Complex Portal 2022:New curation frontiers

International audienceThe Complex Portal (www.ebi.ac.uk/complexportal) is a manually curated, encyclopaedic database of macromolecular complexes with known function from a range of model organisms. It summarizes complex composition, topology and function along with links to a large range of domain-specific resources (i.e. wwPDB, EMDB and Reactome). Since the last update in 2019, we have produced a first draft complexome for Escherichia coli, maintained and updated that of Saccharomyces cerevisiae, added over 40 coronavirus complexes and increased the human complexome to over 1100 complexes that include approximately 200 complexes that act as targets for viral proteins or are part of the immune system. The display of protein features in ComplexViewer has been improved and the participant table is now colour-coordinated with the nodes in ComplexViewer. Community collaboration has expanded, for example by contributing to an analysis of putative transcription cofactors and providing data accessible to semantic web tools through Wikidata which is now populated with manually curated Complex Portal content through a new bot. Our data license is now CC0 to encourage data reuse. Users are encouraged to get in touch, provide us with feedback and send curation requests through the ‘Support’ link

Degeneração macular relacionada à idade: uma visão geral e atualizações: Age-related macular degeneration: an overview and updates

A degeneração macular relacionada à idade é um importante problema de saúde pública mundial, sendo o principal distúrbio ocular causador de cegueira entre a população idosa.  O objetivo desse estudo foi analisar de forma geral os principais aspectos atuais relacionados à degeneração macular relacionada à idade e para a sua confecção, foram realizadas buscas em bases de dados e selecionados inicialmente 22 artigos, dentre os quais 13 se enquadraram nos critérios pré-estabelecidos. A doença afeta a mácula, região central da retina, responsável pela acuidade visual e pela visão em cores, e seu desenvolvimento está associado a fatores ambientais, genéticos e metabólicos. A degeneração macular relacionada à idade se divide em forma seca ou atrófica e úmida ou exsudativa ou neovascular. Para a forma seca, ainda não há consenso de manejo terapêutico, visto que uma vez instalada a atrofia observada na doença, não há reversão, sendo seu manejo focado principalmente no retardo da progressão para a forma úmida da doença. Agentes anti-VEGF foram amplamente estudados no tratamento da forma exsudativa, sendo que sua aplicação mensal, a cada dois ou a cada três meses demonstrou resultados positivos na melhora da acuidade visual. Novos estudos clínicos ainda estão sendo conduzidos e espera-se obter novas formas de terapias para um melhor prognóstico da doença num futuro próximo

A influência da síndrome de ovários policísticos e síndrome metabólica na escolha do tipo de parto: revisão de literatura

Introduction: Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) and Metabolic Syndrome (MS) are interconnected through various physiological pathways, and their coexistence may have significant implications, especially during pregnancy and the childbirth process. During pregnancy, women with PCOS and MS may face an increased risk of obstetric complications. Regarding the impact on childbirth, PCOS and MS can influence the choice of the type of delivery. Methodology: This work constitutes a literature review, following the systematization with the five pillars described below. 1) Problem statement: "What is the influence of PCOS and MS on the choice of the type of delivery?". 2) Relevant studies were identified using the PUBMED platform with the descriptors "Metabolic Syndrome, Polycystic Ovary Syndrome, Parturition, Pregnancy," PUBMED all in accordance with MESH. 3) Initially, 11 studies were selected; 4 were discarded after a thorough reading as they did not contribute to the problem statement. 4) Data extraction was performed using a text editing program. 5) Experts were consulted. Results: The studies revealed that PCOS and MS are associated with a clinically significant increase in the risk of complications during pregnancy compared to control groups. Additionally, there is a 3 to 4 times higher likelihood of developing pregnancy-induced hypertension and preeclampsia, a threefold increase in the risk of gestational diabetes, and a twofold likelihood of premature birth. The elevated obstetric risk for women with PCOS is reflected in a higher rate of spontaneous abortion. Moreover, it was observed that, compared to the general population, PCOS and MS are more associated with cesarean delivery. Conclusion: Cesarean delivery is predominant in patients with PCOS and MS. Furthermore, there is a higher risk of developing pregnancy-induced hypertension, preeclampsia, and premature birth.Introdução: A síndrome dos ovários policísticos (SOP) e a síndrome metabólica (SM) estão interligadas por várias vias físicas, e sua coexistência pode ter implicações significativas, especialmente durante a gravidez e no processo de parto. Durante a gravidez, as mulheres SOP e SM podem enfrentar um risco aumentado de complicações obstétricas. Quanto ao impacto no parto, a SOP e a SM podem influenciar a escolha do tipo de parto Metodologia: Este trabalho trata-se de uma revisão de literatura, de acordo com a sistematização com os 5 pilares descritos a seguir. 1) Questão problema: “Qual a influência da SOP e SM na escolha do tipo de parto?”. 2) Estudos relevantes foram identificados utilizando na plataforma PUBMED os descritores “Metabolic Syndrome, Polycystic Ovary Syndrome, Parturition, Pregnancy”, na PUBMED, todos de acordo com MESH. 3) 11 estudos foram selecionados inicialmente, 4 foram descartados mediante leitura completa por não contribuir com a questão problema. 4) A extração de dados foi realizada em um programa de edição de texto. 5) Especialistas foram consultados.  Resultado: Os estudos revelaram que a SOP e SM estão associadas a um aumento clinicamente significativo no risco de complicações durante a gravidez, em comparação com os grupos de controle. Além disso, há uma probabilidade de 3 a 4 vezes maior de desenvolver hipertensão causada pela gravidez e pré-eclâmpsia, um aumento de 3 vezes sem risco de diabetes gestacional e uma probabilidade duas vezes maior de parto prematuro. O risco obstétrico elevado para mulheres com SOP se reflete em uma maior taxa de aborto espontâneo. Diante disso, observou-se que em relação a população em geral, SOP e SM associam-se mais com o parto cesariano. Conclusão: O parto cesariano é predominante em pacientes com SOP e SM. Além disso, há maior risco de desenvolver hipertensão causada pela gravidez, pré-eclâmpsia e parto prematuro

Síndrome de DiGeorge (deleção do cromossomo 22q11.2): manejo e prognóstico

A síndrome de DiGeorge (SDG), também conhecida como síndrome velocardiofacial, é uma condição neurogenética autossômica dominante de interesse global caracterizada pela microdeleção do cromossomo 22q11.2, na qual não há predileção por gênero ou raça. A doença é conhecida pela tríade clássica as cardiopatias congênitas, timo hipoplásico – ou aplásico – e hipocalcemia decorrente da hipoplasia paratireoidiana O diagnóstico da síndrome baseia-se em dois exames laboratoriais, a Hibridização Genômica Comparativa baseada em microarray (aCGH) e a Hibridização por Fluorescência in situ (FISH), ambas com a finalidade de investigar o distúrbio genético e o tratamento consiste em tratar as alterações decorrentes da patologia. O objetivo estudo é analisar o manejo e o prognóstico da síndrome de DiGeorge por meio de um apanhado de casos clínicos. Trata-se de uma revisão bibliográfica integrativa, de natureza quantitativa, que utilizou as plataformas PubMed (Medline), Scientific Eletronic Library On-line (SciELO) e Cochrane Library como bases de dados para a seleção dos artigos, todos na língua inglesa. Foram utilizadas literaturas publicadas com recorte temporal de 2017 a 2022. De acordo com as literaturas analisadas, foi observado que a SDG requer diligência por parte dos profissionais da saúde no que concerne ao seu manejo, vide os vários fenótipos, desde leves a graves, da patologia. Por ter envolvimento multissistêmico, é essencial que, mesmo antes do diagnóstico, os distúrbios inerentes à síndrome sejam tratados e sujeitos à suspeição por intermédio da equipe, a qual necessita ter conhecimento acerca dessa possibilidade, haja vista a eventualidade de um pior prognóstico aos pacientes portadores

Revealing metastatic castration‐resistant prostate cancer master regulator through lncRNAs‐centered regulatory network

Abstract Background Metastatic castration‐resistant prostate cancer (mCRPC) is an aggressive form of cancer unresponsive to androgen deprivation therapy (ADT) that spreads quickly to other organs. Despite reduced androgen levels after ADT, mCRPC development and lethality continues to be conducted by the androgen receptor (AR) axis. The maintenance of AR signaling in mCRPC is a result of AR alterations, androgen intratumoral production, and the action of regulatory elements, such as noncoding RNAs (ncRNAs). ncRNAs are key elements in cancer signaling, acting in tumor growth, metabolic reprogramming, and tumor progression. In prostate cancer (PCa), the ncRNAs have been reported to be associated with AR expression, PCa proliferation, and castration resistance. In this study, we aimed to reconstruct the lncRNA‐centered regulatory network of mCRPC and identify the lncRNAs which act as master regulators (MRs). Methods We used publicly available RNA‐sequencing to infer the regulatory network of lncRNAs in mCRPC. Five gene signatures were employed to conduct the master regulator analysis. Inferred MRs were then subjected to functional enrichment and symbolic regression modeling. The latter approach was applied to identify the lncRNAs with greater predictive capacity and potential as a biomarker in mCRPC. Results We identified 31 lncRNAs involved in cellular proliferation, tumor metabolism, and invasion‐metastasis cascade. SNHG18 and HELLPAR were the highlights of our results. SNHG18 was downregulated in mCRPC and enriched to metastasis signatures. It accurately distinguished both mCRPC and primary CRPC from normal tissue and was associated with epithelial–mesenchymal transition (EMT) and cell‐matrix adhesion pathways. HELLPAR consistently distinguished mCRPC from primary CRPC and normal tissue using only its expression. Conclusion Our results contribute to understanding the regulatory behavior of lncRNAs in mCRPC and indicate SNHG18 and HELLPAR as master regulators and potential new diagnostic targets in this tumor

Ética e Profissionalismo nas Redes Sociais: Comportamentos On-Line de Estudantes de Medicina

RESUMO Novo tipo de relação entre médicos e pacientes vem surgindo após a expansão e abrangência das redes sociais. Assim, é necessário rever aspectos da formação de estudantes de Medicina, além de avaliar os benefícios e riscos da utilização dessas redes, no intuito de preservar a confiança e cumplicidade na relação médico-paciente. Objetivos: Descrever o comportamento on-line de estudantes de Medicina, bem como suas opiniões sobre o uso de redes sociais, além de conhecer aspectos da formação médica sobre ética e profissionalismo. Métodos: Estudo transversal realizado em hospitais de ensino de três escolas médicas em Recife (PE) entre 2015 e 2016. Um questionário autoaplicável elaborado pelos pesquisadores foi respondido por 260 estudantes de Medicina dos dois últimos anos do curso (internato). Ao mesmo tempo, os planos de ensino de cada instituição foram analisados separadamente. Os dados obtidos foram analisados por meio dos testes estatísticos Qui-Quadrado de Pearson, teste Exato de Fisher, Kruskal-Wallis e McNemar. Para a parte do questionário do tipo escala Likert foi calculado o ranking médio das respostas dos participantes, assim como o Alpha de Cronbach. O projeto foi submetido à apreciação ética com posterior aprovação e todos os participantes concordaram com o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido. Resultados: Entre os estudantes, 41,5% (108) afirmaram ter postado fotos ou vídeos mostrando consumo de bebidas alcoólicas ou cigarro e 32,3% (84) postaram fotos ou vídeos com pacientes em rede social. Foi observada diferença estatisticamente significativa (p<0,001) entre as instituições pesquisadas quanto à postagem de fotos ou vídeos com pacientes, uma vez que os estudantes da instituição III relataram menor postagem (14,3% ou 12 participantes). Na análise das respostas dos estudantes das três instituições, foi observada relação de tendência inversa entre “postagem de fotos ou vídeos com pacientes” e “abordagem de profissionalismo on-line na graduação”. Na instituição III, onde menor quantidade de estudantes relatou postagens em rede social com pacientes, maior quantidade deles relatou abordagem de questões sobre profissionalismo on-line na graduação (26,2% ou 22 participantes). Entre os pesquisados, 79% (205) concordaram em que certos conteúdos do perfil pessoal do Facebook do médico podem difamar a reputação deste. Em relação à abordagem de questões sobre profissionalismo on-line na graduação médica, 80,8% (210) dos participantes disseram que não tiveram essa abordagem. Na análise dos planos de ensino, apenas a instituição III apresentou um eixo curricular de desenvolvimento profissional e abordagem teórica formal sobre conceitos de ética durante o internato. Conclusão: Um número expressivo de estudantes pesquisados teve comportamentos contrários ao preconizado pelo Código de Ética Médica, resoluções do Conselho Federal de Medicina e guidelines estrangeiras de comportamento em rede social. É possível que a abordagem do profissionalismo e da ética na formação acadêmica tenha repercussão nos comportamentos de estudantes de Medicina na rede social. Estudos que poderiam estabelecer relação de causa e efeito são necessários para confirmar se há relação entre comportamentos on-line de estudantes e abordagem de ética e profissionalismo na graduação. Por fim, observa-se, nas escolas médicas pesquisadas, escassez da abordagem do tema profissionalismo on-line

<i>Hibiscus acetosella</i>: An Unconventional Alternative Edible Flower Rich in Bioactive Compounds

The interest in the consumption of edible flowers has increased since they represent a rich source of bioactive compounds, which are significantly beneficial to human health. The objective of this research was to access the bioactive compounds and antioxidant and cytotoxic properties of unconventional alternative edible flowers of Hibiscus acetosella Welw. Ex Hiern. The edible flowers presented pH value of 2.8 ± 0.00, soluble solids content of 3.4 ± 0.0 °Brix, high moisture content of about 91.8 ± 0.3%, carbohydrates (6.9 ± 1.2%), lipids (0.90 ± 0.17%), ashes (0.4 ± 0.0%), and not detectable protein. The evaluation of the scavenging activity of free radicals, such as 2,2-diphenyl-1-picryl-hydrazyl (DPPH) and 2,2′-azinobis-(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS), of the flower extract was better than the results observed for other edible flowers (507.8 ± 2.7 μM TE and 783.9 ± 30.8 μM TE, respectively) as well as the total phenolic composition (TPC) value (568.8 ± 0.8 mg GAE/g). These flowers are rich in organic acids and phenolic compounds, mainly myricetin, and quercetin derivatives, kaempferol, and anthocyanins. The extract showed no cytotoxicity for the cell lineages used, suggesting that the extract has no directly harmful effects to cells. The important bioactive compound identified in this study makes this flower especially relevant in the healthy food area due to its nutraceutical potential without showing cytotoxicity

Seminário de Dissertação (2024)

Página da disciplina de Seminário de Dissertação (MPPP, UFPE, 2022) Lista de participantes == https://docs.google.com/spreadsheets/d/1mrULe1y04yPxHUBaF50jhaM1OY8QYJ3zva4N4yvm198/edit#gid=