Búsqueda de hits antivirales mediante el diseño racional de fármacos asistido por computadora

El grupo de Química Medicinal del CIBION tiene como objetivo principal llevar a cabo el diseño y la síntesis de pequeñas moléculas bioactivas. Como punto inicial del proceso de descubrimiento de nuevos fármacos, realizamos la búsqueda de moléculas candidatas mediante screening virtual y el diseño de novo. Los compuestos seleccionados son sintetizados y evaluados frente a blancos específicos. Una vez que identificamos las moléculas líderes, llevamos a cabo modificaciones estructurales con el objeto de optimizar la potencia farmacológica mediante docking, SAR, QSAR y FEP. Actualmente, estamos buscando inhibidores contra el virus del dengue (DENV) [1], zika (ZIKV) y chikungunya (CHIKV), diarrea viral bovina (BVDV) [2]. Por otro lado, se están iniciando nuevos estudios enfocados en la encapsulación de compuestos activos, a fin de mejorar las propiedades fisicoquímicas y/o la biodisponibilidad de los candidatos. En particular, se han realizado pruebas de encapsulación de derivados de 2-fenilquinazolinas sustituídas en posición 4, los cuales presentaron con actividad antiviral contra BVDV del orden de 1 µM, con (2-Hydroxipropil)-β-ciclodextrina, obteniendo notorias mejoras en la solubilidad de los compuestos (agua MilliQ). Con respecto a DENV, se están iniciando los estudios de encapsulación utilizando quitosano funcionalizado, a fin de mejorar la biodisponibilidad de castanospermina, empleada como sustrato modelo.Fil: Fernandez, Gabriela Araceli. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Leal, Emilse Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Fidalgo, Daniela Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Adler, Natalia Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Enderle, Ana Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Rosas, Rocio Ayelen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Gallo, Facundo Nahuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaII Jornada de Jóvenes BionanocientíficxsArgentinaCentro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares ErijmanInstituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini

De novo design approaches targeting an envelope protein pocket to identify small molecules against dengue virus

Dengue fever is a mosquito-borne viral disease that has become a major public health concern worldwide. This disease presents with a wide range of clinical manifestations, from a mild cold-like illness to the more serious hemorrhagic dengue fever and dengue shock syndrome. Currently, neither an approved drug nor an effective vaccine for the treatment are available to fight the disease. The envelope protein (E) is a major component of the virion surface. This protein plays a key role during the viral entry process, constituting an attractive target for the development of antiviral drugs. The crystal structure of the E protein reveals the existence of a hydrophobic pocket occupied by the detergent n-octyl-β-d-glucoside (β-OG). This pocket lies at the hinge region between domains I and II and is important for the low pH-triggered conformational rearrangement required for the fusion of the virion with the host's cell. Aiming at the design of novel molecules which bind to E and act as virus entry inhibitors, we undertook a de novo design approach by “growing” molecules inside the hydrophobic site (β-OG). From more than 240000 small-molecules generated, the 2,4 pyrimidine scaffold was selected as the best candidate, from which one synthesized compound displayed micromolar activity. Molecular dynamics-based optimization was performed on this hit, and thirty derivatives were designed in silico, synthesized and evaluated on their capacity to inhibit dengue virus entry into the host cell. Four compounds were found to be potent antiviral compounds in the low-micromolar range. The assessment of drug-like physicochemical and in vitro pharmacokinetic properties revealed that compounds 3e and 3h presented acceptable solubility values and were stable in mouse plasma, simulated gastric fluid, simulated intestinal fluid, and phosphate buffered saline solution.Fil: Leal, Emilse Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Adler, Natalia Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; Argentina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Fernandez, Gabriela Araceli. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Gebhard, Leopoldo German. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Aucar, María Gabriela. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Videla, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Monge, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Hernández de los Ríos, Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Acosta Dávila, John. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Morell, María L.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Cordo, Sandra Myriam. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: García, Cybele C.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Cavasotto, Claudio Norberto. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; Argentina. Universidad Austral; ArgentinaFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; Argentin

Discovery of a Potent and Selective Chikungunya Virus Envelope Protein Inhibitor through Computer-Aided Drug Design

The worldwide expansion of chikungunya virus (CHIKV) into tropical and subtropical areas in the last 15 years has posed a currently unmet need for vaccines and therapeutics. The E2-E1 envelope glycoprotein complex binds receptors on the host cell and promotes membrane fusion during CHIKV entry, thus constituting an attractive target for the development of antiviral drugs. In order to identify CHIKV antivirals acting through inhibition of the envelope glycoprotein complex function, our first approach was to search for amenable druggable sites within the E2-E1 heterodimer. We identified a pocket located in the interface between E2 and E1 around the fusion loop. Then, via a structure-based virtual screening approach and in vitro assay of antiviral activity, we identified compound 7 as a specific inhibitor of CHIKV. Through a lead optimization process, we obtained compound 11 that demonstrated increased antiviral activity and low cytotoxicity (EC50 1.6 μM, CC50 56.0 μM). Molecular dynamics simulations were carried out and described a possible interaction pattern of compound 11 and the E1-E2 dimer that could be useful for further optimization. As expected from target site selection, compound 11 inhibited virus internalization during CHIKV entry. In addition, virus populations resistant to compound 11 included mutation E2-P173S, which mapped to the proposed binding pocket, and second site mutation E1-Y24H. Construction of recombinant viruses showed that these mutations conferred antiviral resistance in the parental background. Finally, compound 11 presents acceptable solubility values and is chemically and enzymatically stable in different media. Altogether, these findings uncover a suitable pocket for the design of CHIKV entry inhibitors with promising antiviral activity and pharmacological profiles.Fil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Fidalgo, Daniela Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Alvarez, Diego Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); ArgentinaFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; Argentin

Rainbow trout adaptation to a warmer Patagonia and its potential to increase temperature tolerance in cultured stocks

The viability of rainbow trout Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) culture is being challenged progressively by global warming. Previous trials with Australian and Japanese rainbow trout lines suggested that improvements in thermal performance may be possible. Here, we hypothesized that strain-related differences in physiological response to temperature exist between a north Patagonian hatchery stock (CENSALBA), a Neotropical one (Criadero Boca de Río), and a thermal stream (Valcheta) population of wild introduced rainbow trout. This was tested by comparing, at 20 °C, the thermal preference, specific metabolic rate, thermal tolerance, growth, and condition on juveniles of the three strains, and on a Valcheta stream male x CENSALBA female F1 cross. Preferred temperature (PT) and loss of equilibrium temperature (LET, a measure of thermal tolerance) of Valcheta stream and F1 were significantly higher than those of CENSALBA, and the average PTs of Valcheta stream and F1 were higher than the 95% confidence interval of available reference data for rainbow trout. These results suggest that the F1, reared under standard hatchery conditions and selected by growth and thermal preference, presents higher thermal preference and higher thermal tolerance than the current CENSALBA hatchery stock. Introduction of this naturally adapted strain to hatchery stocks would likely result in the improvement of their temperature resistance to warmer waters. Current studies on adults of this F1 generation are underway.Fil: Crichigno, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales.; ArgentinaFil: Becker, Leandro Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales.; ArgentinaFil: Orellana, Mabel. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universitario Bariloche; ArgentinaFil: Larraza, Rodrigo. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universitario Bariloche; ArgentinaFil: Mirenna, Guillermo. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universitario Bariloche; ArgentinaFil: Battini, Miguel Ángel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales.; ArgentinaFil: Cussac, Victor Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales.; Argentin

Synthesis, 2D-QSAR studies and biological evaluation of quinazoline derivatives as potent anti-trypanosoma cruzi agents

Background: Chagas disease affects about 7 million people worldwide. Only two drugs are currently available for the treatment for this parasite disease, namely, benznidazol (Bzn) and nifurtimox (Nfx). Both drugs have limited curative power in the chronic phase of the disease. Therefore, continuous research is an urgent need so as to discover novel therapeutic alternatives. Objective: The development of safer and more efficient therapeutic anti-T. cruzi drugs continues to be a major goal in trypanocidal chemotherapy. Method: Synthesis, 2D-QSAR and drug-like physicochemical properties of a set of quinazolinone and quinazoline derivatives were studied as trypanocidal agents. All compounds were screened in vitro against Trypanosoma cruzi (Tulahuen strain, Tul 2 stock) epimastigotes and bloodstream trypomastigotes. Results: Out of 34 compounds synthesized and tested, six compounds (5a, 5b, 9b, 9h, 13f and 13p) displayed significant activity against both epimastigotes and tripomastigotes, without exerting toxicity on Vero cells. Conclusion: The antiprotozoal activity of these quinazolinone and quinazoline derivatives represents an interesting starting point for a medicinal chemistry program aiming at the development of novel chemotherapies for Chagas diseaseFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Bruno, Ana Maria. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Niño, Maria Eugenia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Casal, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Sasiambarrena, Leandro Daniel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: González Valdez, Damián Ariel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Puente, Vanesa Rocío. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Centro de Investigaciones sobre Porfirinas y Porfirias. Universidad de Buenos Aires. Centro de Investigaciones sobre Porfirinas y Porfirias; ArgentinaFil: Lombardo, Maria Elisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Centro de Investigaciones sobre Porfirinas y Porfirias. Universidad de Buenos Aires. Centro de Investigaciones sobre Porfirinas y Porfirias; Argentin

Morphologic and genetic variation within a relict Andean catfish, Hatcheria macraei , and its relationship with Trichomycterus areolatus and Bullockia maldonadoi (Siluriformes: Trichomycteridae)

Abstract The South American siluriform fishes are found primarily in the Neotropical region, north and east of the Colorado River of Argentina, with a few relict species distributed southward and westward on both sides of the Andes Mountains. Three of these, the closely related trichomycterids Hatcheria macraei, Trichomycterus areolatus and Bullockia maldonadoi, have been subject to historical taxonomic and nomenclatural arrangements. Here, we amplify a 652-bp fragment of COI mtDNA from 55 H. macraei individuals and use publicly available Cytb mtDNA sequences of the three taxa to assess their relationship, genetic variation and haplotype distribution in relation to hydrographic basins. In addition, we extend a recent morphometric study on H. macraei by analyzing body shape in 447 individuals collected from 24 populations across their entire cis-Andean distribution. We identified some lineages previously assigned to T. areolatus that show a closer relationship to either B. maldonadoi or H. macraei, revealing new boundaries to their currently known trans-Andean distribution. We found a great morphologic variation among H. macraei populations and a high genetic variation in H. macraei, T. areolatus and B. maldonadoi associated with river basins. We highlight further integrative studies are needed to enhance our knowledge of the southern Andean trichomycterid diversity

Síntesis y evaluación biológica de pequeñas moléculas inhibidoras de la entrada del virus de la diarrea viral bovina

El virus de la diarrea viral bovina (BVDV) es un patógeno animal de impactoeconómico cercanamente relacionado al virus de la hepatitis C (HCV). La partícula viralcomprende una membrana lipídica asociada a dos glicoproteínas de envoltura E1 y E2.En el proceso de entrada del BVDV, E2 es el principal determinante para la interaccióndel virus con receptores de superficie de la célula que median la internalización porendocitosis de la partícula viral y es esencial en la fusión de la envoltura del virus con lamembrana del endosoma para liberar el genoma de RNA en el citoplasma de la célulainfectada. La reciente determinación de la estructura cristalina de E2 sugiere que lasproteínas de envoltura de BVDV y HCV comparten características estructurales yfuncionales con implicaciones únicas en el mecanismo de entrada de estos virus.Diversos trabajos han reportado una molécula llamada HCV-II capaz de inhibir laentrada del virus a través de la interacción con aminoácidos hidrofóbicos ubicados en laregión IIIc de E2 de HCV. A partir de estos resultados, utilizamos dicha estructura comomolde para el diseño de moléculas que se unan a la proteína E2 para inhibir la entradade BVDV a la célula. Sintetizamos una serie de compuestos derivados de 1,4-dihidropirimidinas (DHPs) vía una reacción multicomponente (3-CR) de Biginelli yHantzsch. Varios de estos compuestos presentaron actividad antiviral en el orden de nMcon un buen índice terapéutico. Se realizaron estudios SAR determinando losrequerimientos estructurales necesarios para la actividad biológica. Mediante ensayos detiempo de adición se demostró que estos compuestos inhiben la etapa de adsorción delvirus a la célula huésped. Estudios de docking molecular indicaron que presentan fuertesinteracciones con aminoácidos ubicados en el cluster del dominio IIIc.Además de probar la actividad antiviral, evaluamos que estos compuestos seanestables en las condiciones fisiológicas para poder ser aplicados in vivo. Con este fin, serealizaron diferentes ensayos: estabilidad química a diferentes pH; estabilidad plasmática(plasma bovino y murino); estabilidad metabólica (microsomas murinos); y estabilidad enfluido gástrico simulado.En conclusión, se obtuvieron diversas moléculas derivadas de DHPs con capacidadde inhibir la etapa de adsorción de la infección. A partir de estos resultados, estamossintetizando los enantiómeros (+) y (-) de DHPs para evaluar la actividad antiviral deambos estereoisómeros.Fil: Leal, Emilse S.. No especifíca;Fil: Battini, Leandro. No especifíca;Fil: Gonzalez Valdez, Damián. No especifíca;Fil: Pascual, María José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; ArgentinaFil: Gurevich Messina, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Monge, María Eugenia. No especifíca;Fil: Alvarez, Diego Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; ArgentinaFil: Bollini, Mariela. No especifíca;XXI Simposio Nacional de Química OrgánicaSan LuisArgentinaSociedad Argentina de Investigación en Química Orgánic

Identification of potent bovine viral diarrhea virus inhibitors by a structure-based virtual screening approach

Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a pestivirus whose infection in cattle is globally distributed. The use of antivirals could complement vaccination as a tool of control and reduce economic losses. The RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of the virus is essential for its genome replication and constitutes an attractive target for the identification of antivirals. With the aim of obtaining selective BVDV inhibitors, the crystal structure of BVDV RdRp was used to perform a virtual screening. Approximately 15,000 small molecules from commercial and in-house databases were evaluated and several structurally different compounds were tested in vitro for antiviral activity. Interestingly, of twelve evaluated compounds, five were active and displayed EC 50 values in the sub and low-micromolar range. Time of drug addition experiment and measured intracellular BVDV RNA showed that compound 7 act during RNA synthesis. Molecular Dynamics and MM/PBSA calculation were done to characterize the interaction of the most active compounds with RdRp, which will allow future ligand optimization. These studies highlight the use of in silico screening to identify a new class of BVDV inhibitors.Fil: Castro, Eliana Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología e Innovaciones Tecnológicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Virología e Innovaciones Tecnológicas; ArgentinaFil: Casal, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: España de Marco, Maria Jose. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Fabiani, Matias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Fernandez, Gabriela Araceli. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Bruno, Ana María. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Cavallaro, Lucia Vicenta. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; Argentin

Design and Optimization of Quinazoline Derivatives: New Non-nucleoside Inhibitors of Bovine Viral Diarrhea Virus

Bovine viral diarrhea virus (BVDV) belongs to the Pestivirus genus (Flaviviridae). In spite of the availability of vaccines, the virus is still causing substantial financial losses to the livestock industry. In this context, the use of antiviral agents could be an alternative strategy to control and reduce viral infections. The viral RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) is essential for the replication of the viral genome and constitutes an attractive target for the identification of antiviral compounds. In a previous work, we have identified potential molecules that dock into an allosteric binding pocket of BVDV RdRp via a structure-based virtual screening approach. One of them, N-(2-morpholinoethyl)-2-phenylquinazolin-4-amine [1, 50% effective concentration (EC50) = 9.7 ± 0.5 μM], was selected to perform different chemical modifications. Among 24 derivatives synthesized, eight of them showed considerable antiviral activity. Molecular modeling of the most active compounds showed that they bind to a pocket located in the fingers and thumb domains in BVDV RdRp, which is different from that identified for other non-nucleoside inhibitors (NNIs) such as thiosemicarbazone (TSC). We selected compound 2-[4-(2-phenylquinazolin-4-yl)piperazin-1-yl]ethanol (1.9; EC50 = 1.7 ± 0.4 μM) for further analysis. Compound 1.9 was found to inhibit the in vitro replication of TSC-resistant BVDV variants, which carry the N264D mutation in the RdRp. In addition, 1.9 presented adequate solubility in different media and a high-stability profile in murine and bovine plasma.Fil: Fernandez, Gabriela A.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Castro, Eliana Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Rosas, Rocio Ayelen. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fidalgo, Daniela Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Adler, Natalia Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Battini, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: España de Marco, Maria Jose. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fabiani, Matias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bruno, Ana María. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica. Química Orgánica II; ArgentinaFil: Bollini, Mariela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Bionanociencias "Elizabeth Jares Erijman"; ArgentinaFil: Cavallaro, Lucia Vicenta. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentin