Sobre la autonomía de los genes

During the last decades we have been present at the unstoppable advance of the genetics, which discoveries have provoked the interest of philosophers of biology. Nevertheless, the question "what is a gene?" continues without a definitive answer and doesn.t exist a clear and univocal positioning on the part of scientists. Sometimes the gene has been thought as autonomous agent, the leader of evolution and organismic development, but the current genomic science draws a totally different scene and objects some of the scientific established metaphorsDurante las últimas décadas hemos asistido al avance imparable de la genética y los descubrimientos en este campo han suscitado el interés creciente de los filósofos de la biología. No obstante, la pregunta ¿qué es un gen? sigue sin una respuesta definitiva y no existe un posicionamiento claro y unívoco por parte de la ciencia. En algunos momentos se ha llegado a considerar el gen como una especie de agente autónomo, responsable último de la evolución y del desarrollo organísmico, pero la nueva ciencia genómica dibuja un panorama diferente y ha empezado a cuestionar algunas de las metáforas científicas más comunes

Humanía modelo de agentes para el avistamiento de otras formas posibles de vida social humana basadas en el constructo vínculo de apego como fundamento micro-sociológico de las relaciones sociales

Se presenta una experiencia de simulación social basada en las categorías ‘Vínculo de Apego’ (VA) y ‘Patrones de Apego’ (PA) como fundamentos de las micro-relaciones entre agentes. En HUMANÍA, agentes con diferentes PA a través del tiempo y de acuerdo con reglas de probabilidad, establecen relaciones que varían en intensidad, de las cuales emergen estructuras macro-sociales susceptibles de ser representadas a través de grafos. De 16 experimentos de simulación se obtuvieron resultados que permiten verificar y validar el modelo en cuanto a su capacidad para generar diferentes formas sociales, las cuales se pueden agrupar en tres grandes categorías de acuerdo con las dinámicas de leyes de potencia que exhiben; igualitarias, no igualitarias e indeterminadas. Se concluye el potencial de las categorías VA y PA para desarrollar proyectos de simulación que permitan comprender mejor la naturaleza de las sociedades humanas como emergencias.A social simulation experience based on the categories 'Attachment Bond' (AB) and 'Attachment Patterns' (AP) as the basis of micro-relationships between agents is presented. In Humania, agents with different AP over time and according to probability rules establish relationships that vary in intensity, from which emerge macro-social structures that can be represented by graphs. 16 simulation experiments results used to verify and validate the model in terms of its ability to generate different social forms, which can be grouped into three broad categories according to the dynamics of power laws exhibiting - equal, not equal and indeterminate- were obtained. The potential of the categories AB and AP to develop simulation projects for a better understanding of nature of human societies as emergencies is concluded.Doctor en Ciencias Sociales y HumanasDoctorad

Los orígenes de la individualidad y función biológicas: una aproximación a través de la química de sistemas

252 p.La comprensión del fenómeno biológico ha sido, desde siempre, uno de los principales retos para laciencia. Tradicionalmente, la teoría evolutiva se ha impuesto como la perspectiva más adecuada eidiosincrática de lo vivo, explicando las propiedades biológicas desde un punto de vista histórico ycolectivo. No obstante, la visión organizacional - que busca definir los principios generales quesubyacen a los organismos individuales - está ganando importancia en los últimos años. La tensiónentre la perspectiva fisiológica-organizacional y la perspectiva histórico-evolutiva sobresaleespecialmente en al ámbito de Origen de la Vida, en el que el clásico escenario evolutivo no essuficiente a la hora de explicar la transición de un dominio químico (moléculas) a uno biológico(células). Los intentos de unificar ambas perspectivas en una teoría general de la organizaciónbiológica han sacado a relucir la necesidad de buscar algunos conceptos y principios adicionalesque permitan avanzar en esta visión más integradora. Utilizando el marco conceptual de la teoría dela autonomía biológica [Ruiz-Mirazo & Moreno 2012; Moreno & Mossio 2015] este ensayopropone una estrategia genealógica como modelo para abordar la complejidad biológica. Estaestrategia consiste en explorar a lo largo de una evolución molecular prebiótica sistemas con unorganización básica progresivamente más cercana a la de los seres vivos. En este contexto nosencontramos ante un escenario químico que puede ser encarado empíricamente a través de la nuevadisciplina llamada ¿química de sistemas¿, cuyo objetivo es el estudio de mezclas moleculares y suscomportamientos colectivos emergentes (dinámicos y evolutivos).A partir de una aproximación empírica basada en el desarrollo de un modelo protocelularlipopeptídico centrado en las dinámicas de auto-organización y de auto-ensamblaje de mezclas deespecies moleculares sencillas y asumiendo la auto-producción como una característica necesariapara la definición de vida, en esta tesis se reflexiona sobre las raíces físico-químicas de conceptosfundamentales en biología como función o individualidad. La exploración del paso de la química ala biología es posible a través de la investigación del comportamiento dinámico de mezclasquímicas complejas, unido a una reflexión teórica centrada en una "lectura en términos biológicos¿de las propiedades organizativas emergentes. Este trabajo pretende ser, por un lado, unacontribución al reciente campo de investigación con protocélulas como terreno fértil para explorarlas conexiones entre la química de sistemas y la biología sintética y, por el otro, una llamada a latransdisciplinariedad en la ciencia. El trabajo experimental desarrollado durante esta tesis fuediseñado en base a un modelo teórico previo, éste a su vez basado en una reflexión filosófica entorno al problema del origen de la vida. Con esto se pretende llamar la atención sobre el peso que lacorrecta canalización de un trabajo filosófico puede tener para reforzar la ciencia - y viceversa. Enbreve, esta tesis puede considerarse un ejemplo que ilustra una nueva concepción de la filosofía dela ciencia como `filosofía para la ciencia¿ [Wimsatt 2007; Griesemer 2008], de acuerdo a la cual sedemuestra que hay espacio para la fusión entre ambas y que esto puede ser una de las claves para elavance epistemológico en el futuro

Inteligencia computacional inspirada en la vida

El desarrollo actual de la mayoría de las disciplinas del conocimiento humano no se hubiera alcanzado si no hubiera sido por el gran avance de la informática en los últimos años. En esta lección inaugural del curso 2010-2011 de la universidad de Málaga se realiza un breve recorrido sobre los paradigmas de la Inteligencia Computacional como una parte importante de la informática. Se comienza con las redes neuronales artificiales que son modelos matemáticos inspirados en el conocimiento actual que tenemos sobre el funcionamiento del cerebro. Los principios de organización de las neuronas biológicas, los flujos de información y los mecanismos de aprendizaje y memorización son utilizados en el diseño de dichos modelos. Por otra parte, la evolución biológica se puede contemplar como un proceso de optimización cuyo objetivo es mejorar la capacidad de un organismo para sobrevivir en ambientes competitivos que cambian dinámicamente. Así surge la computación evolutiva que está inspirada en los procesos de la evolución natural y que presenta múltiples ventajas. Asimismo, observando el comportamiento de las hormigas se ha comprobado que encuentran el camino más corto entre el hormiguero y la fuente de comida gracias a una sustancia llamada feromona creando un camino de olor. Es un mecanismo de coordinación indirecta entre agentes y acciones que ha inspirado el desarrollo de la computación de colonias de hormigas. Por otro lado, también se ha observado la formación de grupos sociales en muchas especies de animales e insectos que les permite reunirse y moverse juntos a partir de interacciones locales entre ellos, como ocurre en las bandadas de pájaros o en los enjambres de abejas. A partir de dichas interacciones emergen comportamientos colectivos más complejos. La inteligencia de enjambres está inspirada en dichos procesos. Finalmente, se presentan en esta lección algunas áreas de aplicación de la inteligencia computacional y se indican las tendencias actuales de la misma

La obra de Stuart Kauffman. Aportaciones a la Biología del Siglo XXI e implicaciones filosóficas

La presente investigación analizará el proyecto que Stuart Kauffman, como uno de los más reconocidos representantes de las teorías de la complejidad, ha desarrollado para reorientar la postura evolucionista más tradicional (neo-darwinista), en torno al problema del orden biológico. Los objetivos principales de la presente investigación son: (1) definir en qué consiste el proyecto Kauffmaniano; (2) determinar su radicalidad y explicar cómo debe ser interpretada; y (3), sobre esta base, distinguir y analizar las implicaciones que para la ciencia y la filosofía tiene dicho proyecto con respecto al problema de la reducción teórica en biología. Por último, acercarnos a la relación existente entre las ciencias físicas y las ciencias biológicas