Interaction paths promote module integration and network-level robustness of spliceosome to cascading effects

CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPThe functionality of distinct types of protein networks depends on the patterns of protein-protein interactions. A problem to solve is understanding the fragility of protein networks to predict system malfunctioning due to mutations and other errors. Spec8111CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPCONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPsem informação2017/08406-7, 2017/06994-9We thank Ana Paula Assis, Pâmela C. Santana and Leandro Giacobelli for helpful comments. PRG was supported by CNPq and FAPESP (2017/08406-7). PPC was supported by FAPESP (2017/06994-9). MC was supported by a PMP/BS postdoctoral fellowship (UFPR/UNIVALI 4

Evaluating the new ORDHIDEE-GM (Grassland Management) model to tropical area in Brazil.

The elevation on greenhouse gases (GEE) concentration is causing significant changes to the climate, with important economical and social consequences. In Brazil, cattle is under the spotlight both due the magnitude of GEE flow and because of its potential to mitigate emissions, particularly when considering the capacity of carbon sequestration in soils under pastures. On the other hand, cattle may suffer significant impacts with climate change. Forage species, animal breeds and productive systems, previously adapted, may be vulnerable under future scenarios, mainly due to thermal and hydric stress, resulting from adverse climate

Evaluating the new ORDHIDEE-GM (Grassland Management) model to tropical area in Brazil.

The elevation on greenhouse gases (GEE) concentration is causing significant changes to the climate, with important economical and social consequences. In Brazil, cattle is under the spotlight both due the magnitude of GEE flow and because of its potential to mitigate emissions, particularly when considering the capacity of carbon sequestration in soils under pastures. On the other hand, cattle may suffer significant impacts with climate change. Forage species, animal breeds and productive systems, previously adapted, may be vulnerable under future scenarios, mainly due to thermal and hydric stress, resulting from adverse climate

Variação temporal da biomassa do café arábica arborizado e a pleno sol, através de índices de vegetação.

Abstract. In recent years, several works have been accomplished in order to analyze the spectral response of coffee crop fields cultivated in full sun. However, the number of papers related to the monitoring of shaded coffee systems is reduced although this kind of cultivation is very important from the perspective of climate change and agriculture. In addition, the biomass of coffee systems can store carbon, which is a mitigation action. In this context, this paper presents the assessment of the meteorological variation joined with the biomass increase in three different coffee plantation systems: full sun, shaded coffee associated with legumes (SAF), and shaded coffee with Macadamia trees. We used Landsat-5 images from 2004 to 2010, and the NDVI and SAVI indexes. LAI index measured in the test area during all 2009 year. The results showed that the shaded coffee systems presented the NDVI and SAVI indexes with higher values than those found with the system of planting in full sun what corroborates the idea of greater amount of biomass in this type of planting. All indexes present the seasonal rain variation. One month after a large period of drought the indexes NDVI, SAVI and LAI decrease. The NDVI and SAVI indexes presented high correlation with the measured LAI. The shaded coffee system and the full sun coffee reached high vegetation indexes what indicate a high concentration of biomass. This factor should be considered in the decision making process since is important to take advantage of cultivation systems acting as carbon sinks.SBSR 2011

Relações entre a temperatura do ar, a radiação solar e a temperatura das folhas de cafeeiros, em dia com alta nebulosidade.

Com o aumento da temperatura global, as condições climáticas podem se tornar de alto risco para diversas culturas agrícolas em regiões que são atualmente grandes produtoras. Esse é um fato que poderá atingir as regiões tradicionalmente cafeeiras no Brasil, pois alguns estudos indicam que o aumento da temperatura poderá acarretar uma redução de até 33% da área apta cafeeira no país, até 2070. Esse trabalho preliminar procura demonstrar a alta correlação da temperatura do ar e da radiação solar com a temperatura das folhas do cafeeiro. Utilizando-se uma técnica de manejo da cultura, o sombreamento de plantas, obteve-se uma diminuição da temperatura das folhas de até 2oC em comparação com cafeeiros cultivados tradicionalmente a pleno Sol.CBA 2009

Classificação de áreas de café em Minas Gerais por meio do novo algoritmo QMAS em imagem espectral Geoeye-1.

Diante do grande desafio que é classificar imagens de sensoriamento remoto de café, o objetivo deste trabalho foi aplicar o novo algoritmo QMAS para classificar áreas de café comparando os resultados com o método tradicional de Classificação Supervisionada MAXVER, em imagens Geoeye-1. Os resultados indicam que o algoritmo QMAS obteve mais êxito na classificação das áreas de café do que o MAXVER, configurando-se em uma alternativa viável a classificação de imagens de satélite.SBSR 2011

Avaliação do comportamento de cultivares de tomateiro no período chuvoso, em Rondônia.

Resumo do XXVI Congresso Brasileiro de Olericultura, 1986. Resumo 002

Identification of archaeal proteins that affect the exosome function in vitro

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The archaeal exosome is formed by a hexameric RNase PH ring and three RNA binding subunits and has been shown to bind and degrade RNA <it>in vitro</it>. Despite extensive studies on the eukaryotic exosome and on the proteins interacting with this complex, little information is yet available on the identification and function of archaeal exosome regulatory factors.</p> <p>Results</p> <p>Here, we show that the proteins PaSBDS and PaNip7, which bind preferentially to poly-A and AU-rich RNAs, respectively, affect the <it>Pyrococcus abyssi </it>exosome activity <it>in vitro</it>. PaSBDS inhibits slightly degradation of a poly-rA substrate, while PaNip7 strongly inhibits the degradation of poly-A and poly-AU by the exosome. The exosome inhibition by PaNip7 appears to depend at least partially on its interaction with RNA, since mutants of PaNip7 that no longer bind RNA, inhibit the exosome less strongly. We also show that FITC-labeled PaNip7 associates with the exosome in the absence of substrate RNA.</p> <p>Conclusions</p> <p>Given the high structural homology between the archaeal and eukaryotic proteins, the effect of archaeal Nip7 and SBDS on the exosome provides a model for an evolutionarily conserved exosome control mechanism.</p

Análise comparativa do clima atual e futuro para avaliar a expansão da cana-de-açúcar em São Paulo.

O Brasil, o maior produtor mundial de cana-de-açúcar, é responsável por 35% da produção mundial. A produção de cana-de-açúcar se concentra nas regiões Centro-Sul e Nordeste e ocupa cerca de 8 milhões de hectares. A cana-de-açúcar, por apresentar um ciclo semi-perene, é influenciada pela variação das condições meteorológicas durante um ano inteiro. O objetivo do trabalho foi analisar os dados climáticos obtidos pelo modelo Eta (2011 a 2090) e os dados do clima atual (1991 a 2010) verificando suas implicações em relação a expansão da cana-de-açúcar no estado de São Paulo. Foram utilizados dados de precipitação e temperatura média, de 1991 a 2010, de estações meteorológicas de seis municípios de São Paulo. Para representar o cenário futuro (2011 a 2090), foram utilizados dados de precipitação e temperatura média obtidos pelo modelo Eta. A partir do balanço hídrico foi possível calcular a deficiência hídrica e o excedente hídrico para os municípios selecionados com armazenamento de água disponível no solo de 100mm. O balanço hídrico mostrou que haverá um aumento na deficiência hídrica. Com o aumento do período seco e do aumento da temperatura média poderá ocorrer uma queda na produtividade de sacarose da cana-de-açúcar.CBA 2011

Análise dos dados de projeção climática do modelo ETA e suas implicações para a cultura do café arabica.

Extremos de temperatura durante a fase do florescimento do café arábica causam abortamento de flores e perda na produção. Estudos de projeção climática, normalmente baseados em modelos de baixa resolução, já demonstram perdas na produção de café como conseqüência das altas temperaturas. No entanto, esses estudos têm uma menor precisão nas respostas por causa da resolução dos modelos, e novos estudos baseados em modelos de melhor resolução se tornam necessários. Este trabalho apresenta uma análise das implicações dos extremos de temperatura e precipitação na aptidão climática em municípios tradicionalmente produtores de café em Minas Gerais e São Paulo, utilizando o modelo climático Eta (40km de resolução). Primeiramente, as respostas do modelo foram comparadas com os dados climáticos atuais (dados observados). As projeções do modelo Eta foram satisfatórias porque seguem o padrão do clima já existente. Os dados do modelo demonstram um deslocamento do maior déficit hídrico do ano para o mês de setembro. O modelo projeta cenários com aumento de temperaturas, principalmente nos meses de setembro e outubro, que é o florescimento do café, impactando a produção de café arábica