Separando a influência da variação climática e da distância geográfica na estrutura genética da castanheira-do-Brasil na Amazônia brasileira : a importância do delineamento amostral

A genômica da paisagem estuda a distribuição geográfica da variação genética em escala genômica. O grande desafio é separar os efeitos do isolamento por distância (isolation by distance – IBD) e do isolamento por ambiente (isolation by environment – IBE) na diferenciação genética. Um delineamento amostral inadequado dificulta a separação dos efeitos da distância geográfica e dos gradientes ambientais na estrutura genética e a identificação de regiões genômicas potencialmente envolvidas na adaptação local. O objetivo deste estudo é determinar o delineamento amostral mais adequado para estudar a genômica da paisagem da castanheira-do-Brasil (Bertholletia excelsa) em toda a sua distribuição na Amazônia brasileira. O banco de dados inclui 51 potenciais pontos de amostragem. Estes foram comparados com dados de 489 localizações obtidas de um trabalho de modelagem ecológica. Para todas as 540 localizações foi feito o download de 19 variáveis bioclimáticas na plataforma Worldclim e excluídas as variáveis altamente correlacionadas (|| ≥ 0,70). Seis variáveis foram mantidas para análise das distâncias climáticas. Para cada variável, as distâncias geográficas e climáticas foram plotadas em gráficos de dispersão e histogramas. Todas as análises foram realizadas no ambiente computacional R. Nossos resultados mostram que o delineamento amostral de apenas 44 pontos amostrais é adequado para separar IBD e IBE, uma vez que toda a gama de possíveis distâncias geográficas e climáticas entre pares de populações estão bem representadas. Além do mais, os 44 pontos amostrais representam a ampla variação climática ao longo da área de distribuição da B. excelsa na Amazônia brasileira e serão amostrados para análises genéticasFil: Garuti, Giovana. Universidade Federal de Sao Carlos (Brasil)Fil: Costa, Patricia. Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaFil: Thomas, Evert. Bioversity InternationalFil: Wadt, Lúcia Helena. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuári

Bioinformática relacionada à descoberta de genes associados com características de interesse econômico em animais pecuários: relatório de pós doutorado.

Descrição das atividades desenvolvidas e resultados obtidos; Desenvolvimento e adaptação de delineamentos experimentais para estudos de genômica genética; Desenvolvimento de ferramentas automatizadas para estudos de genômica genética; Delineamento de um estudo de validação de um micro-arranjo de cDNA para estudos de expressão gênica em suínos; Outras atividades.bitstream/item/63861/1/DT71.pdfDocumento disponível no formato online

Treinamento de força bi-set em mulheres

Objetivo: O presente trabalho teve como objetivo avaliar se o treinamento de força bi-set induz alterações de testosterona e cortisol séricos, do índice T/C (razão testosterona: cortisol), da força muscular, da gordura e da massa magra em mulheres jovens, após treinamento por 8 semanas. Metodologia: Os parâmetros corporais e as concentrações séricas de testosterona e cortisol foram determinados no repouso e, imediatamente, após o treinamento, antes do início e após 8 semanas. Utilizou-se o método bi-set, com 4 séries e 10 repetições máximas para cada exercício, com intervalo entre as séries de 90 s, realizados quatro vezes por semana, por 8 semanas. Resultados e discussão: Após o período de treinamento não houve alteração significativa (p>0,05) nos níveis séricos de testosterona e cortisol, da massa corporal e do IMC, contudo, houve, significativamente (p<0,05) aumento de 1-RM e do número de repetições máximas, diminuição da gordura corporal, aumento de massa magra e aumento da área da seção transversa muscular do braço e da coxa. Conclusão: Os níveis séricos de testosterona e cortisol não são os únicos fatores para o ganho de força e hipertrofia muscular. O método bi-set promoveu adaptações positivas em mulheres

Agrupamentos gênicos envolvidos na biosíntese de metabólitos secundários no fungo entomopatogênico Metarhizium anisopliae : identificação genômica e padrões de expressão em cutículas do carrapato Rhipicephalus microplus

O gênero Metarhizium abriga fungos cosmopolitas que infectam hospedeiros artrópodes. Curiosamente, enquanto algumas espécies do gênero infectam um amplo espectro de hospedeiros (hospedeiro-generalistas), outras espécies infectam apenas alguns artrópodes (hospedeiro-especialistas). Esse traço evolutivo singular permite comparações únicas, a fim de determinar como patógenos e fatores de virulência surgem. Dentre os diversos fatores de virulência descritos, se destacam os metabólitos secundários que hipoteticamente desempenhem papéis essenciais na infecção fúngica. No entanto, a maioria dos genes para a produção de metabólitos secundários em Metarhizium spp. não foram ainda caracterizados, e pouco se sabe sobre a organização gênomica, expressão e regulação destes genes. A fim de melhor compreender estes aspectos, nós realizamos uma análise e descrição detalhada de agrupamentos gênicos (clusters) envolvidos na biossíntese de metabólitos secundários em M. anisopliae, analisamos dados de um estudo transcritômico onde o fungo foi cultivado em cutículas de carrapato avaliando a expressão diferencial destes clusters, bem como avaliamos a conservação destes genes entre espécies do gênero Metarhizium. Ademais, nossa análise se estendeu avaliando aspectos evolutivos e filogenéticos para três clusters: MaPKS1 cujo produto é putativamente assemelhado a tropolonas e citrininas, MaNRPS-PKS2 cujo produto é putativamente assemelhado a pseurotina e MaTERP1 cujo produto putativo é o ácido helvólico. Dentre os 73 clusters identificados no genoma de M. anisopliae, 20 % estavam positivamente regulados na condição experimental de infecção inicial, com presumível papel na virulência do fungo. Dentre os clusters positivamente regulados estão genes já caracterizados envolvidos na biossíntese de destruxinas, NG39x e ferricrocina, em conjunto com genes putativamente envolvidos na biossíntese do ácido helvólico, produtos assemelhados a pseurotina e tropolonas e citrininas, além de genes envolvidos na biossíntese de compostos desconhecidos. Curiosamente, diversos clusters positivamente regulados na condição de infecção inicial não estão presentes em espécies hospedeiro-especialistas do gênero Metarhizium, indicando que existem diferenças nas estratégias metabólicas empregadas por espécies hospedeiro-generalistas e hospedeiro-especialistas no ciclo infeccioso. Estas diferenças no potencial metabólico podem ter sido parcialmente moldadas por eventos de transferência horizontal, conforme sugere nossa análise filogenética sobre a origem do o cluster putativamente envolvido na biossíntese do ácido helvólico em Metarhizium spp. Em conclusão, diversos clusters desconhecidos são descritos e aspectos da sua organização, regulação e origem são discutidos, fornecendo evidências sobre o impacto dos metabólitos secundários no ciclo de vida e infecção de espécies do gênero Metarhizium.The Metarhizium genus harbors cosmopolitan fungi that infect arthropod hosts. Interestingly, while some species infect a wide range of hosts (host-generalists), other species infect only a few arthropods (host-specialists). This singular evolutionary trait permits unique comparisons to determine how pathogens and virulence determinants emerge. Among the several virulence determinants that have been described, secondary metabolites (SMs) are suggested to play essential roles during fungal infection. However, the majority of genes related to SM production in Metarhizium spp. are uncharacterized, and little is known about their genomic organization, expression and regulation. To better understand these aspects, we have performed a deep survey and description of SM biosynthetic gene clusters (BGCs) in M. anisopliae, analyzed RNA-seq data from fungi grown on cattle-tick cuticles, evaluated the differential expression of BGCs, and assessed conservation within the Metarhizium genus. Furthermore, our analysis extended to the construction of a phylogeny for the following three BGCs: a tropolone/citrinin-related compound (MaPKS1), a pseurotin-related compound (MaNRPS-PKS2), and a putative helvolic acid (MaTERP1). Among 73 BGCs identified in M. anisopliae, 20% were up-regulated during initial tick cuticle infection and presumably possess virulence-related roles. These up-regulated BGCs include known clusters, such as destruxin, NG39x and ferricrocin, together with putative helvolic acid and pseurotin- and tropolone/citrinin-related compound clusters, as well as uncharacterized clusters. Interestingly, several up-regulated BGCs were not conserved in host-specialist species from the Metarhizium genus, indicating differences in the metabolic strategies employed by generalist and specialist species to overcome and kill their host. These differences in metabolic potential may have been partially shaped by horizontal gene transfer (HGT) events, as our phylogenetic analysis provided evidence that the putative helvolic acid cluster in Metarhizium spp. originated from an HGT event. In conclusion several unknown BGCs are described, and aspects of their organization, regulation and origin are discussed, providing evidence for the impact of SMs on the Metarhizium genus lifestyle and infection process

Determination of lignocellulolytic properties and genetic study of wild microorganisms isolated from different brazilian regions for bioethanol production

Orientadores: Francisco Maugeri Filho, Gonçalo Amarante Guimarães PereiraTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de AlimentosResumo: O etanol vem novamente despertando de modo crescente a atenção de pesquisadores, empresas e governo, devido ao aumento do preço do petróleo e perspectivas de esgotamento das fontes não-renováveis de combustíveis fósseis, bem como, preocupações de natureza ambiental, relacionadas à emissão de substâncias que comprometem o meio ambiente. O estabelecimento de metas extremamente ambiciosas para aumento do consumo do etanol nos próximos anos requer um aumento substancial da produção de etanol e, nesse sentido, estimula a pesquisa e o desenvolvimento de tecnologias que permitem o uso de novas matérias-primas na produção de etanol, como a biomassa lignocelulósica. No entanto a ampliação desta tecnologia é limitante devido ao alto custo das enzimas, indicando desta forma a importância da busca por novas fontes de enzimas capazes de contribuir para este processo. Em face disto, este trabalho teve como objetivo estudar as propriedades lignocelulolíticas de micro-organismos silvestres isolados de diversas regiões brasileiras, bem como realizar um estudo genético visando à produção de bioetanol. Inicialmente foi realizada uma seleção das cepas que apresentaram capacidade de produção de celulases, a partir de micro-organismos silvestres isolados de diversas regiões do país. Após a seleção, a cepa nomeada AAJ6 foi selecionada como potencial produtor de celulases e identificada molecularmente como Acremonium strictum. Posteriormente, foram realizados estudos de recuperação, purificação e caracterização enzimática das enzimas produzidas pelo microorganismo em estudo. A precipitação com acetona 60% foi o método que resultou em melhores porcentagens de recuperação, registrando 80,67% de recuperação para as endoglucanases (CMCase), 65% para a atividade de papel de filtro (FPase) e 25% para celobiase. Em relação à purificação, a resina Q-Sepharose foi selecionada como mais eficiente para a purificação das enzimas do complexo celulase produzidas por Acremonium strictum. Quanto à caracterização enzimática, as faixas de temperatura e pH estudadas não tiveram diferença significativa (p<0,05) em relação à atividade de endoglucanase (CMCase). Já para a atividade de FPase e celobiase, a faixa temperatura ótima foi de 54 a 57 °C e o pH ótimo foi de 4,7. Para a b-glicosidase, apenas a temperatura foi significativa, favorecendo temperaturas mais elevadas (54 a 57 °C) para a atividade enzimática. Paralelamente conduziram-se fermentações para produção de celulases empregando diferentes substratos, tanto substratos comerciais (carboximetilcelulose, SERVACEL® e AVICEL®) como bagaços de cana-de-açúcar pré¿tratados com diferentes intensidades. O bagaço de cana submetido a um pré-tratamento leve (12 kgf/cm²; 188,5°C) foi o que melhor induziu o micro-organismo em estudo a produzir as maiores atividades celulolíticas em comparação aos demais substratos estudados, registrando valores máximos de CMCase de 134,42 U/L em 240 horas de fermentação, 10,82 U/L de FPase em 192 horas, 27,72 U/L de celobiase em 96 horas e 3,48 U/L de b-glicosidase em 240 horas. Com o avanço da biotecnologia e da biologia molecular, a identificação de genes presentes num determinado micro-organismo já se tornou essencial. Em face disto, foi realizado o sequenciamento 454 do genoma do Acremonium strictum e dois genes de celulases foram identificados, sendo um gene de endoglucanase da família 74a e um gene de b-glicosidase. Estas enzimas foram isoladas, sequenciadas e clonadas em E.coli através do vetor pGEM-T Easy de forma que futuros trabalhos possam abordar os produtos de expressão destas enzimas em Saccharomyces cerevisiae visando à produção de bioetanol de segunda geraçãoAbstract: Ethanol has increasingly attracted the attention of researchers, companies and governments due to the increase in oil prices and prospects of depletion of nonrenewable fossil fuels, as well as environmental concerns related to emissions of substances that compromise the environment. Excessively ambitious goals for the increased consumption of ethanol in the for the years ahead requires a substantial increase in ethanol production and, accordingly, encourages research and development of technologies that allow the use of new raw materials for ethanol production, such as lignocellulosic biomass. However the expansion of this technology is limited due to the high cost of enzymes, thus indicating the importance of searching for new sources of enzymes able to contribute to this process. In the face of this, the present work intended to study the lignocellulolytic properties of wild microorganisms isolated from various regions of Brazil as well as conducting a genetic study aimed at producing bioethanol. Initially a selection of strains that were capable of producing cellulases was carried out. Than, the the selected strain, named AAJ6 and molecularly identified as Acremonium strictum, was shown to be a potential producer of cellulases. Subsequently, studies were performed for recovery, purification and characterization of the enzymes produced by this microorganism. Precipitation with 60% acetone was the method that led to improved recovery percentages, about 80%, for the endoglucanases (CMCase), 65% for filter paper activity (FPase) and 25% for cellobiase. With regard to purification, choromatographic column with Q-Sepharose resin was selected as the most efficient for the purification of the cellulase enzyme complex produced by Acremonium strictum. As enzymatic characterization, the temperature and pH ranges studied did not differ significantly (p<0.05) compared to the activity of endoglucanase (CMCase). As for the cellobiase and FPase activity, the optimum temperature range was 54 to 57 °C and optimum pH was 4.7. For the b-glucosidase, only temperature was significant, favoring higher temperatures (54 to 57 °C) for enzyme activity. Parallel fermentations were conducted for cellulase production using different cellulosic substrates (carboxymethylcellulose, SERVACEL® and AVICEL ®) and sugarcane bagasse pretreated with different intensities. Bagasse that underwent t mild pretreatment (12 kgf/cm², 188.5 °C) was the best inducer for microorganism under study, and led to the highest cellulolytic activities, being the maximum values 134.42 U/L U/L for CMCase after 240 hours of fermentation, 10.82 U/L for FPase after 192 hours, 27.72 U/L for cellobiase after 96 hours and 3.48 U/L for b-glucosidase after 240 hours. At the current stage of biotechnology and molecular biology, the identification of genes present in a given micro-organism has become essential. In view of this, the 454 sequencing of the genome of Acremonium strictum was carried out and two cellulase genes were identified, being an endoglucanase of the family 74a gene and b-glucosidase gene. These enzymes were isolated, sequenced and cloned into E. coli using the pGEM-T Easy vector so that future work can address the expression products of these enzymes in Saccharomyces cerevisiae in order to produce second generation bioethanolDoutoradoEngenharia de AlimentosDoutora em Engenharia de Alimento

Variações genômicas estruturais : mecanismos relacionados à rearranjos croossômicos

6 RESUMO Rearranjos cromossômicos estruturais são uma parte normal da variação no genoma humano, mas algumas classes de rearranjos podem causar síndromes de malformações e/ou deficiência intelectual. Rearranjos estruturais surgem em células pré-meióticas, meióticas, ou pós-zigóticas e, na maioria dos casos, o tempo da sua formação é desconhecido. A abordagem clássica de formação de um rearranjo estrutural propõe a ocorrência aleatória de pontos de quebra, com a união das pontas quebradas. No entanto, tem sido sugerida a existência de segmentos cromossômicos que são mais suscetíveis à formação de rearranjos do genoma. Esta distribuição não-aleatória de pontos de quebra pode ser um reflexo de características moleculares estruturais, com atributos específicos do DNA ou cromatina em certos segmentos cromossômicos, levando-os à reorganização genômica. Este trabalho aborda a caracterização de cinco tipos diferentes de deleções (3q11.2q13.31; 6p24.3p22.3 e 18q21.2q23) e duplicações (8q24.13q24.3 e 18p11.32p11.21) cromossômicas. Também explora os mecanismos moleculares de suas formações. Os métodos aplicados incluíram bandamento cromossômico, hibridização in situ por fluorescência (FISH), e hibridação genômica comparativa baseada em microarranjo (array-CGH). A determinação de pontos de quebra cromossômicos revelou os caminhos para a formação dos rearranjos recorrentes e não recorrentes e permitiu reconhecer quais genes foram interrompidos, fundidos, e/ou, eventualmente, desregulados por cada variação estrutural. As características estruturais e arquitetônicas dos segmentos rearranjados mostraram tipos distintos de variações estruturais e mecanismos distintos de origem, levando a doenças causadas por rearranjos, sendo duas de novo (del6p24.3p22.3 e inv del18q21.2q23) e duas herdadas (del3q11.2q13.31 e invdup8q24. 13q24.3). Nossos dados sugerem que, quando avaliados com métodos citogenômicos suficientemente sensíveis, uma identificação correta das regiões críticas é viável e leva a uma maior compreensão dos efeitos de rearranjos cromossômicos presentes em indivíduos com fenótipos clinicamente relevantes. Estes dados também contribuem para a compreensão das características, funcionalidades, e plasticidade do nosso genoma. Juntos, estes dados trazem informações importantes para uma melhor compreensão sobre os fatores de risco para a formação de deleções e duplicações genômicas, sobre a origem dos rearranjos cromossômicos e sobre os principais genes responsáveis por determinadas malformações congênitas.Chromosomal structural rearrangements are a normal part of variation in the human genome, but some classes of rearrangements can cause malformation syndromes and/or intellectual disabilities. Structural Rearrangements arises in premeiotic, meiotic, or postzygotic cells, and in most cases the timing of its formation is not known. The classical approach of forming structural rearrangement proposes the random occurrence of breakpoints, with the junction of the broken ends. However, it has been suggested the existence of chromosomal segments which are most susceptible to the formation of the genome rearrangements. This non-random distribution of breakpoints may be a reflect of the molecular structure characteristics with specific attributes in DNA or chromatin in certain chromosome segments, taking these to a genomic reorganization. This work covers the characterization of five different types of chromosomal deletions (3q11.2q13.31; 6p24.3p22.3 and 18q21.2q23) and duplications (8q24.13q24.3 and 18p11.32p11.21). It also explores the molecular mechanisms of its formation. The methods applied included chromosome banding, fluorescence in situ hybridization (FISH), and array comparative genome hybridization (array-CGH). Chromosome breakpoint determination revealed pathways to recurrent and non-recurrent chromosome rearrangements and allowed to recognize which genes were disrupted, fused, and/or possibly misregulated by each structural variation. The structural and architectural features of the rearranged segments showed distinct types of structural variations and distinct mechanisms of origin, leading to 2 de novo (del6p24.3p22.3 and inv del18q21.2q23) and 2 inherited (del3q11.2q13.31 and invdup8q24.13q24.3) disease causing rearrangements. Our data suggest that, when assessed with sufficiently sensitive cytogenomic methods, a reliable identification of structural variation regions is feasible and leads to a greater understanding of the effects of chromosome rearrangements present in individuals with clinically relevant phenotypes. This data also contributes to the understanding of the characteristics, features, and plasticity of our genome. Together, this data points to risk factors for genomic deletions and duplications formation, to the origin of chromosome rearrangements and to key genes responsible for congenital malformations

Prospecção de agrupamentos gênicos conservados associados à síntese de metabólitos secundários em fungos entomopatogênicos

Os fungos entomopatogênicos são importantes patógenos naturais de artrópodes, desempenhando um papel essencial no controle de diversas populaçãos destes animais. O potencial destes fungos como agentes de controle biológico têm sido amplamente explorado. O ciclo de infecção destes organismos é dependente de uma grande diversidade de determinantes de virulência, sendo que a grande maioria dos determinantes de virulência já caracterizados para estas espécies é de origem proteica. Entretanto, uma grande diversidade de metabólitos secundários, moléculas de baixo peso molecular com potencial bioativo, podem também ter participação neste processo. Apesar da sua importância, poucos metabólitos secundários com potencial inseticida já foram relatados e caracterizados. Nesse trabalho, realizamos uma análise de genômica comparativa com o objetivo de identificar agrupamentos gênicos responsáveis pela biossíntese de metabólitos secundários no genoma de 37 espécies de fungos entomopatogênicos da ordem Hypocreales. Notavelmente, as espécies investigadas apresentam uma grande diversidade de genes envolvidos na biossíntese destes compostos, a qual, potencialmente, propícia um perfil metabólico único, o que pode ser um reflexo das distintas estratégias de adaptação observadas nessas espécies. Além disso, alguns agrupamentos gênicos identificados estão presentes na grande maioria das espécies avaliadas, o que indica que esses compostos têm um papel importante nos diferentes estilos de vida desses fungos e podem produzir compostos importantes para a manutenção do ciclo de vida e infecção desses fungos. Considerando que alguns aprupamentos são conservados entre a maioria das 37 espécies de fungos entomopatogênicos da ordem Hypocreales eles podem representar uma fonte de moléculas importantes para aplicação no desenvolvimento de novos inseticidas e, portanto, sua melhor investigação pode auxiliar em implementações mais eficazes do controle biológico.Entomopathogenic fungi are natural pathogens of arthropods, playing an important role in controlling insect populations. Their use as biological control agents has been widely explored. The infectious process is dependent on several virulence determinants and most virulence determinants already characterized for these species are proteins. However, a great diversity of secondary metabolites, bioactive low molecular mass molecules, may also have a role in this process. Despite its importance, few entomopathogenic-derived secondary metabolites harboring insecticidal activity have been reported and characterized. In this work, we performed a comparative genomic analysis of biosynthesis gene clusters, potentially involved in the synthesis of secondary metabolites, in the genome of 37 species of entomopathogenic fungi from Hypocreales order. Notably, the species investigated have a great diversity of genes involved in the biosynthesis of these compounds, which, potentially, provides a unique metabolic profile. This different profile may be the result of the different adaptation strategies observed in these species. In addition, some biosynthetic gene clusters were found conserved in several investigated species, which indicates that the potential compounds could have an important role in the maintenance of the life cycle and infection of these fungi. Furthermore, these conserved BGCs may represent a source of important molecules for application in the insecticidal development. Thus, these genes are interesting targets for future studies and can assist in more effective implementations of biological control strategies

Panorama da nutrigenômica no Brasil sob a perspectiva da Bioética

Nutrigenomics has positioned itself, in the scientific and popular context, as an alternative to prevent diseases, which genetically determined predisposition can be avoided or encouraged, depending on the context the individual is at. The study investigated the potential of nutrigenomics in mitigating or generating vulnerabilities. The purpose was to establish the panorama of nutrigenomics in Brazil from the perspective of Bioethics. The study consisted of a quantitative mapping of the nutrigenomics panorama in the scientific and popular context of Brazil, and of an exploratory bibliographic analysis in order to identify moral agents and patients, as well as vulnerabilities to pro- mote reflection in light of Bioethics. The scenario of nutrigenomics in Brazil, built from 18 scientific texts and 600 popular contents, evidenced the prematurity of the area in the scientific context in comparison with a wide incorporation by the popular media. The incorporation of Bioethics in the debate was analyzed in 44 scientific articles, from which the philosophical, biological, cultural, legal and health contexts in which it is found were identified as conditioning aspects of decisions of the moral agent. The vulnerabilities and paradigm changes necessary to implement it in Brazil were related, in order to mitigate the potential for generating vulnerabilities. Bioethics can and should have a broader and more effective action on nutrigenomics questionings by normalizing and guiding the development of this promising area. Thus, it must aim at paradigm shifts in science, professionals, the market, the patient and the consumer so that the potential aspects of generating the identified vulnerabilities are eliminated and contribute to the quality of life of all living beings in the world of this and future generations.La nutrigenómica ha configurado, en el medio científico y popular, como alternativa para prevenir enfermedades, cuya predisposición determinada genéticamente puede evitarse o estimularse, dependiendo del entorno en el que el individuo se encuentra. El estudio indagó el potencial de la nutrigenómica en mitigar o generar vulnerabilidades. El propósito fue establecer el panorama de la nutrigenómica en Brasil desde la perspectiva de la Bioética. El estudio ha consistido en un mapeo cuantitativo del panorama de la nutrigenómica en el contexto científico y popular de Brasil, y en un análisis bibliográfico exploratorio con el fin de identificar los agentes y pacientes morales, así como las vulnerabilidades para promover una reflexión a la luz de la Bioética. El escenario de la nutrigenómica en Brasil, elaborado desde 18 textos científicos y 600 contenidos populares, evidenció la prematuridad del área en el contexto científico en confronto con una amplia incorporación por el medio popular. La incorporación de la Bioética en el debate se analizó en 44 artículos científicos, a partir de los que se identificaron como aspectos condicionantes de decisiones del agente moral los contextos filosófico, biológico, cultural, legal y sanitario en los que se encuentra. Se relacionaron las vulnerabilidades y cambios de paradigmas necesarios para implementarlo en Brasil, con la finalidad de mitigar el potencial de generación de vulnerabilidades. La Bioética puede y debe tener una actuación más amplia y efectiva en los cuestionamientos de la nutrigenómica al normalizar y orientar el desarrollo de esta área prometedora. Así, debe apuntar a los cambios de paradigmas da ciencia, de los profesionales, del mercado, del paciente y del consumidor para que se supriman los aspectos potenciales de generación de las vulnerabilidades identificadas y aportar para la calidad de vida de todos los seres vivos de esta y de futuras generaciones.A nutrigenômica tem configurado, no meio científico e popular, como alternativa para prevenir doenças, cuja predisposição determinada geneticamente pode ser evitada ou estimulada, de- pendendo do ambiente no qual o indivíduo se insere. Este estudo questionou o potencial da nutrigenômica em mitigar ou gerar vulnerabilidades. Objetivou-se traçar o panorama da nutrigenômica no Brasil sob a perspectiva da Bioética. O estudo consistiu em um mapeamento quantitativo do panora- ma da nutrigenômica no cenário científico e popular do Brasil, e em uma análise bibliográfica exploratória com o intuito de identificar os agentes e pacientes morais, bem como as vulnerabilidades com vistas a promover uma reflexão à luz da Bioética. O cenário da nutrigenômica no Brasil, elaborado a partir de 18 textos científicos e de 600 conteúdos populares, indicou a prematuridade da área no contexto científico em confronto com uma ampla incorporação pelo meio popular. A incorporação da Bioética na questão foi analisada em 44 artigos científicos, a partir dos quais foram identificados como aspectos condicionantes de decisões do agente moral os contextos filosófico, biológico, cultural, legal e sanitário nos quais se insere. Foram elencadas as vulnerabilidades e mudanças de paradigmas necessárias para sua implementação no Brasil, a fim de diminuir o potencial de geração de vulnerabilidades. A Bioética pode e deve ter uma atuação mais ampla e efetiva nas questões da nutrigenômica ao normatizar, balizar e orientar o desenvolvimento dessa área promissora. Assim, deve visar às mudanças de paradigmas da ciência, dos profissionais, do mercado, do paciente e do consumidor para serem suprimidos os aspectos potenciais de geração das vulnerabilidades identificadas e contribuir para a qualidade de vida de todos os seres vivos desta e de futuras gerações

Genetic and molecular studies in the genus Paspalum L. (Poaceae: Panicoideae: Paniceae)

Orientador: Anete Pereira de SouzaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: No Brasil, a pecuária bovina é baseada principalmente na utilização de pastagens para alimentação animal, sendo a maioria destas cultivadas. O lançamento de novas cultivares de forrageira e os avanços no manejo das pastagens permitiram que o Brasil se tornasse, atualmente, um dos maiores produtores mundiais de bovinos e o maior exportador de carne bovina do mundo. Contudo, poucas opções de forrageiras estão disponíveis para o cultivo de pastagens no Brasil, principalmente para as regiões tropicais, sendo que a maioria dessas é constituída de poucas cultivares de gramíneas africanas do gênero Urochloa (Syn. Brachiaria). Há uma necessidade eminente de diversificação das pastagens e, o gênero Paspalum se destaca dentre as gramíneas nativas com potencial forrageiro a contribuir para a diversificação de espécies em pastagens tropicais. Paspalum inclui aproximadamente 400 espécies distribuídas, principalmente, em regiões tropicais e subtropicais das Américas. O Brasil é o maior centro de origem e diversidade deste gênero, com ocorrência de espécies de grande potencial forrageiro, havendo vários acessos disponíveis em bancos de germoplasma. Para que os programas de melhoramento possam utilizar de forma adequada os bancos de germoplasma existentes, é necessário um conhecimento da quantidade e da distribuição da diversidade genética dessas coleções. Nesse sentido, no presente trabalho, marcadores microssatélites foram isolados e caracterizados em duas espécies de Paspalum (P. atratum e P. notatum) para o estudo de diversidade genética de acessos de bancos de germoplasma de Paspalum. Um total de 21 microssatélites foi desenvolvido para P. atratum e 26 para P. notatum. A transferibilidade desses marcadores foi avaliada para 35 espécies de Paspalum, sendo que doze microssatélites foram utilizados na caracterização de 214 acessos de Paspalum de diferentes espécies. Os microssatélites foram úteis na identificação das espécies de Paspalum, auxiliando de forma efetiva na organização dos acessos mantidos nos bancos de germoplama, fornecendo também subsídios para programas de melhoramento genético do gênero. Adicionalmente, 57 acessos de P. notatum foram avaliados com o uso de 30 microssatélites, em conjunto com caracterísitcas fenotípicas e citogenéticas. A maioria desses locos apresentou grande potencialidade para uso na discriminação de cultivares e acessos. As avaliações conjuntas indicaram que os microssatélites foram eficientes e robustos na separação dos acessos de P. notatum em três variedades botânicas (var. notatum, var. saurae e var. latiflorum), os quais agruparam-se em sete grupos geneticamente distintos. Os microssatélites desenvolvidos, assim como os dados de diversidade genética gerados nesse trabalho, são um passo em direção a um melhor entendimento do gênero e uma ferramenta para que novos trabalhos possam ser realizadosAbstract: In Brazil, the production of cattle is based primarily on the use of pastures for animal feed, most of these cultivated. The release of new cultivars of forage and advances in pasture management has enabled Brazil to become currently one of the largest producers of cattle and the largest exporter of beef in the world. However, few options are available for fodder cultivation of pastures in Brazil, mainly in tropical regions, where most of these consists of a few varieties of African grasses of the genus Urochloa (Syn. Brachiaria). There is a clear need to diversify pastures and the genus Paspalum stands out among the native grasses with forage potential to contribute to the diversification of species in tropical pastures. Paspalum includes about 400 species distributed mainly in tropical and subtropical regions of the Americas. Brazil is the largest center of origin and diversity of this genus, with the occurrence of species of high forage yield potential, and several accessions available in germplasm banks. In order to make good use of the existing germplasm collections for breeding purposes it is necessary to know the quantity and distribution of genetic diversity of these collections. In that sense, in the present work, microsatellite markers were isolated and characterized in two species of Paspalum (P. notatum and P. atratum). These markers were used as a tool to study genetic diversity of germplasm banks of Paspalum. A total of 21 microsatellites was developed for P. atratum and 26 for P. notatum. The transferability of these markers was evaluated for 35 species of Paspalum, in which twelve microsatellites were used to characterize 214 accessions of different species of Paspalum. The microsatellites were useful in identifying the species of Paspalum, effectively assisting in the organization of accessions maintained in germplasm banks, as well as providing subsidies to breeding programs of the genus. Additionally, 57 accessions of P. notatum were evaluated using 30 microsatellites, together with phenotypic and cytogenetic characteristic. Most of these loci showed a great potential for cultivar and accessions discrimination. Joint evaluations indicated that the microsatellites were efficient and robust in the separation of the accessions evaluated in to seven genetically distinct groups, which corresponded to the three botanical varidades described for the species (var.notatum, var. sourae, and var. latiflorum). Microsatellites developed, as well as data of genetic diversity generated in this work are a step toward a better understanding of the genus and a tool for further workDoutoradoGenetica Vegetal e MelhoramentoDoutor em Genetica e Biologia Molecula