Fusarium in wheat. Effects of soil fertility strategies and nitrogen levels on mycotoxins and seedling blight.

In a two-year field experiment in the Netherlands the relation between three soil fertility strategies, additional nitrogen levels and Fusarium Head Blight in wheat are explored. There was a substantial year-effect, as could be expected. The soil fertility strategies showed differences, but were party coinciding with location. Although not consistent over the years and strategies, a significant relation was found between additional nitrogen applications around anthesis and FHB, expressed as presence of mycotoxines (DON) and Total Root Rot from the Blotter test. Higher nitrogen levels from fertilizer applications at anthesis give a higher chance on FHB, with other so far unknown factors playing a role

Effet des champignons sur le taux d’éclosion des oeufs d’Achatina fulica et détection de mycotoxines

L’objectif de la présente recherche est de caractériser le potentiel toxinogène des souches fongiques productrices de mycotoxines sur le taux d’éclosion des oeufs d’Achatina fulica.A cet effet, l’inoculum pour l’infestation de la sciure de bois stérilisée, a été préparé séparément à partir de la souche pure de chacun des champignons et de l’association des champignons âgés d’une semaine. Chaque entité a été broyée et mélangé dans un erlenmeyer à 600 ml d’eau distillée stérile puis agité pendant une minute. Pour la chromatographie, les oeufs désinfectés ont été ensemencés sur les souches individuelles, associées à deux et à trois. Les différentes souches ont été isolées à partir de la litière d’élevage et des substrats d’incubation des oeufs d’Achatina fulica. L’HPLC a permis l’identification des mycotoxines à partir des souches pures de champignons cultivées en présente des oeufs d’Achatina fulica. A l’issue de l’inoculation individuelle, les taux d’éclosion auxquels nous sommes parvenus sont compris entre 8,88% et 67,40%. Ces taux d’éclosion sont très faibles lorsqu’il s’agit d’Aspergillus niger et assez élevé en présence de Penicillium sp. Penicillium sp., Phoma sp. et Fusarium oxysporum occasionnent des taux d’éclosion supérieur à la moyenne. D’autre part, les taux obtenus après les associations sont compris entre 5,18% et 53,32%. En ce qui concerne les mycotoxines, les aflatoxines B1, G1, G2 et l’ochratoxine A ont été détectées au niveau des inoculations individuelles et les aflatoxines uniquement au niveau des associations à des quantités variables et assez faibles. Les mycotoxines produites agissent sur le taux d’éclosion des oeufs d’Achatina fulica en les réduisant considérablement par l’intermédiaire des champignons. Seule l’association Mucor sp.- Penicillium decumbens donne un taux d’éclosion de 53,32% légèrement au dessus de la moyenne et peut être considérée comme une association à caractère bénéfique pour les oeufs d’Achatina fulica.Mots clés: Inoculation, association, incubation, mycotoxines, pathogène, champignonsEnglish Title: Effect of mushrooms on the rate of hatchind of egg of Achatina fulica and detection of mycotoxinsEnglish AbstractThe objective of this research is to characterize the potential toxin-producing strains of fungal mycotoxins on hatchability of Achatina fulica of eggs.To this end, the inoculum for infection of the sterilized sawdust was separately prepared from the pure strain of each of the fungi and the association of fungi aged one week. Each entity was ground and mixed in an Erlenmeyer flask in 600 ml of sterile distilled water and stirred for one minute. For chromatography, the disinfected eggs were seeded on individual strains, associated with two and three. The different strains were isolated from breeding litter substrates and incubation of eggs Achatina fulica. HPLC allowed the identification  of mycotoxins from pure strains of fungi grown in features of Achatina fulica eggs. After individual inoculation, hatching rates we have achieved are between 8.88% and 67.40%. These hatching rates are very low in the case of Aspergillus niger and quite high in the presence of Penicillium sp. Penicillium sp., Phoma sp. and Fusarium oxysporum cause of hatching rate above average. On the other hand, the levels achieved following associations are between 5.18% and 53.32%. Regarding mycotoxins, aflatoxins B1, G1, G2 and ochratoxin A were detected in individual inoculations and aflatoxins only in associations at varying and quite small amounts. Mycotoxins produced act on hatchability of fulica Achatina eggs significantly reducing through fungi. Only Mucor sp.- Penicillium decumbens association provides a hatching rate of 53.32% slightly above average and can be considered a beneficial nature association for eggs of Achatina fulica.Keywords: Inoculation, association, incubation, mycotoxins, pathogenic fung

Évaluation des pratiques post récolte favorables à la contamination de l’arachide par les mycotoxines dans trois régions de Côte d’Ivoire

Objectif: Les techniques post récoltes jouent un rôle déterminant dans la contamination de l’arachide par les aflatoxines. Cette étude a pour objectif de contribuer à réduire la contamination de l’arachide par les aflatoxines en Côte d’Ivoire par l’identification des pratiques post récoltes à risque.Méthodologie et résultats: Un questionnaire a permis de recueillir les renseignements sur lesdites pratiques dans trois régions : nord, centre et ouest. Le séchage de l’arachide se fait au soleil quel que soit la localité et dure en moyenne 4 à 14 jours. Les arachides sont séchées et conservées en coques dans le nord. Dans les zones de centre et ouest, les gousses sont soit séchées puis décortiquées, soit décortiqués avant séchage. Le stockage des graines ou des gousses se fait dans des sacs en polyéthylène dans les maisons (86%) ou en vrac dans des greniers (14%). La récolte peut être conservée jusqu’à 9 mois avant consommation ou vente. 58,1% des productrices ont des pertes dues à l’effet des moisissures. La contamination fongique de l’arachide s’opère dans 55,8 % des cas, durant le séchage et le stockage, et dans 34,9 % des cas au cours de l’apparitiondes fleurs au champ.Conclusion et application des résultats: Les étapes de séchage et de stockage représentent un risque de contamination par les aflatoxines. Une maitrise des techniques post récolte permettrait de réduire la contamination par les aflatoxines. Il ressort de cette étude qu'une formation des productrices aux bonnes pratiques de production réduirait la contamination parcours aflatoxines.Mots clés: post-récolte, séchage, conservation, arachide, aflatoxinesEnglish Title: Evaluation of post-harvest practices favorable to the contamination of peanut by mycotoxins in three regions of Côte d'IvoireEnglish AbstractObjective: Post harvest techniques take a decisive role in peanuts by aflatoxins contamination. The aim of this study is to help to reduce aflatoxin contamination of groundnuts in Côte d'Ivoire by identifying post-harvest practices at risk.Methodology and results: A survey permit to collect information on post-harvest practices in three regions: north, center and west. Peanuts are dried at sun whatever the locality and lasts on average 4 to 14 days. Peanuts are dried and kept in pods in the north. In the central and western areas, pods are either dried and then shelled, or shelled before drying. The storage of seeds or pods is done in polythene bags in homes (86%) or bulk in granaries (14%). Peanuts can be kept until 9 months before consumption or sale. 58.1% of producers have losses due to effect of molds. Fungal contamination of peanuts occurs in 55.8% of cases, during drying and storage, and in 34.9% of cases during flowering in the field.Conclusion and application of results: Drying and storage stages represent a risk of contamination by aflatoxins. Mastering post-harvest techniques would reduce aflatoxin contamination. This study shows that training producers in good production practices would reduce aflatoxin contamination.Keywords: post-harvest, drying, storage, peanut, aflatoxin

Caractérisation de sources de résistance à la fusariose chez le blé dur

National audienceFacing the increasing problem of Fusarium head blight with durum wheat caused by different species of Fusarium, a study was undertaken with the help of the Ministry in charge for agriculture. This study made it possible to assess the resistance of different sub-species of Triticum turgidum. The populations with the most resistant accessions belong to the sub-species T. turgidum dicoccum. Going deeper into this study showed that this resistance was a type 2 one: slow progression of necrosis after contamination of one spikelet per spike. One accession, TRI2215, exhibited very high level of resistance, but it is very high and very late accession, this will make this accession difficult to be used in breeding. This justifies a QTL search for Fusarium resistance. The analysis of the determinant for Fusarium aggressiveness confirmed that a great part was linked with the production of mycotoxins. Several phenol compounds seemed to play a part in the resistance of the plant. A qualitative analysis of the Fusarium flora on the spikes allowed identifying six major Fusarium species and to associate them with the different mycotoxins. A close genus, Microdochium, did not produce mycotoxins. We also showed that the amount of mycotoxins in an organ was related to the fungus DNA in the organ.Face au problème croissant chez le blé dur de la fusariose des épis causée par différentes espèces de Fusarium sp., une étude a été entreprise, avec le concours du Ministère chargé de l’Agriculture. Cette étude a permis d’évaluer la résistance de différentes sous-espèces de Triticum turgidum. Les populations contenant le plus d’individus résistants sont issues de la sous-espèce T. turgidum dicoccum. Une étude plus approfondie a permis de montrer cette résistance était de type 2 : faible progression des symptômes après la contamination d’un épillet par épi. Un géniteur, TRI2215, montre un niveau de résistance particulièrement intéressant, mais est très haut et très tardif, ce qui le rendra difficile à utiliser. C’est pourquoi une recherche de QTL a été entreprise sur ce géniteur. L’analyse des déterminants de l’agressivité des Fusarium confirme qu’elle vient en grande partie des mycotoxines. Différents composés phénoliques semblent aussi jouer un rôle dans la résistance de la plante. Une analyse qualitative de la flore fusarienne des épis a permis d’identifier six espèces majeures de Fusarium et de les associer avec les différentes mycotoxines, et qu’un genre proche, Microdochium, ne produisait pas de mycotoxines. Il a montré aussi que la quantité de mycotoxines dans un organe était proportionnelle à la quantité d’ADN du champignon dans l’organe

Contamination fongique des fourrages consommes par les aulacodes (Thryonomys swinderianus) d’elevage en zone periurbaine d’Abidjan (Côte d’Ivoire)

Le fourrage prélevé dans les zones urbaines et périurbaines est de plus en plus utilisé dans l’alimentation des herbivores domestiques, en général, et de l’Aulacode, en particulier. Ce fourrage souvent en contact avec des déchets ménagers pourrait être contaminé par les spores fongiques decet environnement. L’objectif général de cette étude consistait à évaluer quelques risques sanitaires que court l’homme en consommant la viande d’Aulacode nourris au fourrage urbain et périurbain. L’objectif spécifique était d’identifier les genres fongiques retrouvés sur deux espèces  fourragères (Panicum maximum et Pueraria phaseoloïdes) fréquemment utilisées par les aulacodiers pour nourrir leurs animaux. Pour atteindre cet objectif, des fragments de fourrage ont été mis en culture sur le milieu Potato Dextrose Agar (PDA) en vue de déceler d’éventuels  microorganismes. Cette étude a permis de relever la présence de quatre genres de moisissure : Aspergillus, Alternaria, Penicillium et Fusarium. Certaines espèces appartenant à ces genres sont généralement   impliquées dans des mycoses chez les animaux et des maladies  fongiques chez les végétaux. Ainsi, les genres Aspergillus et Fusarium sont respectivement zoonotique et immunosuppresseur qui constitue un risque pour les collecteurs de fourrage et les éleveurs.Mots clés : Moisissure, contamination, Panicum, Pueraria, Aulacode