Using MapReduce Streaming for Distributed Life Simulation on the Cloud

Distributed software simulations are indispensable in the study of large-scale life models but often require the use of technically complex lower-level distributed computing frameworks, such as MPI. We propose to overcome the complexity challenge by applying the emerging MapReduce (MR) model to distributed life simulations and by running such simulations on the cloud. Technically, we design optimized MR streaming algorithms for discrete and continuous versions of Conway’s life according to a general MR streaming pattern. We chose life because it is simple enough as a testbed for MR’s applicability to a-life simulations and general enough to make our results applicable to various lattice-based a-life models. We implement and empirically evaluate our algorithms’ performance on Amazon’s Elastic MR cloud. Our experiments demonstrate that a single MR optimization technique called strip partitioning can reduce the execution time of continuous life simulations by 64%. To the best of our knowledge, we are the first to propose and evaluate MR streaming algorithms for lattice-based simulations. Our algorithms can serve as prototypes in the development of novel MR simulation algorithms for large-scale lattice-based a-life models.https://digitalcommons.chapman.edu/scs_books/1014/thumbnail.jp

Aeronautical engineering: A continuing bibliography with indexes (supplement 322)

This bibliography lists 719 reports, articles, and other documents introduced into the NASA scientific and technical information system in Oct. 1995. Subject coverage includes: design, construction and testing of aircraft and aircraft engines; aircraft components, equipment, and systems; ground support systems; and theoretical and applied aspects of aerodynamics and general fluid dynamics

Μελέτη των ρυθμιστικών μηχανισμών στόχευσης και ενδοκύτωσης διαμεμβρανικών μεταφορέων πουρινών σε ένα πρότυπο γενετικό σύστημα

Οι ευκαρυωτικοί διαμεμβρανικοί μεταφορείς ανταποκρίνονται σε περιβαλλοντικά και αναπτυξιακά σινιάλα τόσο στο μεταγραφικό όσο και στο μετα-μεταφραστικό επίπεδο. Η έκφραση των μεταφορέων ρυθμίζεται αυστηρά με την ταχεία de novo σύνθεση και στόχευση τους στη πλασματική μεμβράνη, αλλά και την ακόμη πιοταχεία απομάκρυνσή τους απο αυτήν μέσω της διαδικασίας της ενδοκύτωσης, ως απόκριση στην παρουσία ιόντων αμμωνίου ή περίσσειας υποστρώματος. Ο εκτενώς μελετημένος μεταφορέας ουρικού οξέος-ξανθίνης UapA του Aspergillus nidulans χρησιμοποιήθηκε για τη διερεύνηση τριών βασικών ερωτημάτων που σχετίζονται με τους μηχανισμούς που διέπουν την ενδοκυτταρική διακίνηση των μεταφορέων. Συγκεκριμένα, μελετήθηκαν οι συνέπειες του υπερτονικού στρες στην φυσιολογία των μυκήτων και την ενδοκύτωση των μεταφορέων τους, οι μηχανισμοί που ρυθμίζουν την ουβικουιτινίωση των μεταφορέων με σκοπό την απομάκρυνση τους από την πλασματική μεμβράνη και την καταστροφή τους στα χυμοτόπια, και ο ρόλος του ολιγομερισμού στην διακίνηση των μεταφορέων προς και από την πλασματική μεμβράνη.Eukaryotic transporters respond to environmental and developmental signals at both the transcriptional and post-translational levels. Their tight control includes rapid de novo synthesis and targeting to the plasma membrane (PM) and even more rapid down-regulation through endocytosis and vacuolar degradation, triggered by NH4 + orexcess substrate. The extensively studied uric acid-xanthine transporter UapA of Aspergillus nidulans was used to address three questions concerning the mechanisms underlying intracellular trafficking of transport proteins: what are the effects of hypertonicity in fungal physiology and transporter endocytosis, which are the mechanisms regulating transporter ubiquitination and turnover, and what is the role of transporter oligomerization in membrane trafficking and endocytosis

Μελέτη των ρυθμιστικών μηχανισμών στόχευσης και ενδοκύτωσης διαμεμβρανικών μεταφορέων πουρινών σε ενα πρότυπο γενετικό σύστημα

Οι ευκαρυωτικοί διαμεμβρανικοί μεταφορείς ανταποκρίνονται σε περιβαλλοντικά και αναπτυξιακά σινιάλα τόσο στο μεταγραφικό όσο και στο μετα-μεταφραστικό επίπεδο. Η έκφραση των μεταφορέων ρυθμίζεται αυστηρά με την ταχεία de novo σύνθεση και στόχευση τους στη πλασματική μεμβράνη, αλλά και την ακόμη πιο ταχεία απομάκρυνσή τους απο αυτήν μέσω της διαδικασίας της ενδοκύτωσης, ως απόκριση στην παρουσία ιόντων αμμωνίου ή περίσσειας υποστρώματος. Ο εκτενώς μελετημένος μεταφορέας ουρικού οξέος-ξανθίνης UapA του Aspergillus nidulans χρησιμοποιήθηκε για τη διερεύνηση τριών βασικών ερωτημάτων που σχετίζονται με τους μηχανισμούς που διέπουν την ενδοκυτταρική διακίνηση των μεταφορέων. Συγκεκριμένα, μελετήθηκαν οι συνέπειες του υπερτονικού στρες στην φυσιολογία των μυκήτων και την ενδοκύτωση των μεταφορέων τους, οι μηχανισμοί που ρυθμίζουν την ουβικουιτινίωση των μεταφορέων με σκοπό την απομάκρυνση τους από την πλασματική μεμβράνη και την καταστροφή τους στα χυμοτόπια, και ο ρόλος του ολιγομερισμού στην διακίνηση των μεταφορέων προς και από την πλασματική μεμβράνη

Programming the cerebellum

It is argued that large-scale neural network simulations of cerebellar cortex and nuclei, based on realistic compartmental models of me major cell populations, are necessary before the problem of motor learning in the cerebellum can be solved, [HOUK et al.; SIMPSON et al.

28th Fungal Genetics Conference

Full abstracts from the 28th Fungal Genetics Conference Asilomar, March 17-22, 2015

Proceedings of the 2018 Canadian Society for Mechanical Engineering (CSME) International Congress

Published proceedings of the 2018 Canadian Society for Mechanical Engineering (CSME) International Congress, hosted by York University, 27-30 May 2018

Bowdoin Orient v.133, no.1-24 (2003-2004)

https://digitalcommons.bowdoin.edu/bowdoinorient-2000s/1004/thumbnail.jp