18 research outputs found

    Predicting biotic interactions and their variability in a changing environment

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    International audienceGlobal environmental change is altering the patterns of biodiversity worldwide. Observation and theory suggest that species' distributions and abundances depend on a suite of processes, notably abiotic filtering and biotic interactions, both of which are constrained by species' phylogenetic history. Models predicting species distribution have historically mostly considered abiotic filtering and are only starting to integrate biotic interaction. However, using information on present interactions to forecast the future of biodiversity supposes that biotic interactions will not change when species are confronted with new environments. Using bacterial microcosms, we illustrate how biotic interactions can vary along an environmental gradient and how this variability can depend on the phylogenetic distance between interacting species

    Evaluación geotécnica para la construcción de la presa Huanzo

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    TesisEsta investigación trata de la evaluación geotécnica de la zona de emplazamiento y material de préstamo para una presa de tierra cuyo almacenamiento es con fines de irrigación y con una capacidad de almacenamiento de 13’000,000 m 3 . El área de estudio se localiza en el distrito de Santiago de Lucanamarca, provincia de Huancasancos, departamento de Ayacucho. Los objetivos de la investigación son: caracterizar los parámetros geotécnicos, análisis de estabilidad de talud de la presa, infiltración en el cuerpo y lugar de desplante de presa, en los cuales se realizaron trabajos de exploración geotécnica tales como mapeo geológico local, prospección geofísica, perforaciones diamantinas, excavación de calicatas, ensayos in situ de permeabilidad, ensayos de laboratorio y determinar el diseño de la geometría apropiado para la construcción de la presa. La metodología empleada es el cuantitativo, además de descriptivo, las técnicas de estudio conciernen a actividades de campo, laboratorio y gabinete con el fin de cuantificar los parámetros geotécnicos. Geológicamente el área presenta terrenos morrénicos (arenas limosas con bloques y material aluvial). Geomorfológicamente presenta relieves de pendiente suave a poco empinados. Los parámetros geotécnicos del cuerpo de presa corresponden a una clasificación SUCS arena limosa con gravas (SMGM), su resistencia corresponde a un ángulo de fricción 42.4º, cohesión 0.36 kg/cm 2 y una permeabilidad promedio de 4.44xE-5 cm/s. Para el presente caso, el diseño de presa es: 12 m. de altura, 5 m. de coronación, taludes 1V/2H aguas arriba, 1V/1.8H aguas abajo, con un filtro horizontal de 15 m. Los parámetros geotécnicos para el lugar de cimentacion son: clasificación SUCS arena limosa (SM), la resistencia corresponde a una cohesión de 0.34 Kg/ cm 2 , ángulo de fricción 33.7° y una permehabilidad de 7.96E05 cm/s. Se hará un tratamiento con geosintético en la pantalla aguas arriba y tres líneas de inyecciones de cemento en el pie del talud aguas arriba. Se obtuvieron parámetros geotécnicos apropiados para su construcción, por lo cual la presa es estable debido a los factores de seguridad obtenidos; aguas arriba 2.181, aguas abajo 1.713 y para un desembalse rápido 1.416, utilizando el coeficiente sísmico 0.22 g. La infiltración obtenida con el tratamiento en la sección del eje de presa se redujo de 0.38 m 3 /hora a 0.11 m 3 /hora, en la zona del pie de talud aguas arriba se redujo de 0.43 m 3 /hora a 0.15 m 3 /hora

    Results of polyculture experiment

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    Measurements of OD and fluorescence intensity in the polyculture experiment. Column names represent: Raw data Number, Microplate Row, Microplate Column, Content (Blank/Treatment ID), Raw Optical Density (OD), Corrected optical density (OD), Raw fluorescence intensity,Corrected fluorescence intensity, Time, Strain, Replicate, Salinity leve

    APE-type non-LTR retrotransposons of multicellular organisms encode virus-like 2A oligopeptide sequences, which mediate translational recoding during protein synthesis

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    2A oligopeptide sequences (“2As”) mediate a cotranslational recoding event termed “ribosome skipping.” Previously we demonstrated the activity of 2As (and “2A-like sequences”) within a wide range of animal RNA virus genomes and non-long terminal repeat retrotransposons (non-LTRs) in the genomes of the unicellular organisms Trypanosoma brucei (Ingi) and T. cruzi (L1Tc). Here, we report the presence of 2A-like sequences in the genomes of a wide range of multicellular organisms and, as in the trypanosome genomes, within non-LTR retrotransposons (non-LTRs)—clustering in the Rex1, Crack, L2, L2A, and CR1 clades, in addition to Ingi. These 2A-like sequences were tested for translational recoding activity, and highly active sequences were found within the Rex1, L2, CR1, and Ingi clades. The presence of 2A-like sequences within non-LTRs may not only represent a method of controlling protein biogenesis but also shows some correlation with such apurinic/apyrimidinic DNA endonuclease-type non-LTRs encoding one, rather than two, open reading frames (ORFs). Interestingly, such non-LTRs cluster with closely related elements lacking 2A-like recoding elements but retaining ORF1. Taken together, these observations suggest that acquisition of 2A-like translational recoding sequences may have played a role in the evolution of these elements.Publisher PDFPeer reviewe

    Results of monoculture experiment

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    Measurements of OD and fluorescence intensity in the monoculture experiment for 12 bacterial strains. Column names represent: Raw data Number, Microplate Row, Microplate Column, Content (Blank/Treatment ID), Raw Optical Density (OD), Corrected optical density (OD), Raw fluorescence intensity,Corrected fluorescence intensity, Time, Strain, Replicate, Salinity leve
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