The C Terminus of the Ribosomal-Associated Protein LrtA Is an Intrinsically Disordered Oligomer

The 191-residue-long LrtA protein of Synechocystis sp. PCC 6803 is involved in post-stress survival and in stabilizing 70S ribosomal particles. It belongs to the hibernating promoting factor (HPF) family, intervening in protein synthesis. The protein consists of two domains: The N-terminal region (N-LrtA, residues 1-101), which is common to all the members of the HPF, and seems to be well-folded; and the C-terminal region (C-LrtA, residues 102-191), which is hypothesized to be disordered. In this work, we studied the conformational preferences of isolated C-LrtA in solution. The protein was disordered, as shown by computational modelling, 1D-H-1 NMR, steady-state far-UV circular dichroism (CD) and chemical and thermal denaturations followed by fluorescence and far-UV CD. Moreover, at physiological conditions, as indicated by several biochemical and hydrodynamic techniques, isolated C-LrtA intervened in a self-association equilibrium, involving several oligomerization reactions. Thus, C-LrtA was an oligomeric disordered protein.This research was funded by Spanish Ministry of Economy and Competitiveness [CTQ2015-64445-R (to J.L.N.) and MAT2015-63704-P (to A.A.), with Fondo Social Europeo (ESF)], and by the Basque Government [IT-654-13 (to A.A.)

The C Terminus of the Ribosomal-Associated Protein LrtA Is an Intrinsically Disordered Oligomer

The 191-residue-long LrtA protein of Synechocystis sp. PCC 6803 is involved in post-stress survival and in stabilizing 70S ribosomal particles. It belongs to the hibernating promoting factor (HPF) family, intervening in protein synthesis. The protein consists of two domains: The N-terminal region (N-LrtA, residues 1-101), which is common to all the members of the HPF, and seems to be well-folded; and the C-terminal region (C-LrtA, residues 102-191), which is hypothesized to be disordered. In this work, we studied the conformational preferences of isolated C-LrtA in solution. The protein was disordered, as shown by computational modelling, 1D-H-1 NMR, steady-state far-UV circular dichroism (CD) and chemical and thermal denaturations followed by fluorescence and far-UV CD. Moreover, at physiological conditions, as indicated by several biochemical and hydrodynamic techniques, isolated C-LrtA intervened in a self-association equilibrium, involving several oligomerization reactions. Thus, C-LrtA was an oligomeric disordered protein.This research was funded by Spanish Ministry of Economy and Competitiveness [CTQ2015-64445-R (to J.L.N.) and MAT2015-63704-P (to A.A.), with Fondo Social Europeo (ESF)], and by the Basque Government [IT-654-13 (to A.A.)

Relato de experiencias desarrolladas en el marco del proyecto de investigación “Accesibilidad urbana y arquitectónica, educativa y a la comunicación en personas con movilidad y/o comunicación reducida” : 2012-2013

Creemos oportuno compartir con los participantes del ARQUISUR la experiencia surgida del proyecto de investigación desarrollado durante los años 2012 y 2013. La temática central del Congreso da cuenta de una condición, que en el imaginario colectivo, alimentado por teorías ya desestimadas y clichés sobre lo distinto, puede remitir al tema de la discapacidad. Vulnerable según la única acepción que define la Real Academia Española significa Que puede ser herido o recibir lesión, física o moralmente. Los discursos acerca de la inclusión de la diferencia, la igualdad de derechos y oportunidades no llegan a convalidar en términos concretos una realidad en la que estos presupuestos se conviertan en principios de acción indiscutibles. Nuestro objetivo fue indagar acerca de la integración y del acceso a la educación, como derecho constitucional; impulsamos nuestro trabajo hacia la necesidad de pensar una educación donde todos estemos incluidos. El tema de la accesibilidad física se suma a la convicción de que educar en derechos es aportar al cambio de actitudes y miradas hacia lo diverso. El trabajo interdisciplinario sustenta nuestras prácticas, las enriquece, las amplía, y potencia las miradas sobre la temática a través de las diferentes experiencias, expresiones, discursos, modos de hacer.Área temática 1: Proyecto Arquitectónico y Urbano - Eje InvestigaciónFacultad de Arquitectura y Urbanism

Relato de experiencias desarrolladas en el marco del proyecto de investigación “Accesibilidad urbana y arquitectónica, educativa y a la comunicación en personas con movilidad y/o comunicación reducida” : 2012-2013

Creemos oportuno compartir con los participantes del ARQUISUR la experiencia surgida del proyecto de investigación desarrollado durante los años 2012 y 2013. La temática central del Congreso da cuenta de una condición, que en el imaginario colectivo, alimentado por teorías ya desestimadas y clichés sobre lo distinto, puede remitir al tema de la discapacidad. Vulnerable según la única acepción que define la Real Academia Española significa Que puede ser herido o recibir lesión, física o moralmente. Los discursos acerca de la inclusión de la diferencia, la igualdad de derechos y oportunidades no llegan a convalidar en términos concretos una realidad en la que estos presupuestos se conviertan en principios de acción indiscutibles. Nuestro objetivo fue indagar acerca de la integración y del acceso a la educación, como derecho constitucional; impulsamos nuestro trabajo hacia la necesidad de pensar una educación donde todos estemos incluidos. El tema de la accesibilidad física se suma a la convicción de que educar en derechos es aportar al cambio de actitudes y miradas hacia lo diverso. El trabajo interdisciplinario sustenta nuestras prácticas, las enriquece, las amplía, y potencia las miradas sobre la temática a través de las diferentes experiencias, expresiones, discursos, modos de hacer.Área temática 1: Proyecto Arquitectónico y Urbano - Eje InvestigaciónFacultad de Arquitectura y Urbanism

Relato de experiencias desarrolladas en el marco del proyecto de investigación “Accesibilidad urbana y arquitectónica, educativa y a la comunicación en personas con movilidad y/o comunicación reducida” : 2012-2013

Creemos oportuno compartir con los participantes del ARQUISUR la experiencia surgida del proyecto de investigación desarrollado durante los años 2012 y 2013. La temática central del Congreso da cuenta de una condición, que en el imaginario colectivo, alimentado por teorías ya desestimadas y clichés sobre lo distinto, puede remitir al tema de la discapacidad. Vulnerable según la única acepción que define la Real Academia Española significa Que puede ser herido o recibir lesión, física o moralmente. Los discursos acerca de la inclusión de la diferencia, la igualdad de derechos y oportunidades no llegan a convalidar en términos concretos una realidad en la que estos presupuestos se conviertan en principios de acción indiscutibles. Nuestro objetivo fue indagar acerca de la integración y del acceso a la educación, como derecho constitucional; impulsamos nuestro trabajo hacia la necesidad de pensar una educación donde todos estemos incluidos. El tema de la accesibilidad física se suma a la convicción de que educar en derechos es aportar al cambio de actitudes y miradas hacia lo diverso. El trabajo interdisciplinario sustenta nuestras prácticas, las enriquece, las amplía, y potencia las miradas sobre la temática a través de las diferentes experiencias, expresiones, discursos, modos de hacer.Área temática 1: Proyecto Arquitectónico y Urbano - Eje InvestigaciónFacultad de Arquitectura y Urbanism

Additive effects of LPL, APOA5 and APOE variant combinations on triglyceride levels and hypertriglyceridemia: results of the ICARIA genetic sub-study

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Hypertriglyceridemia (HTG) is a well-established independent risk factor for cardiovascular disease and the influence of several genetic variants in genes related with triglyceride (TG) metabolism has been described, including <it>LPL</it>, <it>APOA5 </it>and <it>APOE</it>. The combined analysis of these polymorphisms could produce clinically meaningful complementary information.</p> <p>Methods</p> <p>A subgroup of the ICARIA study comprising 1825 Spanish subjects (80% men, mean age 36 years) was genotyped for the <it>LPL</it>-HindIII (rs320), S447X (rs328), D9N (rs1801177) and N291S (rs268) polymorphisms, the <it>APOA5</it>-S19W (rs3135506) and -1131T/C (rs662799) variants, and the <it>APOE </it>polymorphism (rs429358; rs7412) using PCR and restriction analysis and TaqMan assays. We used regression analyses to examine their combined effects on TG levels (with the log-transformed variable) and the association of variant combinations with TG levels and hypertriglyceridemia (TG ≥ 1.69 mmol/L), including the covariates: gender, age, waist circumference, blood glucose, blood pressure, smoking and alcohol consumption.</p> <p>Results</p> <p>We found a significant lowering effect of the <it>LPL</it>-HindIII and S447X polymorphisms (<it>p </it>< 0.0001). In addition, the D9N, N291S, S19W and -1131T/C variants and the <it>APOE</it>-ε4 allele were significantly associated with an independent additive TG-raising effect (<it>p </it>< 0.05, <it>p </it>< 0.01, <it>p </it>< 0.001, <it>p </it>< 0.0001 and <it>p </it>< 0.001, respectively). Grouping individuals according to the presence of TG-lowering or TG-raising polymorphisms showed significant differences in TG levels (<it>p </it>< 0.0001), with the lowest levels exhibited by carriers of two lowering variants (10.2% reduction in TG geometric mean with respect to individuals who were homozygous for the frequent alleles of all the variants), and the highest levels in carriers of raising combinations (25.1% mean TG increase). Thus, carrying two lowering variants was protective against HTG (OR = 0.62; 95% CI, 0.39-0.98; <it>p </it>= 0.042) and having one single raising polymorphism (OR = 1.20; 95% CI, 1.39-2.87; <it>p </it>< 0.001) or more (2 or 3 raising variants; OR = 2.90; 95% CI, 1.56-5.41; <it>p </it>< 0.001) were associated with HTG.</p> <p>Conclusion</p> <p>Our results showed a significant independent additive effect on TG levels of the <it>LPL </it>polymorphisms HindIII, S447X, D9N and N291S; the S19W and -1131T/C variants of <it>APOA5</it>, and the ε4 allele of <it>APOE </it>in our study population. Moreover, some of the variant combinations studied were significantly associated with the absence or the presence of hypertriglyceridemia.</p

The isolated armadillo-repeat domain of Plakophilin 1 is a monomer in solution with a low conformational stability.

Plakophilin 1 (PKP1) is a member of the armadillo repeat family of proteins. It serves as a scaffold component of desmosomes, which are key structural components for cell-cell adhesion. We have embarked on the biophysical and conformational characterization of the ARM domain of PKP1 (ARM-PKP1) in solution by using several spectroscopic (namely, fluorescence and circular dichroism (CD)) and biophysical techniques (namely, analytical ultracentrifugation (AUC), dynamic light scattering (DLS) and differential scanning calorimetry (DSC)). ARM-PKP1 was a monomer in solution at physiological pH, with a low conformational stability, as concluded from DSC experiments and thermal denaturations followed by fluorescence and CD. The presence or absence of disulphide bridges did not affect its low stability. The protein unfolded through an intermediate which has lost native-like secondary structure. ARM-PKP1 acquired a native-like structure in a narrow pH range (between pH 6.0 and 8.0), indicating that its adherent properties might only work in a very narrow pH range

Conocimiento del Medio como elemento de integración de la Comunidad Educativa

Resumen basado en el de la publicación.Se incluye fichero de anexos con las aportaciones de los docentes implicados.Teniendo en cuenta los objetivos, los contenidos, la metodología en cuanto a tareas a realizar y la evaluación del mismo, se pretende que el alumnado participante tenga ideas novedosas y originales, que las trabaje y que obtenga un resultado (el conocimiento de su municipio y de sus compañeros) para tener una visión más amplia y profunda del entorno o medio que lo rodea. Para recabar la información necesaria, se utilizarán documentos diversos (encuestas, cuestionarios, entrevistas, visitas, debates, charlas, exposiciones orales, fotografías, …), incidiendo en la concienciación sobre el medio ambiente natural y social (costumbres y tradiciones), aspectos de ciudadanía, respeto a los hábitos de una población concreta, medios de subsistencia, … Este proceso se llevará a cabo durante algunas sesiones del curso con el profesorado coordinador y participante y también estará supervisado por el mismo. Además, hará falta que el alumno trabaje en su horario no lectivo para recopilar esta información que se pondrá en común en el centro educativo entre todo el alumnado. Se creará una guía sobre los aspectos más importantes de las localidades y pedanías rurales donde residen nuestros alumnos. Así, la creatividad, autonomía e iniciativa propia de los alumnos/as estará muy presente en este caso práctico.Consejería de Educación, Cultura y Deportes de Castilla-La ManchaCastilla La ManchaES

Conocimiento del Medio como elemento de integración de la Comunidad Educativa

Resumen basado en el de la publicación.Se incluye fichero de anexos con las aportaciones de los docentes implicados.Teniendo en cuenta los objetivos, los contenidos, la metodología en cuanto a tareas a realizar y la evaluación del mismo, se pretende que el alumnado participante tenga ideas novedosas y originales, que las trabaje y que obtenga un resultado (el conocimiento de su municipio y de sus compañeros) para tener una visión más amplia y profunda del entorno o medio que lo rodea. Para recabar la información necesaria, se utilizarán documentos diversos (encuestas, cuestionarios, entrevistas, visitas, debates, charlas, exposiciones orales, fotografías, …), incidiendo en la concienciación sobre el medio ambiente natural y social (costumbres y tradiciones), aspectos de ciudadanía, respeto a los hábitos de una población concreta, medios de subsistencia, … Este proceso se llevará a cabo durante algunas sesiones del curso con el profesorado coordinador y participante y también estará supervisado por el mismo. Además, hará falta que el alumno trabaje en su horario no lectivo para recopilar esta información que se pondrá en común en el centro educativo entre todo el alumnado. Se creará una guía sobre los aspectos más importantes de las localidades y pedanías rurales donde residen nuestros alumnos. Así, la creatividad, autonomía e iniciativa propia de los alumnos/as estará muy presente en este caso práctico.Consejería de Educación, Cultura y Deportes de Castilla-La ManchaCastilla La ManchaES

Weaning from mechanical ventilation in intensive care units across 50 countries (WEAN SAFE): a multicentre, prospective, observational cohort study

International audienceBackground: Current management practices and outcomes in weaning from invasive mechanical ventilation are poorly understood. We aimed to describe the epidemiology, management, timings, risk for failure, and outcomes of weaning in patients requiring at least 2 days of invasive mechanical ventilation. Methods: WEAN SAFE was an international, multicentre, prospective, observational cohort study done in 481 intensive care units in 50 countries. Eligible participants were older than 16 years, admitted to a participating intensive care unit, and receiving mechanical ventilation for 2 calendar days or longer. We defined weaning initiation as the first attempt to separate a patient from the ventilator, successful weaning as no reintubation or death within 7 days of extubation, and weaning eligibility criteria based on positive end-expiratory pressure, fractional concentration of oxygen in inspired air, and vasopressors. The primary outcome was the proportion of patients successfully weaned at 90 days. Key secondary outcomes included weaning duration, timing of weaning events, factors associated with weaning delay and weaning failure, and hospital outcomes. This study is registered with ClinicalTrials.gov, NCT03255109. Findings: Between Oct 4, 2017, and June 25, 2018, 10 232 patients were screened for eligibility, of whom 5869 were enrolled. 4523 (77·1%) patients underwent at least one separation attempt and 3817 (65·0%) patients were successfully weaned from ventilation at day 90. 237 (4·0%) patients were transferred before any separation attempt, 153 (2·6%) were transferred after at least one separation attempt and not successfully weaned, and 1662 (28·3%) died while invasively ventilated. The median time from fulfilling weaning eligibility criteria to first separation attempt was 1 day (IQR 0–4), and 1013 (22·4%) patients had a delay in initiating first separation of 5 or more days. Of the 4523 (77·1%) patients with separation attempts, 2927 (64·7%) had a short wean (≤1 day), 457 (10·1%) had intermediate weaning (2–6 days), 433 (9·6%) required prolonged weaning (≥7 days), and 706 (15·6%) had weaning failure. Higher sedation scores were independently associated with delayed initiation of weaning. Delayed initiation of weaning and higher sedation scores were independently associated with weaning failure. 1742 (31·8%) of 5479 patients died in the intensive care unit and 2095 (38·3%) of 5465 patients died in hospital. Interpretation: In critically ill patients receiving at least 2 days of invasive mechanical ventilation, only 65% were weaned at 90 days. A better understanding of factors that delay the weaning process, such as delays in weaning initiation or excessive sedation levels, might improve weaning success rates. Funding: European Society of Intensive Care Medicine, European Respiratory Society