and age: EPIRCE cross-sectional study
Background: Insulin resistance has been associated with metabolic and hemodynamic alterations and higher cardio metabolic risk. There is great variability in the threshold homeostasis model assessment of insulin resistance (HOMA-IR) levels to define insulin resistance. The purpose of this study was to describe the influence of age and gender in the estimation of HOMA-IR optimal cut-off values to identify subjects with higher cardio metabolic risk in a general adult population.
Methods: It included 2459 adults (range 20-92 years, 58.4% women) in a random Spanish population sample. As an accurate indicator of cardio metabolic risk, Metabolic Syndrome (MetS), both by International Diabetes Federation criteria and by Adult Treatment Panel III criteria, were used. The effect of age was analyzed in individuals with and without diabetes mellitus separately. ROC regression methodology was used to evaluate the effect of age on HOMA-IR performance in classifying cardio metabolic risk.
Results: In Spanish population the threshold value of HOMA-IR drops from 3.46 using 90th percentile criteria to 2.05 taking into account of MetS components. In non-diabetic women, but no in men, we found a significant non-linear effect of age on the accuracy of HOMA-IR. In non-diabetic men, the cut-off values were 1.85. All values are between 70th-75th percentiles of HOMA-IR levels in adult Spanish population.
Conclusions: The consideration of the cardio metabolic risk to establish the cut-off points of HOMA-IR, to define insulin resistance instead of using a percentile of the population distribution, would increase its clinical utility in identifying those patients in whom the presence of multiple metabolic risk factors imparts an increased metabolic and cardiovascular risk. The threshold levels must be modified by age in non-diabetic women
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