Эпидемиологическое значение циркуляции энтеровирусов в период после ликвидации полиомиелита

Agenția Națională pentru Sănătate PublicăSupravegherea epidemiologică a enterovirusurilor este foarte importantă, fiindcă circulația acestora în mediul ambiant reprezintă cauza de răspândire a lor în populație. Republica Moldova face parte din rețeaua globală de laboratoare a OMS pentru diagnosticul de laborator al poliomielitei, care la nivel de țară asigură efectuarea unui control riguros la nivel de populație și de mediu. Astfel, studiul realizat relevă o pondere de 9,2±0,5% a infecției enterovirale (IEV) în populație. Din numărul total de cazuri (173), în 78 (45,1%) au fost izolate virusurile ECHO (inclusiv în 64,1% predomină virusul ECHO 30), în 58 (33,5%) cazuri s-au izolat virusurile Coxsackie B (1-6) și în 25 (14,5%) – poliovirusurile vaccinale, predominante fiind virusurile de tipurile 2 și 3 cu 52%, însă izolarea virusului în populație scade odată cu vârsta, atât la persoanele sănătoase, cât și la bolnavii cu IEV. Frecvența la bolnavii cu IEV de sex masculin este de 13,8±1,2%, iar la sexul feminin acest indicator constituie 11,1±1,3%. Structura tulpinilor virale izolate din mediul ambiant este formată din virusurile ECHO cu 42,3% (225 cazuri), virusurile Coxsackie tip B (1-6) cu 35,3±2,1%, iar cele neidentificate constituie 22,0±1,8%.The epidemiological surveillance of enteroviruses is very important; especially their circulation in the environment is the key to their spreading in the population. The Republic of Moldova is part of the global laboratory network of WHO laboratory polio diagnostics, that at country level has implemented this system and allows to carry out rigorous control at the population and environment level. Thus, our study reveals the prevalence of enterovirus infection in the population of 9,2±0,5%. Of the total number of cases (173), 45,1% or 78 cases reveal ECHO viruses (including 64,1% where ECHO 30 virus predominates), 33,5% or 58 cases – Coxsackie B viruses (1-6) and in 25 cases or 14,5% were isolated polioviruses, predominantly type 2 and 3 viruses by 52%, but virus isolation in population decreases with age, both in healthy individuals and IVE patients. The frequency for male IEV patients is 13,8±1,2%, and for females this indicator is 11,1±1,3%. The structure of viral strains isolated from the environment consists of ECHO viruses – 42,3% (225 cases), Coxsackie virus type B (1-6) – 35,3±2,1% and unidentified viruses constitute 22,0±1,8%.Эпидемиологический надзор за энтеровирусами имеет большое значение, в частности их циркуляция в окружающей среде является ключом к их распространению среди населения. Республика Молдова является частью глобальной лабораторной сети ВОЗ лабораторной диагностики полиомиелита, которая на государственном уровне внедрила эту систему и позволяет осуществлять строгий контроль на уровне населения и окружающей среды. Таким образом, наше исследование выявляет распространенность энтеровирусной инфекции (ЭВИ) в популяции = 9,2±0,5%. Из общего числа случаев (173), в 78 (45,1%) случаев были изолированы вирусы ECHO (включая 64,1% – вирус ECHO 30), в 58 (33,5%) случаев был изолирован вирус Коксаки B (1-6 ) и в 25 (14,5%) случаях – вирус полиомиелита, преимущественно вирус типов 2 и 3 (52%), изоляция вируса среди населения уменьшается с возрастом как у здоровых людей, так и у пациентов с ЭВИ. Частота заболеваний ЭВИ у мужчин составляет 13,8±1,2%, а у женщин этот показатель составляет 11,1±1,3%. Структура штаммов вирусов, выделенных из окружающей среды, состоит из вирусов ECHO 42,3% (225 случаев), Коксаки B (1-6) – 35,3±2,1% и неопознанных вирусов – 22,0±1,8%

WHO-WIDE SEQUENCING OF COVID-19 INFECTION AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF SARS-COV-2 ISOLATES

Universitatea de Stat de Medicină şi Farmacie „Nicolae Testemiţanu”, Chişinău, Republica MoldovaIntroducere. Secvențierea întregului genom al coronavirusurilor și publicarea datelor obținute sunt esențiale pentru evaluarea performanței sistemelor de testare PCR utilizate, urmărirea răspândirii virusului, determinarea variabilității sale genetice și dezvoltarea vaccinului. Scopul lucrării. Identificarea variantelor de mutație a virusului SARS-CoV-2 cu analiza filogenetică a izolatelor circulante pe teritoriul Republicii Moldova. Material și Metode. Identificarea variantelor genetice și determinarea tipului de mutații a fost efectuată prin metodă de secvențierea fragmentelor cu ajutorul instrumentului Ion Torrent Genexus și folosind programele Pangolin și GISAID. Rezultate. În Republica Moldova au fost realizate primele secvențieri ale virusului SARSCoV-2 la finele anului 2021 – au fost investigate 47 de probe biologice. Potrivit rezultatelor obținute în urma investigațiilor, în toate cele 47 de probe a fost identificată varianta Delta. Iar în perioada anului 2022 au fost secvențiate 144 probe biologice selectate după toate criteriile clinice, epidemiologice și diagnostic de laborator. În urma secvențierii au fost obținute următoarele rezultate: în 141 probe biologice a fost identificată varianta Omicron, din ele 57 au prezentat linia BA.2 și 84 probe linia BA.1, iar în 3 probe a fost identificată varianta Delta. Concluzii. În urma studiului s-a constatat că varianta Delta au circulat pe teritoriul Republicii Moldova în a doua jumătate a anului 2021. La începutul anului 2022, începe să apară varianta Omicron. La începutul circulației variantei Omicron a predominat linia BA.1.Background. Coronavirus genome-wide sequencing and publication of data obtained are essential for evaluating the performance of PCR test systems used, tracking the spread of the virus, determining its genetic variability, and developing the vaccine. Objective of the study. Identification of mutation variants of SARS-CoV-2 virus with phylogenetic analysis of circulating isolates on the territory of the Republic of Moldova. Material and Methods. The identification of genetic variants and the determination of the type of mutations was performed by the method of sequencing the fragments using the Ion Torrent Genexus tool and using the Pangolin and GISAID programs. Results. In the Republic of Moldova, the first sequencing of the SARS-CoV-2 virus was performed at the end of 2021 – 47 biological samples were investigated. According to the results of the investigations, the Delta variant was identified in all 47 samples. Moreover, during 2022, 144 biological samples were sequenced, selected according to all clinical, epidemiological and laboratory diagnostic criteria. Following the sequencing, the following results were obtained: in 141 biological samples the Omicron variant was identified, of them 57 presented the BA.2 line and 84 samples the BA.1 line, and in 3 samples the Delta variant was identified. Conclusion. Following the study, it was found that the Delta version circulated on the territory of the Republic of Moldova in the second half of 2021. At the beginning of 2022, the Omicron version begins to appear. At the beginning of the Omicron variant, line BA.1 predominated

Caracteristica circulaţiei a enterovirusurilor în perioada post-certificare a poliomielitei

Una din principalele enteroviroze rămâne a fi poliomielita cu transmitere fecal-orală, a cărei incidenţă la nivel mondial a diminuat substanţial în ultima jumătate a secolului trecut. Acest lucru a devenit posibil în urma aplicării corecte a vaccinului antipoliomielitic. Dacă în a.1988 se înregistrau în jur de 350.000 de cazuri în 125 de ţări endemice, în a.2016 au fost înregistrate 37 cazuri în 2 ţări endemice. În septembrie 2015 Comisia Globală de Certificare a eradicării poliomielitei a declarat eradicarea a tipului 2 de poliovirus sălbatic. Astfel, OMS a recomandat întreruperea utilizării vaccinului trivalent şi trecerea la vaccinarea cu vaccinul bivalen

Monitorizarea infecției COVID -19 prin secvențierea intregului genom și analiza filogenetică a izolatelor SARS-COV-2

Background. Coronavirus genome-wide sequencing and publication of data obtained are essential for evaluating the performance of PCR test systems used, tracking the spread of the virus, determining its genetic variability, and developing the vaccine. Objective of the study. Identification of mutation variants of SARS-CoV-2 virus with phylogenetic analysis of circulating isolates on the territory of the Republic of Moldova. Material and Methods. The identification of genetic variants and the determination of the type of mutations was performed by the method of sequencing the fragments using the Ion Torrent Genexus tool and using the Pangolin and GISAID programs. Results. In the Republic of Moldova, the first sequencing of the SARS-CoV-2 virus was performed at the end of 2021 – 47 biological samples were investigated. According to the results of the investigations, the Delta variant was identified in all 47 samples. Moreover, during 2022, 144 biological samples were sequenced, selected according to all clinical, epidemiological and laboratory diagnostic criteria. Following the sequencing, the following results were obtained: in 141 biological samples the Omicron variant was identified, of them 57 presented the BA.2 line and 84 samples the BA.1 line, and in 3 samples the Delta variant was identified. Conclusion. Following the study, it was found that the Delta version circulated on the territory of the Republic of Moldova in the second half of 2021. At the beginning of 2022, the Omicron version begins to appear. At the beginning of the Omicron variant, line BA.1 predominated.Introducere. Secvențierea întregului genom al coronavirusurilor și publicarea datelor obținute sunt esențiale pentru evaluarea performanței sistemelor de testare PCR utilizate, urmărirea răspândirii virusului, determinarea variabilității sale genetice și dezvoltarea vaccinului. Scopul lucrării. Identificarea variantelor de mutație a virusului SARS-CoV-2 cu analiza filogenetică a izolatelor circulante pe teritoriul Republicii Moldova. Material și Metode. Identificarea variantelor genetice și determinarea tipului de mutații a fost efectuată prin metodă de secvențierea fragmentelor cu ajutorul instrumentului Ion Torrent Genexus și folosind programele Pangolin și GISAID. Rezultate. În Republica Moldova au fost realizate primele secvențieri ale virusului SARSCoV-2 la finele anului 2021 – au fost investigate 47 de probe biologice. Potrivit rezultatelor obținute în urma investigațiilor, în toate cele 47 de probe a fost identificată varianta Delta. Iar în perioada anului 2022 au fost secvențiate 144 probe biologice selectate după toate criteriile clinice, epidemiologice și diagnostic de laborator. În urma secvențierii au fost obținute următoarele rezultate: în 141 probe biologice a fost identificată varianta Omicron, din ele 57 au prezentat linia BA.2 și 84 probe linia BA.1, iar în 3 probe a fost identificată varianta Delta. Concluzii. În urma studiului s-a constatat că varianta Delta au circulat pe teritoriul Republicii Moldova în a doua jumătate a anului 2021. La începutul anului 2022, începe să apară varianta Omicron. La începutul circulației variantei Omicron a predominat linia BA.1

Acute flaccid paralysis in children in the post certification period of the Republic of Moldova as a country free of wild poliomyelitis

Agenția Națională de Sănătate Publică, Republica MoldovaIntroduction. Monitoring acute flaccid paralysis (AFP) is a key strategy used by the Global Polio Eradication Initiative (GPEI) in assessing the progress towards the global eradication goal. Material and methods. A cross-sectional descriptive study was conducted during the years 2002-2017. The current research was carried out within the National Agency for Public Health-Virology Laboratory. The study focused on a period of 15 years (2002-2017), during which the Republic of Moldova was included as a polio-free country. Results. Thus, over 15 years (2002-2017) there were reported and registered 118 non-polio cases (AFP) on the territory of the Republic of Moldova. The data of our study determined the rate of non-polio cases for the period 2002-2017, that ranged between 0.3-2.3 per 100 000 children, cumulatively, the incidence being of 17.9 cases per 100 000 children. The rate of males diagnosed with acute flaccid paralysis accounted for 54.2%. Most cases were registered in the Central areas, including Chisinau city (29.7%) and other localities involving the same area 28.8%. Conclusion. The study results showed that, the Republic of Moldova has a feasible monitoring of the epidemiological situation on polio, including an action plan for further preventive measures and surveillance of poliomyelitis, where detection, registration and investigation of AFP is the "gold standard" aimed at providing a favorable epidemiological situation.Introducere. Supravegherea paraliziei acute flasce (PAF) este o strategie-cheie, utilizată de inițiativa globală de eradicare a poliomielitei (IGEP), pentru a evalua progresele înregistrate în atingerea obiectivului global de eradicare. Material și metode. A fost efectuat un studiu descriptiv transversal, realizat în perioada anilor 2002-2017. Actuala cercetare a fost efectuată în cadrul Agenţiei Naţionale de Sănătate Publică-Laboratorul virusologic. Studiul s-a axat pe o perioadă de 15 ani (2002-2017), timp în care Republica Moldova este inclusă, și se menține, ca ţară liberă la poliomielită. Rezultate. Astfel, pe parcursul anilor 2002-2017 pe teritoriul Republicii Moldova au fost raportate şi înregistrate 118 cazuri non–polio (PAF). Datele studiului nostru au determi-nat rata cazurilor non-polio (PAF), pentru perioada 2002-2017, în limitele 0,3-2,3 la 100 mii copii, cumulativ incidenţa constituind 17,9 cazuri la 100 mii copii. Rata persoanelor de gen masculin, depistate cu paralizie acută flască, este de 54,2%. Cele mai multe cazuri au fost înregistrate în zona Centru şi anume în mun. Chişinău-29,7%, din totalul de cazuri, iar în celelalte localităţi incluse în această zonă-28,8%. Concluzii. Rezultatele obţinute demonstrează că, Republica Moldova deţine un sistem viabil de supraveghere a situaţiei epidemiologice privind poliomielita, care include un plan de acţiuni de continuare a măsurilor de prevenire şi de supraveghere a poliomielitei, unde depistarea, înregistrarea şi investigarea cazurilor de PAF constituie “standardul de aur” de asigurare a unei situaţii epidemiologice favorabile

Supravegherea epidemiologică și de laborator a paraliziei acută flască în perioada postcertificare în calitate de țară liberă de poliomielită

Introducere. În anul 2022, de rând cu alte țări din Regiunea Europeană OMS, Republica Moldova a fost certificată liberă de poliomielită. Pentru menţinerea acestei reușite, este nevoie de măsuri de supraveghere epidemiologică și eforturi în activitățile de imunizare. Dat fiind faptul că în lume există două ţări endemice în care anual se înregistrează cazuri de poliomielită sălbatică, riscul de import al virusului poliomielitic sălbatic continuă să persiste. Scopul. Conform recomandărilor OMS și obiectivelor Programului Global de lichidare a poliomielitei este necesar de a monitoriza fiecare caz de paralizie acută flască (PAF) prin depistarea, declararea, înregistrarea și investigarea fiecărui caz. Astfel, ne-am propus să analizăm situația epidemiologică prin studiul observațional privind PAF în Republica Moldova. Material și metode. Au fost recoltate şi investigate 278 de probe de materii fecale. Izolarea tulpinilor virale şi identificarea lor a fost realizată în culturile de celule RD şi L-20B, care au fost recepţionate prin intermediul Organizației Mondiale a Sănătății (OMS). În Laboratorul virusologic al Agenției Naționale pentru Sănătate Publică, prin metoda clasică (reacţia de neutralizare), cu utilizarea serurilor imune specifice polio şi enterovirale standardizate (Bilthoven, Olanda) a fost realizată identificarea tulpinilor poliovirale. Rezultate. În perioada postcertificare – anii 2002-2022, în Republica Moldova, au fost înregistrate și raportate 136 de cazuri de paralizie acută flască (PAF). Repartizarea geografică a fost uniformă, inclusiv din raioanele de Est ale țării. Incidența a variat de la 0,31 la 100000 de copii până la 15 ani în 2017, până la 2,2 – în 2010, în medie constituind 0,96. În perioada de referință, au fost izolate virusuri polio și enterovirusuri de la 10 bolnavi, după cum urmează: 2 cazuri - Polio 1, un caz – Polio 2, 2 cazuri – Polio 3, 1 caz – Polio 1+2, 2 cazuri – Polio 1+2+3, și 1 caz – Polio 1+3, iar la 5 cazuri – diferite serotipuri de virusuri ECHO. Ulterior, poliovirusurile izolate și identificate în Laboratorul ANSP au fost expediate pentru confirmarea şi determinarea originii lor în Laboratorul Regional de Referinţă al OMS (Institutul de Poliomielită şi Encefalite Virale „M. P .Ciumacov”), prin tehnici de biologie moleculară și diferențiere intratipică. Toate tulpinile poliovirale au origine vaccinală şi au fost izolate de la copii vaccinaţi anterior îmbolnăvirii. Din 136 de copii cu sindromul PAF-129 au fost vaccinaţi conform vârstei (94,8%). În rezultatul clasificării definitive a cazurilor de PAF de către Comisia de evaluare și calificare a cazurilor suspecte de poliomielită, nu au fost determinate cazuri compatibile cu poliomielita. Concluzii. Rezultatele atestă menținerea unui sistem viabil de supraveghere a situaţiei epidemiologice privind poliomielita care îl deține Republica Moldova și care include un plan de acţiuni în menținerea statutului țării libere de poliomielită

Monitorizarea infecției COVID -19 prin secvențierea întregului genom și analiza filogenetică a izolatelor SARS-CoV-2

Introducere: Secvenţierea întregului genom al coronovirusurilor şi publicarea datelor obţinute sunt esenţiale pentru evaluarea performanţei sistemelor de testare PCR utilizate, urmărirea răspândirii virusului, determinarea variabilitaţii sale genetice şi dezvoltarea vaccinului. Scopul lucrării. Identificarea variantelor de mutaţie a virusului SARS-CoV-2 cu analiza filogenetică a izolatelor circulante pe teritoriul Republicii Moldova. Materiale şi metode: Identificarea variantelor genetice şi determinarea tipului de mutaţii a fost efectuată prin metodă de secvenţierea fragmentelor cu ajutorul instrumentului Ion Torrent Genexus şi folosind programele Pangolin şi GISAID. Rezultatele secvenţierii a. 2021 - 105 probe secvenţiate cu următoarele rezultate: 46 probe varianta Alpha (B.1.1.7), 59 probe varianta Delta (B.1.617.2). Rezultatele secvenţierii a. 2022 - 144 probe secvenţiate din ele: 3 probe varianta Delta (B.1.617.2), 141 varianta Omicron (B.1.1.529), (57 linia BA.2; 84 probe linia BA.1). Concluzii: Secvenţierea genomului SARS-CoV-2 în RM a demonstrat predominarea variantei Delta - iulie a. 2021. Iar din ianuarie a. 2022 a fost identificat varianta Omicron cu predominarea liniei BA.1

Острый вялый паралич у детей Республики Молдова после сертификации ее как страны свободной от дикого полиомиелита

Centrul Naţional de Sănătate PublicăSummary. In 2002 year the Regional Commission for the Certification for Europe of Polio Eradication of World Health Organization declared our country free of poliomyelitis caused by the wild virus. The postcertification program provides identification, information, epidemiological and laboratory investigation of each case of acute flaccid paralysis with the consecutive establishing of final diagnosis to complete the eradication of global polio. From 2003 to 2011 in the Republic of Moldova were registred 85 cases of acute fl accid paralysis, from which were collected and examined 178 of stool specimens. All identified poliomyelitis viruses have vaccination nature.Резюме. В 2002 г. Европейская Региональная Сертификационная Комиссия Всемирной Организации Здравоохранения объявила Республику Молдова свободной от полиомиелита вызванного диким вирусом. Программа после сертификации предусматривала выявление, сообщение, эпидемиологическое и лабораторное исследование каждого случая острого вялого паралича у детей с последующим установлением заключительного диагноза до глобальной ликвидации полиомиелита. С 2003 по 2011 гг. в Республике Молдова было зарегистрировано 85 случаев острого вялого паралича у детей от которых собрано и исследовано 178 проб фекалий. Все выделенные вирусы полиомиелита относились к вакцинным штаммам

Dinamica morbidităţii prin infecţia enterovirală în Republica Moldova

În articol este analizată situaţia epidemiologică privind infecţia enterovirală în Republica Moldova pe parcursul anilor 2001 - 2009. Morbiditatea prin enteroviroze etiologic preponderent cauzată de virusurile ECHO 30 s-a manifestat cu o incidenţă sporită în lunile de vară. În special au fost afectate persoanele de vârstă tânără. Realizarea măsurilor de control şi răspuns, similare cu măsurile antiepidemice realizate pentru combaterea hepatitei virale A, au condus la o ameliorare a situaţiei epidemiologice exprimată prin intensifi carea tempoului de reducere a morbidităţii prin enteroviroze. Sunt necesare studii suplimentare întru optimizarea sistemului de supraveghere racordate la exigenţele Comunităţii Europene

Циркуляция энтеровирусов среди населения и в объектах окружающей среды в муниципии Кишинэу в 2008-2013 г.

Centrul de Sănătate Publică din mun. Chişinău, Centrul Naţional de Sănătate Publică, Conferința științifico-practică cu participare internațională Centrul de Sănătate Publică din municipiul Chișinău – 70 de ani la straja sănătăţii 23 octombrie 2014Enteroviruses (polio viruses, Coxsackie A and B, Echovirus and enterovirus 68-71) include numerous pathogens that cause various forms of human diseases may thus be affected digestive tract, respiratory tract and sometimes the nervous system. Enterovirus infections are widespread, every year, including in Chisinau. In 2002, the European Regional Certifi cation Commission of the World Health Organization declared polio-free Europe caused by the wild virus. The vaccine strains of poliovirus and other Enterovirus serotypes are circulating widely in our territory. In this paper we present the results of a study of the spectrum of these viruses circulating during the 2008-2013 years. A total of 2327 samples were examined.Энтеровирусы (вирусы полиомиелита, Коксаки А и В, ЕСНО и энтеровирусы 68-71) включают многочисленные патогенные агенты, которые вызывают у людей различные формы заболевания, при этом могут быть поражены пищеварительный тракт, респираторный тракт и иногда нервная система. Энтеровирусные инфекции распространены повсеместно, ежегодно, в том числе в муниципии Кишинэу. В 2002 г. Европейская Региональная Сертификационная Комиссия Всемирной Организации Здравоохранения объявила Европу свободной от полиомиелита, вызванного диким вирусом. Вакцинные штаммы вируса полиомиелита и другие серотипы энтеровирусов широко циркулируют на нашей территории. В данной работе приведены результаты изучения спектра циркуляции указанных вирусов на протяжении 2008-2013 гг. Всего было исследовано 2327 проб