DSD – An integrated, web-accessible database of Dehydrogenase Enzyme Stereospecificities

BACKGROUND: Dehydrogenase enzymes belong to the oxidoreductase class and utilise the coenzymes NAD and NADP. Stereo-selectivity is focused on the C4 hydrogen atoms of the nicotinamide ring of NAD(P). Depending upon which hydrogen is transferred at the C4 location, the enzyme is designated as A or B stereospecific. DESCRIPTION: The Dehydrogenase Stereospecificity Database v1.0 (DSD) provides a compilation of enzyme stereochemical data, as sourced from the primary literature, in the form of a web-accessible database. There are two search engines, a menu driven search and a BLAST search. The entries are also linked to several external databases, including the NCBI and the Protein Data Bank, providing wide background information. The database is freely available online at: CONCLUSION: DSD is a unique compilation available on-line for the first time which provides a key resource for the comparative analysis of reductase hydrogen transfer stereospecificity. As databases increasingly form the backbone of science, largely complete databases such as DSD, are a vital addition

Removing organic contamination from water, using UV radiation.

Diplomová práce se zabývá možnostmi využití UV záření pro odstranění nežádoucích látek z vod. V teoretické části shrnuje zdroje UV záření pro vodárenské aplikace, jejich výhody a specifika. Jsou zde popsány takzvané pokročilé oxidační procesy využívající právě tento druh záření. Dále jsou rozvedeny degradační procesy skupiny polutantů pyridinu a jeho derivátů, konkrétně halogenovaných derivátů. V experimentální části je zkoumána fotodegradabilita a rychlost odstranění pyridinu z modelové vody cirkulující v uzavřeném systému. Je hodnocen jak vliv koncentrace pyridinu v této modelové vodě, tak působení dávky přidaného peroxidu vodíku. Ke stanovení koncentrací pyridinu v odebraných vzorcích bylo využito plynové chromatografie.This diploma thesis focuses on possibilities of applications of UV radiation to remove pollutants from water. It summarizes sources of UV radiation and list their benefits and properties. The thesis characterizes so called advanced oxidation processes using UV light. Degradation pathways od pyridine and its derivatives especially halogenated pyridines are described. The photodegradability of pyridine and a rate of this reaction in model water is investigated in the experimental part. Also, the effect of concentration and dose of H2O2 is assessed. Gas chromatography was used to determinate concentrations of pyridine in samples.