33 research outputs found

    An脿lisi de patrons funcional i estructurals en la regulaci贸 del calci en les c猫l路lules card铆aques

    Get PDF
    Tesi sotmesa a embargament des de la data de defensa fins al dia 16 de setembre de 2022In 2019 the data published by the World Health Organization showed that the cardiac ischemia is the first cause of death worldwide. These diseases are caused by irregularities of the contractile mechanism鈥檚 function, starting from the cellular level till the organ dysfunction. To further understand the origin of these dysfunctions the thesis will focus on the molecular and cellular level. The small changes of the physiology at that level can lead to an anomalous cardiac electrophysiology. The previous studies suggest that there is a relation between the cardiac arrhythmia and the increase of global spontaneous calcium activity in cells. Ryanodine receptors have the major role in the calcium regulation. They release the calcium stored in the sarcoplasmic reticulum into the cytosol, then the calcium attaches to the actin and myosin to produce the mechanical contraction of the cell. The irregularities have been also related with an hyperphosphorylation of the ryanodine receptor channels, which increases the open probability of those. A large amount of data is generated in the biology and physiology laboratories, these have to be characterized, clustered and analysed to extract the meaning of the observed divergences. Thus, an interdisciplinary thesis has been developed in order to obtain experimental data with a confocal microscope in the laboratory and then creating new image processing tools in order to have an interpretable analysis of the experimental data. The main objective of the project is to characterize the spontaneous calcium activity through image processing tools and to observe its variations under different physiological conditions, such as the hiperphosphorylation of the ryanodine receptor channels or under cardiac arrhythmia conditions. The aim is to see how the modifications in the calcium activity affect to the propagation along the cell and report how the variations may lead to electric and contractile dysfunctions, and so, cause arrhythmias. To reach this goals the thesis is divided into three main sections or hypothesis: 1. Experimental data acquisition, define the best image acquisition method in order to develop the studies of calcium images and proposal of methods to detect subcellular structures and spontaneous calcium events. 2. Study of the calcium events substructure and the involved ryanodine receptor clusters. Comparison of the calcium activity properties of the cells at the basal level and under conditions of hyperphosphorylation or arrhythmia. 3. Study of the physiological modifications in the calcium activity through different phosphorylation pathways.The results explain the ryanodine receptor clusters distribution through the cells, allow to have the localization of the channels and the calcium activity simultaneously and show relevant details such as, the increase in the duration of the events or the increase in the volume of calcium released when more ryanodine receptor clusters are co-activated. These modifications lead to have bigger events and, thus, more potentially dangerous because can depolarize the neighbouring cells. The parameters reflect the relationship between the phosphorylation of the ryanodine receptors and the spontaneous calcium release in the arrhythmogenesis process.Segons les dades publicades per l'Organitzaci贸 Mundial de la Salut el 2019, la isqu猫mia card铆aca 茅s la causa de mortalitat que ocupa el primer lloc a nivell mundial. Aquesta patologia 茅s deguda a irregularitats en el funcionament del mecanisme contr脿ctil, comen莽ant a nivell cel路lular, fins arribar a nivell d'貌rgan. Per arribar a l'arrel d'aquestes disfuncions, en aquesta tesi es realitzar脿 un estudi a nivell cel路lular i molecular. Els petits canvis en aquest nivell poden arribar a escalar cap a una electrofisiologia card铆aca an貌mala. Durant els darrers anys, els estudis de fisiologia card铆aca han relacionat les ar铆tmies amb l'augment de l'activitat espont脿nia de calci global a nivell cel路lular. Els principals encarregats de regular el calci en les c猫l路lules dels mi貌cits card铆acs s贸n els receptors de rianodina, que alliberen el calci emmagatzemat al reticle sarcoplasm脿tic al citosol. Aquest s'uneix a l'actina i la miosina de la c猫l路lula produint la contracci贸 mec脿nica. Les irregularitats en l'activitat de calci han estat relacionades amb la fosforilaci贸 d'aquests canals, ja que un cop fosforil路lats la probabilitat d'obertura dels receptors augmenta. Als laboratoris de biologia i fisiologia es treballa amb volums relativament grans dades experimentals, que posteriorment s'han de caracteritzar, agrupar i donar un sentit als canvis observats. En vista d'aquest fet, s'ha volgut realitzar una tesi interdisciplin脿ria, adquirint dades amb el microscopi confocal al laboratori i creant noves eines de processament d'imatges per facilitar una an脿lisi interpretable de les dades experimentals. L'objectiu principal del projecte 茅s caracteritzar l'activitat espont脿nia del calci mitjan莽ant t猫cniques de processament d鈥檌matge i observar les variacions d'aquesta amb diferents condicions fisiol貌giques, com ara la fosforilaci贸 dels receptors de rianodina o amb c猫l路lules de pacients amb ar铆tmia. Veure com les modificacions en l'activitat de calci afecten a la propagaci贸 d'aquest al llarg de la c猫l路lula i caracteritzar la perillositat de les variacions a l鈥檋ora d'induir un mal funcionament el猫ctric i contr脿ctil i, per tant, donar a lloc ar铆tmies. En motiu d'assolir aquest objectius la tesis es divideix en tres grans apartats o hip貌tesis: 1. Obtenci贸 de dades experimentals, definici贸 del millor m猫tode per realitzar els estudis de les imatges de calci i proposta d鈥檜n m猫tode de detecci贸 i quantificaci贸 d'estructures cel路lulars i esdeveniments de calci. 2. Estudi de la subestructura dels esdeveniments de calci i els cl煤sters de receptors de rianodina involucrats. Comparaci贸 de les propietats de l'activitat de calci de les c猫l路lules a nivell basal i sota condicions d'ar铆tmia o fosforilaci贸. 3. Estudi dels canvis electrofisiol貌gics en l鈥檃ctivitat del calci emprant diferents vies de fosforilaci贸 dels canals de receptors de rianodina. Els resultats obtinguts expliquen la distribuci贸 dels receptors de rianodina en les c猫l路lules, permeten tenir una visi贸 de les activacions d'aquests canals durant l'activitat espont脿nia de calci i mostren detalls rellevants, com ara l'augment de la durada, l'augment en el volum de calci alliberat i l'augment del nombre de cl煤sters receptors de rianodina activats. Aquestes modificacions provoquen esdeveniments m茅s grans i, per tant, m茅s potencialment perillosos, ja que poden arribar a despolaritzar c猫l路lules ve茂nes. Aquests par脿metres reflecteixen la relaci贸 entre la fosforilaci贸 dels receptors de rianodina i l'alliberament espontani de calci durant el proc茅s d'aritmog猫nesi.Postprint (published version
    corecore