Extraction de relations en domaine de spécialité

La quantité d'information disponible dans le domaine biomédical ne cesse d'augmenter. Pour que cette information soit facilement utilisable par les experts d'un domaine, il est nécessaire de l'extraire et de la structurer. Pour avoir des données structurées, il convient de détecter les relations existantes entre les entités dans les textes. Nos recherches se sont focalisées sur la question de l'extraction de relations complexes représentant des résultats expérimentaux, et sur la détection et la catégorisation de relations binaires entre des entités biomédicales. Nous nous sommes intéressée aux résultats expérimentaux présentés dans les articles scientifiques. Nous appelons résultat expérimental, un résultat quantitatif obtenu suite à une expérience et mis en relation avec les informations permettant de décrire cette expérience. Ces résultats sont importants pour les experts en biologie, par exemple pour faire de la modélisation. Dans le domaine de la physiologie rénale, une base de données a été créée pour centraliser ces résultats d'expérimentation, mais l'alimentation de la base est manuelle et de ce fait longue. Nous proposons une solution pour extraire automatiquement des articles scientifiques les connaissances pertinentes pour la base de données, c'est-à-dire des résultats expérimentaux que nous représentons par une relation n-aire. La méthode procède en deux étapes : extraction automatique des documents et proposition de celles-ci pour validation ou modification par l'expert via une interface. Nous avons également proposé une méthode à base d'apprentissage automatique pour l'extraction et la classification de relations binaires en domaine de spécialité. Nous nous sommes intéressée aux caractéristiques et variétés d'expressions des relations, et à la prise en compte de ces caractéristiques dans un système à base d'apprentissage. Nous avons étudié la prise en compte de la structure syntaxique de la phrase et la simplification de phrases dirigée pour la tâche d'extraction de relations. Nous avons en particulier développé une méthode de simplification à base d'apprentissage automatique, qui utilise en cascade plusieurs classifieurs.The amount of available scientific literature is constantly growing. If the experts of a domain want to easily access this information, it must be extracted and structured. To obtain structured data, both entities and relations of the texts must be detected. Our research is about the problem of complex relation extraction which represent experimental results, and detection and classification of binary relations between biomedical entities. We are interested in experimental results presented in scientific papers. An experimental result is a quantitative result obtained by an experimentation and linked with information that describes this experimentation. These results are important for biology experts, for example for doing modelization. In the domain of renal physiology, a database was created to centralize these experimental results, but the base is manually populated, therefore the population takes a long time. We propose a solution to automatically extract relevant knowledge for the database from the scientific papers, that is experimental results which are represented by a n-ary relation. The method proceeds in two steps: automatic extraction from documents and proposal of information extracted for approval or modification by the experts via an interface. We also proposed a method based on machine learning for extraction and classification of binary relations in specialized domains. We focused on the variations of the expression of relations, and how to represent them in a machine learning system. We studied the way to take into account syntactic structure of the sentence and the sentence simplification guided by the task of relation extraction. In particular, we developed a simplification method based on machine learning, which uses a series of classifiers.PARIS11-SCD-Bib. électronique (914719901) / SudocSudocFranceF

Système symbolique de création de résumés de mise à jour

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

Le rôle de la profession et du secteur économique sur le risque de dépression majeure

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

Rapport de l'évaluation externe du projet recherche en santé du Centre Régional pour le Développement et la Santé (CREDESA)

Annexes inclusLe Centre Régional pour le Développement et la Santé (CREDESA) - ex Projet de Développement Sanitaire de Pahou (PDSP) a été créé en 1983 au Sud-Est du Bénin avec pour mission : - Promouvoir les soins de santé primaires (SSP) avec une approche pluridisciplinaire et multisectoriel par le biais d'une recherche opérationnelle orientée ·vers les besoins de la communauté; - Assurer avec les communautés des prestations de services rationalisés et la formation des agents de santé communautaire et du personnel de santé à tous les niveaux; Pour répondre à cette mission, le CREDESA a planifié ses activités selon les étapes suivantes : - Etablissement et renforcement de la capacité institutionnelle du CREDESA et de la Faculté des Sciences de la Santé en matière de recherche par le développement des ressources humaines; - Formation des secouristes et des accoucheuses traditionnelles; - Formation d'agents de santé, tels que les médecins, sages-femmes et infirmiers et assistants sociaux. Dans la mise en oeuvre de ce plan dont la troisième phase s'achève en Juin 1996, le CREDESA bénéficie depuis 1990 d'un appui du CRDI. Cet appui a permis la disponibilité de ressources humaines pluridisciplinaires compétentes pour élaborer et mettre en oeuvre des projets de recherche sur les problèmes prioritaires de la zone couverte par le projet, l'organisation des services du district et la formation d'agents de santé et d'agents de santé communautaire. L'exploitation des résultats de recherche et la formation devraient perm.ettre d'asseoir à moyen terme, un système de soins rationalisés et accessibles dans toute la zone de Ouidah. Quelques indicateurs de santé montrent l'impact positif sur la santé des communautés notamment la mortalité infantile qui est très en-dessous de la moyenne nationale. Il s'agit aujourd'hui pour le CREDESA qui vient de franchir un pas de plus dans la reconnaissance internationale en étrennant une troisième distinction internationale (UNICEF), de continuer les activités de service, de formation et de recherche pour d'unè part, suivre ces indicateurs de performance, la qualité de vie des communautés vivant dans ces zones organisées et d'autre part d'organiser le système-recours, en l'occurrence l'hôpital de référence pour son utilisation rationnelle par les populations de la zone. Les populations que nous avons rencontrées y croient fermement et attendent un soutien conséquent de leurs efforts. Mais si le projet connaît de nombreux succès dans ses divers domaines d'intervention, il est important de noter qu'il traîne quelques insuffisances qu'il convient de combler rapidement. En outre, le projet traverse en ce moment une période difficile qui n'est pas sans influence sur la performance et qui a pour origine essentielle : - une restructuration certes nécessaire, mais dont l'application ne va pas sans quelques difficultés heureusement surmontables, - la fin des financements de la part des bailleurs de 'fonds (CRDI, ACDI); ce qui n'est pas sans créer une atmosphère d'inquiétude

Le développement des biotechnologies cubaines de la Révolution de 1959 jusqu'au milieu des années 2000

Depuis les années quatre-vingt-dix Cuba développe et commercialise des vaccins et méthodes en biotechnologies médicales dont certains sont des premières mondiales. L'île est alors encore considérée comme un pays en voie de développement et est la cible d’un embargo imposé par les États-Unis depuis plus de trente ans. Or les biotechnologies sont une science aussi coûteuse en matériel qu'en ressources humaines très spécialisées et elles sont de ce fait réservées aux pays de la sphère scientifique centrale. Ces réussites suggèrent la mise en place d'un potentiel scientifique et technique réel autant qu'elles peuvent constituer un artéfact dans un secteur moins développé ou moins pérenne qu'il n'y paraît. Quel est le vrai visage des biotechnologies cubaines au milieu des années deux-mille ? C'est à cette question que tente de répondre cette étude. Elle consiste dans un premier temps à retracer les paramètres du développement des institutions de recherche en biotechnologies dans un contexte qui connaît peu de répit depuis l'avènement de la Révolution : indicateurs socio-économiques bas, embargo, planification socialiste, isolement géopolitique, crises économiques mondiales, dissolution du bloc soviétique... Elle se poursuit avec une analyse bibliométrique permettant de donner un visage quantitatif des réalisations cubaines dans le domaine : au-delà des réalisations mises de l'avant, dans quelles revues et dans quels domaines les chercheurs cubains en biotechnologie publient-ils ? Avec quels pays collaborent-ils et par quels pays sont-ils cités ? Quelle est leur place dans le monde ? Nous exploiterons l'ensemble de ces indicateurs et de ces éléments historiques pour conclure, au tournant des années deux-mille, à l'existence d'un potentiel scientifique et technique développé mais d'une science aux ressources maigres constamment tenue de rapporter un certain capital économique aussi bien que politique. En cohérence avec la dialectique socialiste propre à l'île, les sciences cubaines, depuis 1959, ne constituent jamais une fin en soi mais restent un moyen politique et social. En 2006 elles le sont encore. Malgré leurs réalisations elles touchent aux limites de la planification et réclament leur indépendance face au politique afin d'exploiter pleinement leur potentiel, bien réel.Since the 1990s, Cuba has developed and marketed vaccines and medical biotechnology methods of which some have been the first in the world. At that time, the island was considered a developing country and had been the target of an embargo imposed by the United States for more than thirty years, as it still is now. Yet biotechnology is a costly science both in terms of material resources and in terms of highly specialized human resources, and for this reason it is usually exclusive to the world’s leading scientific countries. These successes in Cuba thus suggest the creation of a real scientific and technical potential in country, as much as they constitute an artifact in a sector that is less developed or less established than might seem to be the case. What is the true face of Cuban biotechnologies at the turn of the millennium? This is the question that this study seeks to answer. The study first retraces the parameters of the development of Cuban research institutions in biotechnology in the context of the difficult circumstances that the country has experienced since the Revolution: low socio-economic indicators, the American embargo, socialist planning, geopolitical isolation, world economic crises, and the dissolution of the Soviet bloc. The study then presents a bibliometric analysis, which offers a quantitative vision of Cuban achievements in biotechnology. In which periodicals and in which domains have Cuban researchers in biotechnology published their results? To which countries do the researchers who have collaborated with them or cited them belong? What is their place in the world? We will use these indicators and historical elements to conclude that a developed scientific and technical potential exists in Cuba at the turn of the millennium but that the Cuban sciences remain relatively poor in resources and remain constantly pressured to yield political as well as economic capital. In accordance with the socialist dialectic proper to the island, the Cuban sciences since 1959 have never constituted an end in themselves but have been a means to achieve political and social goals. This remains the case in 2006. Despite their achievements, they remain subject to the limits of socialist planning. They require independence from political concerns in order to fully exploit their potential, which is very rea

Gestion des équipements d’imagerie médicale

Rapport de projet présenté à la Faculté des études supérieures et postdoctorales dans le cadre de la maîtrise en génie biomédical - Option génie cliniqueLe présent rapport fait l’objet de l’expérience acquise pendant mon projet au sein du Centre intégré universitaire de santé et de services sociaux du Centre-Ouest-de-l’Île-de- Montréal, et plus précisément au sein de l’Hôpital général juif (CIUSSS-CODIM-HGJ) d’une durée de quatre mois, et ce dans le cadre de la maîtrise en génie clinique. Pendant ce stage, mon mandat a été le remplacement et l’acquisition des équipements médicaux d’imagerie au sein de divers départements à savoir hémodynamie, cardiologie, angiographie, mammographie, CT, IRM, urgence, bloc opératoire, orthopédie, radiologie et urologie. À cet effet, le rapport présente un descriptif de l’imagerie et résume les projets d’acquisition et activités effectués au sein de ces départements.This report is the subject of the experience gained from my internship / project at Centre intégré universitaire de santé et de services sociaux du Centre-Ouest-de-l’Île-de-Montréal (CIUSSS-CODIM), and more specifically at the Jewish General Hospital for a period of four months, in the context of the Master's degree in Clinical Engineering. During this internship, my mandate was the replacement and acquisition of medical imaging equipment in various departments including hemodynamics, cardiology, angiography, mammography, CT, MRI, emergency, operating room, orthopedics, radiology and urology. To this end, the report presents a description of the imagery and summarizes the acquisition projects and activities carried out within these departments