Complementary tools for aquaculture management: remote sensing and in situ approaches for Sines

Tese de mestrado, Ciências do Mar, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020O estado crítico dos recursos marinhos tem vindo a impulsionar o rápido desenvolvimento da aquacultura. De facto, a nível mundial, a produção aquícola regista atualmente um crescimento mais rápido que qualquer outro setor da indústria alimentar. No entanto, o aumento de práticas intensivas de aquacultura tem gerado preocupações, principalmente devido aos potenciais impactos ambientais associados. A presente dissertação teve como foco uma produção intensiva de robalo (Dicentrarchus labrax, L. 1758) localizada no sudoeste da Costa Ibérica (Sines, Portugal). Na área de produção, a qualidade da água e os possíveis impactos da atividade no meio envolvente foram avaliados. Para tal, seis campanhas de amostragem, realizadas entre junho de 2018 e julho de 2019, foram realizadas para recolha de dados de parâmetros físicos, químicos e biológicos ao longo das jaulas onde se encontram os peixes. Foram analisados dados de temperatura, salinidade, parâmetros de claridade da água, matéria particulada em suspensão, oxigénio dissolvido, pH, nutrientes e biomassa e composição fitoplanctónica. Parte dos dados foram adquiridos a partir de sondas multiparamétricas (e.g. temperatura, salinidade, oxigénio dissolvido e pH); as concentrações de matéria particulada em suspensão, nutrientes e biomassa fitoplanctónica foram determinadas analiticamente em laboratório. Os parâmetros de claridade da água foram obtidos através de dados de radiometria e da profundidade de Secchi. Os resultados dos parâmetros de qualidade da água foram comparados com as gamas consideradas como aceitáveis e ótimas para a aquacultura de peixes em ambientes marinhos, de acordo com a literatura internacional. Atualmente, a literatura científica disponível ainda fornece uma orientação direta limitada para a avaliação da qualidade da água nas águas costeiras portuguesas. Os resultados apresentaram valores dentro das gamas aceitáveis definidas na literatura (exceto um valor isolado de fosfatos obtido em outubro de 2018). Para avaliar o impacto desta produção de peixe no meio recetor, as médias e extremos dos parâmetros de qualidade da água passíveis de serem diretamente influenciados pela aquacultura foram comparados com os dados disponíveis para a região de Sines, anteriores ao início da produção de robalo na região. Neste caso, foram obtidas concentrações mais elevadas de azoto inorgânico dissolvido em comparação com os valores de referência para Sines. No geral, a claridade da água, oxigénio dissolvido, nutrientes e biomassa fitoplanctónica não sugeriram impactos negativos das unidades de produção na qualidade da água local. Não obstante, são necessárias mais análises para diferenciar os potenciais impactos da elevada industrialização em Sines, dos impactos da aquacultura. Os resultados do presente trabalho apontam como causas para o baixo stress ambiental diversos fatores: o regime hidrodinâmico, o baixo tempo de residência da água no sistema, a estratégia de alimentação e a dimensão das unidades de produção. As campanhas de amostragem in situ permitiram ainda verificar uma grande variabilidade dos parâmetros analisados na região, e a necessidade de utilizar métodos complementares para uma melhor caracterização espácio-temporal da área envolvente. Os produtos de deteção remota (DR) disponibilizam dados com grande resolução espácio-temporal, que podem complementar as abordagens amostragens in situ fornecendo informações relevantes os end users, neste caso, o aquacultor. Dados climatológicos da temperatura da água e da concentração de clorofila-a (indicador de biomassa fitoplanctônica) com os respetivos parâmetros estatísticos (desvio padrão e percentis 10 e 90) foram determinados para a região envolvente da aquacultura. Para verificar a coerência dos mesmos para a região, estes foram comparados com os dados in situ recolhidos durante as campanhas de amostragem. As médias semanais do percentil 90 (p90) da temperatura da superfície do mar (TSM) provaram ser adequados para alertar condições anómalas no local da aquacultura. Por outro lado, devido à alta variabilidade sazonal e interanual de clorofila-a (Chl-a) na região, a média do p90 mostrou ser mais fidedigna para a deteção de condições de alerta. O cálculo de anomalias diárias em comparação com dias anteriores (7 e 14 dias) também forneceu informações relevantes sobre a ocorrência de blooms na região. Atualmente, a disponibilização de dados de satélite quase em tempo real em várias bases de dados públicas, possibilita facultar ferramentas valiosas de baixo custo ao aquacultor. Para além da região envolvente, a área onde se encontram instaladas as jaulas de peixe foi também caracterizada utilizando dados de DR (TSM, Chl-a e turbidez) e comparada com os dados obtidos in situ. Para fins de monitorização, medições discretas de temperatura e turbidez indicam ser suficientes para representar a área devido à baixa variabilidade espacial. A alta variabilidade de Chl-a na região revelam a necessidade de recolher dados em várias estações ao longo da produção, ou complementar dados in situ mais escassos com produtos de DR de maior resolução. A adequabilidade de diversos produtos de DR considerados ao longo desta tese foi preliminarmente avaliada para a área da aquacultura em Sines. Para analisar a Chl-a, os novos sensores de alta resolução espacial da Agência Espacial Europeia, desenvolvidos no âmbito do Programa Copernicus da Comissão Europeia, como o Ocean and Land Color Instrument (OLCI) e o Multispectral Instrument (MSI) a bordo dos satélites Sentinel-3 e Sentinel-2, mostrou contribuições importantes para as áreas adjacentes ao litoral. Missões com dados históricos de Chl-a, como o Medium Resolution Imaging Spectrometer (MERIS) a bordo do Envisat e o produto que engloba múltiplos sensores da Ocean Colour Climate Change Initiative (OC-CCI), possibilitam uma melhor compreensão de variações intra-anuais. O produto de TSM do Group of High Resolution Sea Surface Temperature (GHRSST) revelou captar consistentemente o sinal de temperatura em Sines. Dada a intensa industrialização da zona de Sines e, neste caso, a presença de uma descarga de água quente proveniente da central termoelétrica de Sines a sul da produção, o uso deste último produto requer atenção na interpretação dos dados. Tal facto destaca a necessidade de aquisição de conhecimentos sólidos sobre a região de estudo para posteriores aplicações de produtos de DR, de modo a minimizar possíveis erros nas análises. Por fim, é salientada a necessidade da utilização de produtos de alta resolução espacial e temporal para monitorar as áreas costeiras, bem como a complementaridade da deteção remota com a recolha de dados in situ.The critical status of marine resources has provided impetus for rapid growth in aquaculture, which has become the fastest growing sector of the food industry worldwide. However, the increase of intensive aquaculture practices has been raising global concern mostly due to the associated potential environmental impacts. The present dissertation focused on an intense aquaculture in the SW Iberian Coast (Sines, Portugal) dedicated to the production of European sea bass (Dicentrarchus labrax, L. 1758). Water quality and potential impacts were assessed in the production area. Physical, chemical and biological parameters were collected along the cages in the course of six field campaigns, carried out between June 2018 and July 2019. These were temperature, salinity, water clarity parameters, suspended particulate matter, dissolved oxygen, pH, nutrients, and phytoplankton biomass and composition. The obtained water quality parameters were compared with threshold values for marine fish production, according to international literature. The scientific literature currently provides limited direct guidance for water quality assessment in Portuguese coastal waters. Results showed values within the acceptable for marine fish production (except an isolated value of phosphates obtained in October 2018). To assess the impact of this fish production in the receiving medium, the averages and extremes of water quality parameters that might be directly influenced by aquaculture were further compared with available data for Sines region, previous to the sea bass production in the area. A higher dissolved inorganic nitrogen signal was found in the collected data, compared to background nutrient levels for Sines. Overall, water clarity, dissolved oxygen, nutrients and phytoplankton biomass did not suggest any detrimental impacts of the production units on local water quality, although more research is needed. The findings point to the hydrodynamic regime, low water residence time in the system, feeding strategy and the dimension of production units as the reason for the lack of stress on the receiving waters. Typically, coastal aquaculture faces with high water quality variability. Given the capabilities of satellite remote sensing (RS) products to provide high spatio-temporal data, they have the potential to be used as complementary tools to support the activity, providing important knowledge for end users. Climatological water temperature and phytoplankton biomass (indexed as chlorophyll-a concentration) data with respective statistics were provided for the aquaculture region and compared with the in situ data collected to verify consistency. Sea surface temperature (SST) weekly 90th percentiles (p90) proved to be suitable to alert anomalous conditions in the aquaculture site. On the other hand, due to high chlorophyll-a (Chl-a) seasonal and interannual variability in the region, the mean p90 proved to be more reliable for the detection of alert conditions. The computation of daily anomalies compared to previous days (7-days and 14-days) also provided valuable information on the occurrence of blooms in the region. Currently, near real time satellite data can be accessed freely, providing users with valuable tools in a cost-effect way. The aquaculture site was also characterized using RS retrieved variables (SST, Chl-a and turbidity) and compared with the ground truth. For monitoring purposes, single discrete measures of SST and turbidity were found to be most likely sufficient to represent the area due to low spatial variability. High Chl-a variability in the region emphasized the need to collect several datapoints along the production or to complement scarcer in situ data with higher resolution RS products. In this thesis, several remote sensing products were considered, and their suitability for the aquaculture area in Sines was preliminarily assessed. To study the variability of Chl-a, novel high spatiotemporal resolution RS sensors, such as the Ocean and Land Colour Instrument on Sentinel-3 (OLCIS3) and the Multispectral Instrument on Sentinel-2 (MSI-S2), showed important contributions when focusing areas adjacent to the coast. Missions with available historical Chl-a data such as the Medium Resolution Imaging Spectrometer on-board Envisat, and the multi-sensor product from Ocean Colour Climate Change Initiative (OC-CCI), further enable understanding interannual features. The SST product from the Group of High Resolution Sea Surface Temperature (GHRSST) revealed to consistently capture the temperature signal in Sines area. For the aquaculture surroundings, given the high industrialization of the region and, in this case, the presence of a hot water discharge from a thermoelectric powerplant south of the production, the use of this product requires caution to not misinterpret data contamination. This highlights the need to have knowledge of the study region in order to minimize possible error inducers in analyzes with satellite products. The necessity of high spatial and temporal resolution products to monitor coastal areas is therefore underlined, as well as the complementarity of remote sensing and in situ approaches

Building Industries at Sea - ‘Blue Growth’ and the New Maritime Economy

Throughout the world there is evidence of mounting interest in marine resources and new maritime industries to create jobs, economic growth and to help in the provision of energy and food security. Expanding populations, insecurity of traditional sources of supply and the effects of climate change add urgency to a perceived need to address and overcome the serious challenges of working in the maritime environment. Four promising areas of activity for ‘Blue Growth’ have been identified at European Union policy level including Aquaculture; Renewable Energy (offshore wind, wave and tide); Seabed Mining; and Blue Biotechnology. Work has started to raise the technological and investment readiness levels (TRLs and IRLs) of these prospective industries drawing on the experience of established maritime industries such as Offshore Oil and Gas; Shipping; Fisheries and Tourism. An accord has to be struck between policy makers and regulators on the one hand, anxious to direct research and business incentives in effective and efficient directions, and developers, investors and businesses on the other, anxious to reduce the risks of such potentially profitable but innovative investments.The EU H2020 MARIBE (Marine Investment for the Blue Economy) funded project was designed to identify the key technical and non-technical challenges facing maritime industries and to place them into the social and economic context of the coastal and ocean economy. MARIBE went on to examine with companies, real projects for the combination of marine industry sectors into multi-use platforms (MUPs). The purpose of this book is to publish the detailed analysis of each prospective and established maritime business sector. Sector experts working to a common template explain what these industries are, how they work, their prospects to create wealth and employment, and where they currently stand in terms of innovation, trends and their lifecycle. The book goes on to describe progress with the changing regulatory and planning regimes in the European Sea Basins including the Caribbean where there are significant European interests. The book includes:• Experienced chapter authors from a truly multidisciplinary team of sector specialisms• First extensive study to compare and contrast traditional Blue Economy with Blue Growth• Complementary to EU and National policies for multi-use of maritime spac

YOUMARES 9 - The Oceans: Our Research, Our Future

This open access book summarizes peer-reviewed articles and the abstracts of oral and poster presentations given during the YOUMARES 9 conference which took place in Oldenburg, Germany, in September 2018. The aims of this book are to summarize state-of-the-art knowledge in marine sciences and to inspire scientists of all career stages in the development of further research. These conferences are organized by and for young marine researchers. Qualified early-career researchers, who moderated topical sessions during the conference, contributed literature reviews on specific topics within their research field