ICTERI 2020: ІКТ в освіті, дослідженнях та промислових застосуваннях. Інтеграція, гармонізація та передача знань 2020: Матеріали 16-ї Міжнародної конференції. Том II: Семінари. Харків, Україна, 06-10 жовтня 2020 р.

This volume represents the proceedings of the Workshops co-located with the 16th International Conference on ICT in Education, Research, and Industrial Applications, held in Kharkiv, Ukraine, in October 2020. It comprises 101 contributed papers that were carefully peer-reviewed and selected from 233 submissions for the five workshops: RMSEBT, TheRMIT, ITER, 3L-Person, CoSinE, MROL. The volume is structured in six parts, each presenting the contributions for a particular workshop. The topical scope of the volume is aligned with the thematic tracks of ICTERI 2020: (I) Advances in ICT Research; (II) Information Systems: Technology and Applications; (III) Academia/Industry ICT Cooperation; and (IV) ICT in Education.Цей збірник представляє матеріали семінарів, які були проведені в рамках 16-ї Міжнародної конференції з ІКТ в освіті, наукових дослідженнях та промислових застосуваннях, що відбулася в Харкові, Україна, у жовтні 2020 року. Він містить 101 доповідь, які були ретельно рецензовані та відібрані з 233 заявок на участь у п'яти воркшопах: RMSEBT, TheRMIT, ITER, 3L-Person, CoSinE, MROL. Збірник складається з шести частин, кожна з яких представляє матеріали для певного семінару. Тематична спрямованість збірника узгоджена з тематичними напрямками ICTERI 2020: (I) Досягнення в галузі досліджень ІКТ; (II) Інформаційні системи: Технології і застосування; (ІІІ) Співпраця в галузі ІКТ між академічними і промисловими колами; і (IV) ІКТ в освіті

Apport de la modélisation et des simulations de dynamique moléculaire à la description de STAT5 comme cible pour moduler la signalisation oncogénique

STAT5 is a protein involved in normal cell signalling that is crucial for transformation, survival and resistance to tyrosine kinase inhibitors of tumour cells. The constitutive phosphorylation activates STAT5 and is related to oncogenic proteins like the hybrid protein BCR/ABL1 (chronic myeloid leukaemia) or mutated KIT receptor (mastocytosis). The pharmacologic inhibition of STAT5 is thus a major therapeutic concern in several malignant pathologies. We performed the first modelling and molecular dynamics simulations of the main cellular species of STAT5: the cytoplasmic phosphorylated or unphosphorylated monomer, and the phosphorylated dimer bound to DNA. We characterized the dynamical properties and the intramolecular allosteric network of the monomers. The generated results show structural and dynamic variations linked to the primary sequence changes between the two STAT5 isoforms and/or to the phosphate group. Two pockets were characterized at the surface of STAT5. Their location at close proximity of allosteric communication pathways suggests new putative inhibition sites to modulate STAT5 functions. We also described the hydrogen bonds network between the monomers of the dimeric species and the recognition of the DNA. We identified key residues at the interfaces, allowing us to better understand the effects of clinically relevant STAT5 mutations observed in malignancies.STAT5 est une protéine de la signalisation cellulaire normale, qui peut jouer un rôle important dans la transformation, la survie et à la résistance aux inhibiteurs de tyrosine kinase des cellules tumorales. Son activation constitutive par phosphorylation est liée à la présence de protéines oncogéniques comme la protéine de fusion BCR/ABL1 (leucémie myéloïde chronique) ou de formes mutées de KIT (mastocytoses), par exemple. L’inhibition pharmacologique de STAT5 constitue donc un enjeu thérapeutique majeur pour plusieurs pathologies malignes. Nous avons réalisé la première modélisation et les simulations de dynamique moléculaire des principales formes de STAT5 : la forme monomérique cytoplasmique phosphorylée ou non, et la forme dimérique phosphorylée et liée à l’ADN. Nous avons caractérisé les propriétés dynamiques et le réseau allostérique intramoléculaire des monomères de STAT5. Les résultats générés montrent des variations structurales et dynamiques liées à la différence de séquence primaire des isoformes de STAT5 et/ou à la présence du groupement phosphate. Deux poches à la surface des protéines ont également été caractérisées. Leur localisation à proximité de voies de communication allostériques suggère que ces poches pourraient constituer des sites de modulation des fonctions de STAT5. Nous avons également caractérisé les liaisons hydrogènes entre les monomères constituant les dimères de STAT5 et leur reconnaissance de l’ADN. En outre, nous avons identifié des résidus clés aux interfaces entre les entités moléculaires, nous permettant de mieux comprendre les effets de mutations de STAT5 observées en clinique dans certaines pathologies malignes