21 research outputs found

    El conflicto de interés en la investigación científica

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    N/DFil: Carobene, Mauricio. Consejo Nacional de Invest.cientif.y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomedicas En Retrovirus y Sida; Argentina

    HIV-1 BF intersubtype recombinant Vpu second alpha helix plays an important role in the viral release and BST-2 degradation

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    We previously reported a naturally occurring BF intersubtype recombinant Vpu variant with augmented capacity to enhance viral replication. Structural analysis of this variant revealed that its transmembrane domain (TMD) and α-helix I in the cytoplasmic domain (CTD) corresponded to subtype B, whereas CTD α-helix II corresponded to subtype F1. This work was aimed at evaluating the role of Vpu CTD α-helix II domain on viral release enhancement and down-modulation of BST-2 and CD4 from cell surface. In addition, as serine residues in either Vpu amino acid positions 61 or 64 have been shown to regulate Vpu intracellular half-life, which in turn could influence the magnitude of viral release, we also studied the impact of these residues in the BF Vpu functions, since S61 and S64 are infrequently found among BF recombinant Vpu variants. Our results showed that interchange of Vpu α-helix II between subtypes (B→F) directly correlated with enhancement of viral release and, to a lesser extent, with changes in the capacity to down-modulate BST-2 and CD4 of the resulting chimera. No statistical differences on viral release and BST-2 down-modulation were observed between Vpu BF and VpuBF E61S. On the other hand, VpuBF A64S showed a slightly reduced capacity to enhance viral production but was modestly more efficient than VpuBF in down-modulating BST-2. In summary, our observations clearly evidence that α-helix II is actively involved in Vpu viral release-promoting activity, and that intersubtype recombination between subtypes B and F1 originated a protein variant with higher potential to boost the spread of the recombinant strain that harbors it.Fil: de Candia, Cristian Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina;Fil: Espada, Constanza Eleonora. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiologia. Centro Nacional de Referencia del Sida; Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina;Fil: Duette, Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina; Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina;Fil: Salomon, Horacio Eduardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina; Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina;Fil: Carobene, Mauricio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiologia. Centro Nacional de Referencia del Sida; Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina

    In vitro dynamics of HIV-1 BF intersubtype recombinants genomic regions involved in the regulation of gene expression

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    HIV-1 intersubtype recombination is a very common phenomenon that has been shown to frequently affect different viral genomic regions. Vpr and Tat are viral proteins known to interact with viral promoter (LTR) during the replication cycle. This interaction is mainly involved in the regulation of viral gene expression, so, any structural changes in the LTR and/or these regulatory proteins may have an important impact on viral replication and spread. It has been reported that these genetic structures underwent recombination in BF variants widely spread in South America. To gain more insight of the consequences of the BF intersubtype recombination phenomenon on these different but functionally related genomic regions we designed and performed and in vitro study that allowed the detection and recovery of intersubtype recombinants sequences and its subsequent analysis. Our results indicate that recombination affects differentially these regions, showing evidence of a time-space relationship between the changes observed in the viral promoter and the ones observed in the Vpr/Tat coding region. This supports the idea of intersubtype recombination as a mechanism that promotes biological adaptation and compensates fitness variations

    Higher transactivation activity associated with LTR and Tat elements from HIV-1 BF intersubtype recombinant variants

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    BACKGROUND: HIV-1 is characterized by its rapid genetic evolution and high diversity as a consequence of its error-prone reverse transcriptase and genetic recombination. This latter mechanism is responsible for the creation of circulating recombinant forms (CRFs) found in nature. Previous studies from our lab group have shown that the epidemic in Argentina is characterized by one highly prevalent circulating recombinant form, CRF12_BF, and many related BF recombinant forms. Since transcriptional transactivation of the HIV-1 long terminal repeat (LTR) promoter element requires the essential viral Tat protein, since these genetic structures underwent recombination in variants widely spread in South America, the aim of this work was to study transcriptional activity associated with the recombinant LTR and Tat elements. RESULTS: Differential transcriptional activity was measured for the BF recombinant LTR/Tat complex that is present in widely spread viral variants was demonstrated. This analysis demonstrated a higher activity for the BF complex when compared to its B subtype counterpart. CONCLUSION: This study indicates structural and functional consequences of recombination events within the LTR promoter and Tat transactivator protein of a naturally occurring HIV-1 recombinant form

    Viral replication is enhanced by an HIV-1 intersubtype recombination-derived Vpu protein

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    Background: Multiple HIV-1 intersubtype recombinants have been identified in human populations. Previous studies from our lab group have shown that the epidemic in Argentina is characterized by the high prevalence of a circulating recombinant form, CRF12_BF, and many related BF recombinant forms. In these genomic structures a recombination breakpoint frequently involved the vpu coding region. Due to the scarce knowledge of Vpu participation in the virion release process and its impact on pathogenesis and of the functional capacities of intersubtype recombinant Vpu proteins, the aim of this work was to perform a comparative analysis on virion release capacity and relative replication capacity among viral variants harboring either a BF recombinant Vpu or a subtype B Vpu. Results: Our results showed that BF recombinant Vpu was associated to an increased viral particles production when compared to WT B variant in tetherin-expressing cell lines. This observation was tested in the context of a competition assay between the above mentioned variants. The results showed that the replication of the BF Vpu-harboring variant was more efficient in cell cultures than subtype B, reaching a higher frequency in the viral population in a short period of time. Conclusion: This study showed that as a result of intersubtype recombination, a structurally re-organized HIV-1 Vpu has an improved in vitro capacity of enhancing viral replication, and provides evidence of the changes occurring in this protein function that could play an important role in the successful spread of intersubtype recombinant variants.Fil: de Candia, Cristian Ariel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia Para El Sida; ArgentinaFil: Espada, Constanza Eleonora. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia Para El Sida; ArgentinaFil: Duette, Gabriel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia para el Sida; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Ghiglione, Yanina Alexandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia para el Sida; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Turk, Gabriela Julia Ana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia para el Sida; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Salomon, Horacio Eduardo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia para el Sida; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Carobene, Mauricio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología. Centro Nacional de Referencia para el Sida; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

    Infants younger than 6 months old infected by SARS-CoV-2 show the highest respiratory viral loads

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    There is a paucity of reports on the characteristics of SARS-CoV-2 infection in infants, since most studies have grouped infants with older children. We analyzed the viral loads of 45,318 SARS-CoV-2-positive nasopharyngeal swab samples obtained in Buenos Aires, Argentina. Infants younger than 6 months old presented higher viral loads than any other age group. Children older than 6 months showed significantly lower viral loads, similar to those founds in adults. This observation raises new questions regarding the role of infants in the spreading of SARS-CoV-2 infection.Fil: Ochoa, Valeria Pilar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Erra Diaz, Fernando Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Ramirez, Joaquin Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Fentini, María Clara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Carobene, Mauricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Geffner, Jorge Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Arruvito, Maria Lourdes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Remes Lenicov, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentin

    MicroRNAs differentially present in the plasma of HIV elite controllers reduce HIV infection in vitro

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    Elite controllers maintain HIV-1 viral loads below the limit of detection. The mechanisms responsible for this phenomenon are poorly understood. As microRNAs (miRNAs) are regulators of gene expression and some of them modulate HIV infection, we have studied the miRNA profile in plasma from HIV elite controllers and chronically infected individuals and compared against healthy donors. Several miRNAs correlate with CD41 T cell count or with the known time of infection. No significant differences were observed between elite controllers and healthy donors; however, 16 miRNAs were different in the plasma of chronic infected versus healthy donors. In addition, levels of hsa-miR-29b-3p, hsa-miR-33a-5p and hsa-miR-146a-5p were higher in plasma from elite controllers than chronic infected and hsa-miR-29b-3p and hsa-miR-33a-5p overexpression significantly reduced the viral production in MT2 and primary T CD41 cells. Therefore, levels of circulating miRNAs might be of diagnostic and/or prognostic value for HIV infection, and hsa-miR-29b-3p and miR-33a-5p may contribute to the design of new anti-HIV drugs.Fil: Reynoso, Rita Paola. University of Natural Resources and Life Sciences; AustriaFil: Laufer, Natalia Lorna. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Juan A. Fernández"; Argentina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Hackl, Matthias. University of Natural Resources and Life Sciences; Austria. Tamirna Gmbh; AustriaFil: Skalicky, Susanna. Evercyte Gmbh; AustriaFil: Monteforte, Rossella. University of Natural Resources and Life Sciences; AustriaFil: Turk, Gabriela Julia Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Carobene, Mauricio. Universidad de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Quarleri, Jorge Fabian. Universidad de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Cahn, Pedro. Fundación Huésped; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Juan A. Fernández"; ArgentinaFil: Werner, Roland. Medizinische Universitat Innsbruck; AustriaFil: Stoiber, Heribert. Medizinische Univesitat Innsbruck; AustriaFil: Grillari Voglauer, Regina. University of Natural Resources and Life Sciences; Austria. Evercyte Gmbh; AustriaFil: Grillari, Johannes. University of Natural Resources and Life Sciences; Austria. Evercyte Gmbh; Austri

    Cross-protection and cross-neutralization capacity of ancestral and VOC-matched SARS-CoV-2 adenoviral vector-based vaccines

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    COVID-19 vaccines were originally designed based on the ancestral Spike protein, but immune escape of emergent Variants of Concern (VOC) jeopardized their efficacy, warranting variant-proof vaccines. Here, we used preclinical rodent models to establish the cross-protective and cross-neutralizing capacity of adenoviral-vectored vaccines expressing VOC-matched Spike. CoroVaxG.3-D.FR, matched to Delta Plus Spike, displayed the highest levels of nAb to the matched VOC and mismatched variants. Cross-protection against viral infection in aged K18-hACE2 mice showed dramatic differences among the different vaccines. While Delta-targeted vaccines fully protected mice from a challenge with Gamma, a Gamma-based vaccine offered only partial protection to Delta challenge. Administration of CorovaxG.3-D.FR in a prime/boost regimen showed that a booster was able to increase the neutralizing capacity of the sera against all variants and fully protect aged K18-hACE2 mice against Omicron BA.1, as a BA.1-targeted vaccine did. The neutralizing capacity of the sera diminished in all cases against Omicron BA.2 and BA.5. Altogether, the data demonstrate that a booster with a vaccine based on an antigenically distant variant, such as Delta or BA.1, has the potential to protect from a wider range of SARS-CoV-2 lineages, although careful surveillance of breakthrough infections will help to evaluate combination vaccines targeting antigenically divergent variants yet to emerge.Fil: Vinzon, Sabrina Eugenia. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lopez, Maria Veronica. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Cafferata, Eduardo Gustavo Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Soto, Ariadna Soledad. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Berguer, Paula Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Vazquez, Luciana Mariel. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Nusblat, Leonora. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Pontoriero, Andrea. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Belotti, Eduardo Matías. Universidad Nacional del Litoral; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral; ArgentinaFil: Salvetti, Natalia Raquel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral; Argentina. Universidad Nacional del Litoral; ArgentinaFil: Viale, Diego Luis. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vilardo, Ariel E.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Avaro, Martin M.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Benedetti, Estefanía. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Russo, Mara Laura. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dattero, María Elena. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Carobene, Mauricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Sánchez Lamas, Maximiliano. Securitas Bioscienses; UruguayFil: Afonso, Jimena. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Heitrich, Mauro Oscar. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Cristófalo, Alejandro Ezequiel. Universidad Nacional de San Martin. Centro de Rediseño E Ingenieria de Proteinas.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Otero, Lisandro Horacio. Universidad Nacional de San Martin. Centro de Rediseño E Ingenieria de Proteinas.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Baumeister, Elsa. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Ortega, Hugo Hector. Universidad Nacional del Litoral; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Ciencias Veterinarias del Litoral; ArgentinaFil: Edelstein, Alexis. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Podhajcer, Osvaldo Luis. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

    T-Cell Immune Responses Against Env from CRF12_BF and Subtype B HIV-1 Show High Clade-Specificity that Can Be Overridden by Multiclade Immunizations

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    BACKGROUND: The extreme genetic diversity of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) poses a daunting challenge to the generation of an effective AIDS vaccine. In Argentina, the epidemic is characterized by the high prevalence of infections caused by subtype B and BF variants. The aim of this study was to characterize in mice the immunogenic and antigenic properties of the Env protein from CRF12_BF in comparison with clade B, employing prime-boost schemes with the combination of recombinant DNA and vaccinia virus (VV) vectors. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: As determined by ELISPOT from splenocytes of animals immunized with either EnvBF or EnvB antigens, the majority of the cellular responses to Env were found to be clade-specific. A detailed peptide mapping of the responses reveal that when there is cross-reactivity, there are no amino acid changes in the peptide sequence or were minimal and located at the peptide ends. In those cases, analysis of T cell polifunctionality and affinity indicated no differences with respect to the cellular responses found against the original homologous sequence. Significantly, application of a mixed immunization combining both clades (B and BF) induced a broader cellular response, in which the majority of the peptides targeted after the single clade vaccinations generated a positive response. In this group we could also find significant cellular and humoral responses against the whole gp120 protein from subtype B. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: This work has characterized for the first time the immunogenic peptides of certain EnvBF regions, involved in T cell responses. It provides evidence that to improve immune responses to HIV there is a need to combine Env antigens from different clades, highlighting the convenience of the inclusion of BF antigens in future vaccines for geographic regions where these HIV variants circulate
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