An Efficient Coding Method for Teleconferencing Video and Confocal Microscopic Image Sequences

In this paper we propose a three-dimensional vector quantization based video coding scheme. The algorithm uses a 3D vector quantization pyramidal code book based model with adaptive code book pyramidal codebook for compression. The pyramidal code book based model helps in getting high compression in case of modest motion. The adaptive vector quantization algorithm is used to train the code book for optimal performance with time. Some of the distinguished features of our algorithm are its excellent performance due to its adaptive behavior to the video composition and excellent compression due to codebook approach. We also propose an efficient codebook based post processing technique which enables the vector quantizer to possess higher correlation preservation property. Based on the special pattern of the codebook imposed by post-processing technique, a window based fast search (WBFS) algorithm is proposed. The WBFS algorithm not only accelerates the vector quantization processing, but also results in better rate-distortion performance. The proposed approach can be used for both teleconferencing videos and to compress images obtained from confocal laser scanning microscopy (CLSM). The results show that the proposed method gave higher subjective and objective image quality of reconstructed images at a better compression ratio and presented more acceptable results when applying image processing filters such as edge detection on reconstructed images. The experimental results demonstrate that the proposed method outperforms the teleconferencing compression standards H.261 and LBG based vector quantization technique

Author Index

Author Index: CIT Vol. 16 (2008), No 1–

Quantitative Analysis of Chromosome/Gene Spatial Distribution

Zusammenfassung Die Fortschritte in den Bereichen Zellbildgebung und Mikroskopie haben eine intensive Untersuchung der räumlichen Anordnung von Chromosomen bzw. Genen im Verlauf der letzten Jahre möglich gemacht. Es wurden bereits Algorithmen zur Quantifizierung der räumlichen Anordnung von Chromosomen bzw. Genen entwickelt, wobei die meisten dieser Methoden jedoch auf zweidimensionalen (2D) Bilddaten basieren. Um dreidimensionale (3D) konfokale Bilddaten verarbeiten zu können, ist es notwendig neue Algorithmen zu entwickeln, die auf 3D Datensätzen basieren. In dieser Arbeit werden neue Methoden zur Beschreibung, Analyse und Visualisierung der 3D Verteilung von Chromosomen und Genen in fixierten Zellkernen in 3D Bilddaten präsentiert, die basierend auf Konzepten der objektorientierten Programmierung in der Programmiersprache Java implementiert wurden. Kapitel 2 beschreibt verschiedene Softwarewerkzeuge zur Bestimmung von Ähnlichkeiten der Anordnung von Chromosomen unter Verwendung der Krümmungsenergie von Thin-plate Splines sowie zur Berechnung von geometrischen Mittelpunkten, Distanzen und Winkeln. Zwei anwendungsorientierte Projekte zur räumlichen Verteilung von Chromosomen bzw. Genen werden in Kapitel 3 bzw. Kapitel 4 vorgestellt. Die Vorteile, Grenzen und weitere Verbesserungen von diesen Computermethoden werden ausführlich in Kapitel 5 behandelt. Danach wird ein neues Modell der Vererbung der räumlichen Chromosomenordnung erläutert. Die quantitative Analyse in Kapitel 3 zeigt, dass die Unterschiede in der Anordnung von Chromosomenterritorien kontinuierlich mit der Anzahl der Zellgenerationen (d.h. Zellteilungen) zunehmen. In HeLa Zellklonen sind die Unähnlichkeiten in der Anordnung von Chromosomenterritorien nach fünf oder sechs Zellteilungen bereits so groß wie die zwischen unverwandten, zufällig ausgewählten Zellen. Die quantitative Analyse in Kapitel 4 zeigt, dass während der Interphase die Positionen der untersuchten Gene (MLL und fünf seiner Translokationspartner) sowie von vier chromosomalen Kontroll-Loci ein charakteristisches Verteilungsmuster innerhalb des Zellkerns besitzen. Dies gilt für jede der untersuchten hämatopoietischen Zellen. Die in dieser Arbeit präsentierten Methoden zur Bestimmung der Ähnlichkeit der Anordnung von Chromosomen unter Verwendung von punktbasierter Registrierung liefern zum ersten Mal Beispiele zur Analyse und Bewertung der Vererbung einer räumlichen Verteilung von Chromosomen über mehrere Zellteilungen hinweg. Gleichzeitig wird zum ersten Mal die räumliche Verteilung von Genen, vor allem des Genes MLL und einiger Translokationspartner, im 3D Raum des Interphasezellkerns hämatopoietischer Zellen quantitativ beschrieben

Life Sciences Program Tasks and Bibliography for FY 1996

This document includes information on all peer reviewed projects funded by the Office of Life and Microgravity Sciences and Applications, Life Sciences Division during fiscal year 1996. This document will be published annually and made available to scientists in the space life sciences field both as a hard copy and as an interactive Internet web page

Life Sciences Program Tasks and Bibliography

This document includes information on all peer reviewed projects funded by the Office of Life and Microgravity Sciences and Applications, Life Sciences Division during fiscal year 1995. Additionally, this inaugural edition of the Task Book includes information for FY 1994 programs. This document will be published annually and made available to scientists in the space life sciences field both as a hard copy and as an interactive Internet web pag

Biometrics

Biometrics uses methods for unique recognition of humans based upon one or more intrinsic physical or behavioral traits. In computer science, particularly, biometrics is used as a form of identity access management and access control. It is also used to identify individuals in groups that are under surveillance. The book consists of 13 chapters, each focusing on a certain aspect of the problem. The book chapters are divided into three sections: physical biometrics, behavioral biometrics and medical biometrics. The key objective of the book is to provide comprehensive reference and text on human authentication and people identity verification from both physiological, behavioural and other points of view. It aims to publish new insights into current innovations in computer systems and technology for biometrics development and its applications. The book was reviewed by the editor Dr. Jucheng Yang, and many of the guest editors, such as Dr. Girija Chetty, Dr. Norman Poh, Dr. Loris Nanni, Dr. Jianjiang Feng, Dr. Dongsun Park, Dr. Sook Yoon and so on, who also made a significant contribution to the book