Informatics: the fuel for pharmacometric analysis

The current informal practice of pharmacometrics as a combination art and science makes it hard to appreciate the role that informatics can and should play in the future of the discipline and to comprehend the gaps that exist because of its absence. The development of pharmacometric informatics has important implications for expediting decision making and for improving the reliability of decisions made in model-based development. We argue that well-defined informatics for pharmacometrics can lead to much needed improvements in the efficiency, effectiveness, and reliability of the pharmacometrics process. The purpose of this paper is to provide a description of the pervasive yet often poorly appreciated role of informatics in improving the process of data assembly, a critical task in the delivery of pharmacometric analysis results. First, we provide a brief description of the pharmacometric analysis process. Second, we describe the business processes required to create analysis-ready data sets for the pharmacometrician. Third, we describe selected informatic elements required to support the pharmacometrics and data assembly processes. Finally, we offer specific suggestions for performing a systematic analysis of existing challenges as an approach to defi ning the next generation of pharmacometric informatics

Methodological approaches and techniques for designing ontologies in information systems requirements engineering

Programa doutoral em Information Systems and TechnologyThe way we interact with the world around us is changing as new challenges arise, embracing innovative business models, rethinking the organization and processes to maximize results, and evolving change management. Currently, and considering the projects executed, the methodologies used do not fully respond to the companies' needs. On the one hand, organizations are not familiar with the languages used in Information Systems, and on the other hand, they are often unable to validate requirements or business models. These are some of the difficulties encountered that lead us to think about formulating a new approach. Thus, the state of the art presented in this paper includes a study of the models involved in the software development process, where traditional methods and the rivalry of agile methods are present. In addition, a survey is made about Ontologies and what methods exist to conceive, transform, and represent them. Thus, after analyzing some of the various possibilities currently available, we began the process of evolving a method and developing an approach that would allow us to design ontologies. The method we evolved and adapted will allow us to derive terminologies from a specific domain, aggregating them in order to facilitate the construction of a catalog of terminologies. Next, the definition of an approach to designing ontologies will allow the construction of a domain-specific ontology. This approach allows in the first instance to integrate and store the data from different information systems of a given organization. In a second instance, the rules for mapping and building the ontology database are defined. Finally, a technological architecture is also proposed that will allow the mapping of an ontology through the construction of complex networks, allowing mapping and relating terminologies. This doctoral work encompasses numerous Research & Development (R&D) projects belonging to different domains such as Software Industry, Textile Industry, Robotic Industry and Smart Cities. Finally, a critical and descriptive analysis of the work done is performed, and we also point out perspectives for possible future work.A forma como interagimos com o mundo à nossa volta está a mudar à medida que novos desafios surgem, abraçando modelos empresariais inovadores, repensando a organização e os processos para maximizar os resultados, e evoluindo a gestão da mudança. Atualmente, e considerando os projetos executados, as metodologias utilizadas não respondem na totalidade às necessidades das empresas. Por um lado, as organizações não estão familiarizadas com as linguagens utilizadas nos Sistemas de Informação, por outro lado, são muitas vezes incapazes de validar requisitos ou modelos de negócio. Estas são algumas das dificuldades encontradas que nos levam a pensar na formulação de uma nova abordagem. Assim, o estado da arte apresentado neste documento inclui um estudo dos modelos envolvidos no processo de desenvolvimento de software, onde os métodos tradicionais e a rivalidade de métodos ágeis estão presentes. Além disso, é efetuado um levantamento sobre Ontologias e quais os métodos existentes para as conceber, transformar e representar. Assim, e após analisarmos algumas das várias possibilidades atualmente disponíveis, iniciou-se o processo de evolução de um método e desenvolvimento de uma abordagem que nos permitisse conceber ontologias. O método que evoluímos e adaptamos permitirá derivar terminologias de um domínio específico, agregando-as de forma a facilitar a construção de um catálogo de terminologias. Em seguida, a definição de uma abordagem para conceber ontologias permitirá a construção de uma ontologia de um domínio específico. Esta abordagem permite em primeira instância, integrar e armazenar os dados de diferentes sistemas de informação de uma determinada organização. Num segundo momento, são definidas as regras para o mapeamento e construção da base de dados ontológica. Finalmente, é também proposta uma arquitetura tecnológica que permitirá efetuar o mapeamento de uma ontologia através da construção de redes complexas, permitindo mapear e relacionar terminologias. Este trabalho de doutoramento engloba inúmeros projetos de Investigação & Desenvolvimento (I&D) pertencentes a diferentes domínios como por exemplo Indústria de Software, Indústria Têxtil, Indústria Robótica e Smart Cities. Finalmente, é realizada uma análise critica e descritiva do trabalho realizado, sendo que apontamos ainda perspetivas de possíveis trabalhos futuros

Product information management for complex modular security systems

Um sistema PIM gere toda a informação que possibilita a comercialização dos produtos através de diferentes canais. A sua importância durante o ciclo de vida de um produto aumentou devido à sofisticação técnica dos produtos, a gerir internamente e a publicar externamente. Sistemas, tais como o ERP e o CCMS, deverão integrar-se com um sistema PIM, o qual deve funcionar como a “espinha dorsal” da informação de produto. O presente projeto tem como objetivo principal a criação de uma solução para gerir a informação de produto para sistemas modulares complexos. A proposta de solução inclui a criação de uma ontologia para parte dos inúmeros sistemas disponíveis no catálogo de produtos de uma das maiores organizações multinacionais do setor de engenharia e tecnologia a nível mundial. O processo de criação da solução proposta baseou-se na metodologia de investigação pesquisa-ação e foi dividido em cinco fases. Na fase de diagnóstico descreveu-se e analisou-se a atual situação dos sistemas ERP e CCMS que gerem o catálogo online dos sistemas de produtos comercializados. Levantaram-se ainda as taxonomias de produto atuais e elaborou-se a proposta. Na fase de planeamento da ação descreveram-se a equipa de trabalho, a abordagem inspirada na metodologia Agile usada para desenvolver a solução, as reuniões de planeamento, os parceiros de trabalho, as ferramentas a usar e a sua justificação. Na fase de tomada de ação foi descrito o processo de criação da solução ontológica e o resultado final, incluindo a construção das novas taxonomias e a sua validação pelos especialistas. Propuseram-se exemplos e representações gráficas usando a ferramenta Protégé. Na fase de avaliação, a solução ontológica foi testada, tendo-se validado que os requisitos necessários foram satisfeitos pela estrutura. Na fase de especificação de aprendizagem propuseram-se os próximos passos para a implementação e gestão futura do modelo ontológico. Com esta solução, a organização poderá gerir mais eficientemente a informação de produto e a estrutura de dados. Ela possui versatilidade para gerir produtos individuais ou sistemas modulares complexos e melhorar a sua comunicação com o cliente. Além disso, a ontologia tem ainda um enorme potencial se combinada com técnicas de IA. Algumas limitações do projeto e propostas de trabalhos futuros foram ainda apresentadas

EDOC2011 PhD Student Symposium Proceedings

Post-proceedings of the EDOC2011 PhD Student Symposium held in Helsinki 26.8.2011.Peer reviewe

Accounting Historians Journal, 1988, Vol. 15, no. 1 [whole issue]

Spring issu

Rapid Circumstellar Disk Evolution and an Accelerating Star Formation Rate in the Infrared Dark Cloud M17 SWex

We present a catalog of 840 X-ray sources and first results from a 100 ks Chandra X-ray Observatory imaging study of the filamentary infrared dark cloud G014.225$-$00.506, which forms the central regions of a larger cloud complex known as the M17 southwest extension (M17 SWex). In addition to the rich population of protostars and young stellar objects with dusty circumstellar disks revealed by Spitzer Space Telescope archival data, we discover a population of X-ray-emitting, intermediate-mass pre--main-sequence stars (IMPS) that lack infrared excess emission from circumstellar disks. We model the infrared spectral energy distributions of this source population to measure its mass function and place new constraints on the inner dust disk destruction timescales for 2-8 $M_{\odot}$ stars. We also place a lower limit on the star formation rate (SFR) and find that it is quite high ($\dot{M}\ge 0.007~M_{\odot}$ yr$^{-1}$), equivalent to several Orion Nebula Clusters in G14.225$-$0.506 alone, and likely accelerating. The cloud complex has not produced a population of massive, O-type stars commensurate with its SFR. This absence of very massive (${\ge}20~M_{\odot}$) stars suggests that either (1) M17 SWex is an example of a distributed mode of star formation that will produce a large OB association dominated by intermediate-mass stars but relatively few massive clusters, or (2) the massive cores are still in the process of accreting sufficient mass to form massive clusters hosting O stars.Comment: 29 pages, 9 figures, accepted to Ap