Compression et transmission d'images avec énergie minimale application aux capteurs sans fil

Un réseau de capteurs d'images sans fil (RCISF) est un réseau ad hoc formé d'un ensemble de noeuds autonomes dotés chacun d'une petite caméra, communiquant entre eux sans liaison filaire et sans l'utilisation d'une infrastructure établie, ni d'une gestion de réseau centralisée. Leur utilité semble majeure dans plusieurs domaines, notamment en médecine et en environnement. La conception d'une chaîne de compression et de transmission sans fil pour un RCISF pose de véritables défis. L'origine de ces derniers est liée principalement à la limitation des ressources des capteurs (batterie faible , capacité de traitement et mémoire limitées). L'objectif de cette thèse consiste à explorer des stratégies permettant d'améliorer l'efficacité énergétique des RCISF, notamment lors de la compression et de la transmission des images. Inéluctablement, l'application des normes usuelles telles que JPEG ou JPEG2000 est éner- givore, et limite ainsi la longévité des RCISF. Cela nécessite leur adaptation aux contraintes imposées par les RCISF. Pour cela, nous avons analysé en premier lieu, la faisabilité d'adapter JPEG au contexte où les ressources énergétiques sont très limitées. Les travaux menés sur cet aspect nous permettent de proposer trois solutions. La première solution est basée sur la propriété de compactage de l'énergie de la Transformée en Cosinus Discrète (TCD). Cette propriété permet d'éliminer la redondance dans une image sans trop altérer sa qualité, tout en gagnant en énergie. La réduction de l'énergie par l'utilisation des régions d'intérêts représente la deuxième solution explorée dans cette thèse. Finalement, nous avons proposé un schéma basé sur la compression et la transmission progressive, permettant ainsi d'avoir une idée générale sur l'image cible sans envoyer son contenu entier. En outre, pour une transmission non énergivore, nous avons opté pour la solution suivante. N'envoyer fiablement que les basses fréquences et les régions d'intérêt d'une image. Les hautes fréquences et les régions de moindre intérêt sont envoyées""infiablement"", car leur pertes n'altèrent que légèrement la qualité de l'image. Pour cela, des modèles de priorisation ont été comparés puis adaptés à nos besoins. En second lieu, nous avons étudié l'approche par ondelettes (wavelets ). Plus précisément, nous avons analysé plusieurs filtres d'ondelettes et déterminé les ondelettes les plus adéquates pour assurer une faible consommation en énergie, tout en gardant une bonne qualité de l'image reconstruite à la station de base. Pour estimer l'énergie consommée par un capteur durant chaque étape de la 'compression, un modèle mathématique est développé pour chaque transformée (TCD ou ondelette). Ces modèles, qui ne tiennent pas compte de la complexité de l'implémentation, sont basés sur le nombre d'opérations de base exécutées à chaque étape de la compression

Nouvelles méthodes de prédiction inter-images pour la compression d’images et de vidéos

Due to the large availability of video cameras and new social media practices, as well as the emergence of cloud services, images and videosconstitute today a significant amount of the total data that is transmitted over the internet. Video streaming applications account for more than 70% of the world internet bandwidth. Whereas billions of images are already stored in the cloud and millions are uploaded every day. The ever growing streaming and storage requirements of these media require the constant improvements of image and video coding tools. This thesis aims at exploring novel approaches for improving current inter-prediction methods. Such methods leverage redundancies between similar frames, and were originally developed in the context of video compression. In a first approach, novel global and local inter-prediction tools are associated to improve the efficiency of image sets compression schemes based on video codecs. By leveraging a global geometric and photometric compensation with a locally linear prediction, significant improvements can be obtained. A second approach is then proposed which introduces a region-based inter-prediction scheme. The proposed method is able to improve the coding performances compared to existing solutions by estimating and compensating geometric and photometric distortions on a semi-local level. This approach is then adapted and validated in the context of video compression. Bit-rate improvements are obtained, especially for sequences displaying complex real-world motions such as zooms and rotations. The last part of the thesis focuses on deep learning approaches for inter-prediction. Deep neural networks have shown striking results for a large number of computer vision tasks over the last years. Deep learning based methods proposed for frame interpolation applications are studied here in the context of video compression. Coding performance improvements over traditional motion estimation and compensation methods highlight the potential of these deep architectures.En raison de la grande disponibilité des dispositifs de capture vidéo et des nouvelles pratiques liées aux réseaux sociaux, ainsi qu’à l’émergence desservices en ligne, les images et les vidéos constituent aujourd’hui une partie importante de données transmises sur internet. Les applications de streaming vidéo représentent ainsi plus de 70% de la bande passante totale de l’internet. Des milliards d’images sont déjà stockées dans le cloud et des millions y sont téléchargés chaque jour. Les besoins toujours croissants en streaming et stockage nécessitent donc une amélioration constante des outils de compression d’image et de vidéo. Cette thèse vise à explorer des nouvelles approches pour améliorer les méthodes actuelles de prédiction inter-images. De telles méthodes tirent parti des redondances entre images similaires, et ont été développées à l’origine dans le contexte de la vidéo compression. Dans une première partie, de nouveaux outils de prédiction inter globaux et locaux sont associés pour améliorer l’efficacité des schémas de compression de bases de données d’image. En associant une compensation géométrique et photométrique globale avec une prédiction linéaire locale, des améliorations significatives peuvent être obtenues. Une seconde approche est ensuite proposée qui introduit un schéma deprédiction inter par régions. La méthode proposée est en mesure d’améliorer les performances de codage par rapport aux solutions existantes en estimant et en compensant les distorsions géométriques et photométriques à une échelle semi locale. Cette approche est ensuite adaptée et validée dans le cadre de la compression vidéo. Des améliorations en réduction de débit sont obtenues, en particulier pour les séquences présentant des mouvements complexes réels tels que des zooms et des rotations. La dernière partie de la thèse se concentre sur l’étude des méthodes d’apprentissage en profondeur dans le cadre de la prédiction inter. Ces dernières années, les réseaux de neurones profonds ont obtenu des résultats impressionnants pour un grand nombre de tâches de vision par ordinateur. Les méthodes basées sur l’apprentissage en profondeur proposéesà l’origine pour de l’interpolation d’images sont étudiées ici dans le contexte de la compression vidéo. Des améliorations en terme de performances de codage sont obtenues par rapport aux méthodes d’estimation et de compensation de mouvements traditionnelles. Ces résultats mettent en évidence le fort potentiel de ces architectures profondes dans le domaine de la compression vidéo

Codage d'images avec et sans pertes à basse complexité et basé contenu

This doctoral research project aims at designing an improved solution of the still image codec called LAR (Locally Adaptive Resolution) for both compression performance and complexity. Several image compression standards have been well proposed and used in the multimedia applications, but the research does not stop the progress for the higher coding quality and/or lower coding consumption. JPEG was standardized twenty years ago, while it is still a widely used compression format today. With a better coding efficiency, the application of the JPEG 2000 is limited by its larger computation cost than the JPEG one. In 2008, the JPEG Committee announced a Call for Advanced Image Coding (AIC). This call aims to standardize potential technologies going beyond existing JPEG standards. The LAR codec was proposed as one response to this call. The LAR framework tends to associate the compression efficiency and the content-based representation. It supports both lossy and lossless coding under the same structure. However, at the beginning of this study, the LAR codec did not implement the rate-distortion-optimization (RDO). This shortage was detrimental for LAR during the AIC evaluation step. Thus, in this work, it is first to characterize the impact of the main parameters of the codec on the compression efficiency, next to construct the RDO models to configure parameters of LAR for achieving optimal or sub-optimal coding efficiencies. Further, based on the RDO models, a “quality constraint” method is introduced to encode the image at a given target MSE/PSNR. The accuracy of the proposed technique, estimated by the ratio between the error variance and the setpoint, is about 10%. Besides, the subjective quality measurement is taken into consideration and the RDO models are locally applied in the image rather than globally. The perceptual quality is improved with a significant gain measured by the objective quality metric SSIM (structural similarity). Aiming at a low complexity and efficient image codec, a new coding scheme is also proposed in lossless mode under the LAR framework. In this context, all the coding steps are changed for a better final compression ratio. A new classification module is also introduced to decrease the entropy of the prediction errors. Experiments show that this lossless codec achieves the equivalent compression ratio to JPEG 2000, while saving 76% of the time consumption in average in encoding and decoding.Ce projet de recherche doctoral vise à proposer solution améliorée du codec de codage d’images LAR (Locally Adaptive Resolution), à la fois d’un point de vue performances de compression et complexité. Plusieurs standards de compression d’images ont été proposés par le passé et mis à profit dans de nombreuses applications multimédia, mais la recherche continue dans ce domaine afin d’offrir de plus grande qualité de codage et/ou de plus faibles complexité de traitements. JPEG fut standardisé il y a vingt ans, et il continue pourtant à être le format de compression le plus utilisé actuellement. Bien qu’avec de meilleures performances de compression, l’utilisation de JPEG 2000 reste limitée due à sa complexité plus importe comparée à JPEG. En 2008, le comité de standardisation JPEG a lancé un appel à proposition appelé AIC (Advanced Image Coding). L’objectif était de pouvoir standardiser de nouvelles technologies allant au-delà des standards existants. Le codec LAR fut alors proposé comme réponse à cet appel. Le système LAR tend à associer une efficacité de compression et une représentation basée contenu. Il supporte le codage avec et sans pertes avec la même structure. Cependant, au début de cette étude, le codec LAR ne mettait pas en oeuvre de techniques d’optimisation débit/distorsions (RDO), ce qui lui fut préjudiciable lors de la phase d’évaluation d’AIC. Ainsi dans ce travail, il s’agit dans un premier temps de caractériser l’impact des principaux paramètres du codec sur l’efficacité de compression, sur la caractérisation des relations existantes entre efficacité de codage, puis de construire des modèles RDO pour la configuration des paramètres afin d’obtenir une efficacité de codage proche de l’optimal. De plus, basée sur ces modèles RDO, une méthode de « contrôle de qualité » est introduite qui permet de coder une image à une cible MSE/PSNR donnée. La précision de la technique proposée, estimée par le rapport entre la variance de l’erreur et la consigne, est d’environ 10%. En supplément, la mesure de qualité subjective est prise en considération et les modèles RDO sont appliqués localement dans l’image et non plus globalement. La qualité perceptuelle est visiblement améliorée, avec un gain significatif mesuré par la métrique de qualité objective SSIM. Avec un double objectif d’efficacité de codage et de basse complexité, un nouveau schéma de codage LAR est également proposé dans le mode sans perte. Dans ce contexte, toutes les étapes de codage sont modifiées pour un meilleur taux de compression final. Un nouveau module de classification est également introduit pour diminuer l’entropie des erreurs de prédiction. Les expérimentations montrent que ce codec sans perte atteint des taux de compression équivalents à ceux de JPEG 2000, tout en économisant 76% du temps de codage et de décodage

Discrete Wavelet Transforms

The discrete wavelet transform (DWT) algorithms have a firm position in processing of signals in several areas of research and industry. As DWT provides both octave-scale frequency and spatial timing of the analyzed signal, it is constantly used to solve and treat more and more advanced problems. The present book: Discrete Wavelet Transforms: Algorithms and Applications reviews the recent progress in discrete wavelet transform algorithms and applications. The book covers a wide range of methods (e.g. lifting, shift invariance, multi-scale analysis) for constructing DWTs. The book chapters are organized into four major parts. Part I describes the progress in hardware implementations of the DWT algorithms. Applications include multitone modulation for ADSL and equalization techniques, a scalable architecture for FPGA-implementation, lifting based algorithm for VLSI implementation, comparison between DWT and FFT based OFDM and modified SPIHT codec. Part II addresses image processing algorithms such as multiresolution approach for edge detection, low bit rate image compression, low complexity implementation of CQF wavelets and compression of multi-component images. Part III focuses watermaking DWT algorithms. Finally, Part IV describes shift invariant DWTs, DC lossless property, DWT based analysis and estimation of colored noise and an application of the wavelet Galerkin method. The chapters of the present book consist of both tutorial and highly advanced material. Therefore, the book is intended to be a reference text for graduate students and researchers to obtain state-of-the-art knowledge on specific applications

Flexible Hardware Architectures for Retinal Image Analysis

RÉSUMÉ Des millions de personnes autour du monde sont touchées par le diabète. Plusieurs complications oculaires telle que la rétinopathie diabétique sont causées par le diabète, ce qui peut conduire à une perte de vision irréversible ou même la cécité si elles ne sont pas traitées. Des examens oculaires complets et réguliers par les ophtalmologues sont nécessaires pour une détection précoce des maladies et pour permettre leur traitement. Comme solution préventive, un protocole de dépistage impliquant l'utilisation d'images numériques du fond de l'œil a été adopté. Cela permet aux ophtalmologistes de surveiller les changements sur la rétine pour détecter toute présence d'une maladie oculaire. Cette solution a permis d'obtenir des examens réguliers, même pour les populations des régions éloignées et défavorisées. Avec la grande quantité d'images rétiniennes obtenues, des techniques automatisées pour les traiter sont devenues indispensables. Les techniques automatisées de détection des maladies des yeux ont été largement abordées par la communauté scientifique. Les techniques développées ont atteint un haut niveau de maturité, ce qui a permis entre autre le déploiement de solutions en télémédecine. Dans cette thèse, nous abordons le problème du traitement de volumes élevés d'images rétiniennes dans un temps raisonnable dans un contexte de dépistage en télémédecine. Ceci est requis pour permettre l'utilisation pratique des techniques développées dans le contexte clinique. Dans cette thèse, nous nous concentrons sur deux étapes du pipeline de traitement des images rétiniennes. La première étape est l'évaluation de la qualité de l'image rétinienne. La deuxième étape est la segmentation des vaisseaux sanguins rétiniens. L’évaluation de la qualité des images rétinienne après acquisition est une tâche primordiale au bon fonctionnement de tout système de traitement automatique des images de la rétine. Le rôle de cette étape est de classifier les images acquises selon leurs qualités, et demander une nouvelle acquisition en cas d’image de mauvaise qualité. Plusieurs algorithmes pour évaluer la qualité des images rétiniennes ont été proposés dans la littérature. Cependant, même si l'accélération de cette tâche est requise en particulier pour permettre la création de systèmes mobiles de capture d'images rétiniennes, ce sujet n'a pas encore été abordé dans la littérature. Dans cette thèse, nous ciblons un algorithme qui calcule les caractéristiques des images pour permettre leur classification en mauvaise, moyenne ou bonne qualité. Nous avons identifié le calcul des caractéristiques de l'image comme une tâche répétitive qui nécessite une accélération. Nous nous sommes intéressés plus particulièrement à l’accélération de l’algorithme d’encodage à longueur de séquence (Run-Length Matrix – RLM). Nous avons proposé une première implémentation complètement logicielle mise en œuvre sous forme d’un système embarqué basé sur la technologie Zynq de Xilinx. Pour accélérer le calcul des caractéristiques, nous avons conçu un co-processeur capable de calculer les caractéristiques en parallèle implémenté sur la logique programmable du FPGA Zynq. Nous avons obtenu une accélération de 30,1 × pour la tâche de calcul des caractéristiques de l’algorithme RLM par rapport à son implémentation logicielle sur la plateforme Zynq. La segmentation des vaisseaux sanguins rétiniens est une tâche clé dans le pipeline du traitement des images de la rétine. Les vaisseaux sanguins et leurs caractéristiques sont de bons indicateurs de la santé de la rétine. En outre, leur segmentation peut également aider à segmenter les lésions rouges, indicatrices de la rétinopathie diabétique. Plusieurs techniques de segmentation des vaisseaux sanguins rétiniens ont été proposées dans la littérature. Des architectures matérielles ont également été proposées pour accélérer certaines de ces techniques. Les architectures existantes manquent de performances et de flexibilité de programmation, notamment pour les images de haute résolution. Dans cette thèse, nous nous sommes intéressés à deux techniques de segmentation du réseau vasculaire rétinien, la technique du filtrage adapté et la technique des opérateurs de ligne. La technique de filtrage adapté a été ciblée principalement en raison de sa popularité. Pour cette technique, nous avons proposé deux architectures différentes, une architecture matérielle personnalisée mise en œuvre sur FPGA et une architecture basée sur un ASIP. L'architecture matérielle personnalisée a été optimisée en termes de surface et de débit de traitement pour obtenir des performances supérieures par rapport aux implémentations existantes dans la littérature. Cette implémentation est plus efficace que toutes les implémentations existantes en termes de débit. Pour l'architecture basée sur un processeur à jeu d’instructions spécialisé (Application-Specific Instruction-set Processor – ASIP), nous avons identifié deux goulets d'étranglement liés à l'accès aux données et à la complexité des calculs de l'algorithme. Nous avons conçu des instructions spécifiques ajoutées au chemin de données du processeur. L'ASIP a été rendu 7.7 × plus rapide par rapport à son architecture de base. La deuxième technique pour la segmentation des vaisseaux sanguins est l'algorithme détecteur de ligne multi-échelle (Multi-Scale Ligne Detector – MSLD). L'algorithme MSLD est choisi en raison de ses performances et de son potentiel à détecter les petits vaisseaux sanguins. Cependant, l'algorithme fonctionne en multi-échelle, ce qui rend l’algorithme gourmand en mémoire. Pour résoudre ce problème et permettre l'accélération de son exécution, nous avons proposé un algorithme efficace en terme de mémoire, conçu et implémenté sur FPGA. L'architecture proposée a réduit de façon drastique les exigences de l’algorithme en terme de mémoire en réutilisant les calculs et la co-conception logicielle/matérielle. Les deux architectures matérielles proposées pour la segmentation du réseau vasculaire rétinien ont été rendues flexibles pour pouvoir traiter des images de basse et de haute résolution. Ceci a été réalisé par le développement d'un compilateur spécifique capable de générer une description HDL de bas niveau de l'algorithme à partir d'un ensemble de paramètres. Le compilateur nous a permis d’optimiser les performances et le temps de développement. Dans cette thèse, nous avons introduit deux architectures qui sont, au meilleur de nos connaissances, les seules capables de traiter des images à la fois de basse et de haute résolution.----------ABSTRACT Millions of people all around the world are affected by diabetes. Several ocular complications such as diabetic retinopathy are caused by diabetes, which can lead to irreversible vision loss or even blindness if not treated. Regular comprehensive eye exams by eye doctors are required to detect the diseases at earlier stages and permit their treatment. As a preventing solution, a screening protocol involving the use of digital fundus images was adopted. This allows eye doctors to monitor changes in the retina to detect any presence of eye disease. This solution made regular examinations widely available, even to populations in remote and underserved areas. With the resulting large amount of retinal images, automated techniques to process them are required. Automated eye detection techniques are largely addressed by the research community, and now they reached a high level of maturity, which allows the deployment of telemedicine solutions. In this thesis, we are addressing the problem of processing a high volume of retinal images in a reasonable time. This is mandatory to allow the practical use of the developed techniques in a clinical context. In this thesis, we focus on two steps of the retinal image pipeline. The first step is the retinal image quality assessment. The second step is the retinal blood vessel segmentation. The evaluation of the quality of the retinal images after acquisition is a primary task for the proper functioning of any automated retinal image processing system. The role of this step is to classify the acquired images according to their quality, which will allow an automated system to request a new acquisition in case of poor quality image. Several algorithms to evaluate the quality of retinal images were proposed in the literature. However, even if the acceleration of this task is required, especially to allow the creation of mobile systems for capturing retinal images, this task has not yet been addressed in the literature. In this thesis, we target an algorithm that computes image features to allow their classification to bad, medium or good quality. We identified the computation of image features as a repetitive task that necessitates acceleration. We were particularly interested in accelerating the Run-Length Matrix (RLM) algorithm. We proposed a first fully software implementation in the form of an embedded system based on Xilinx's Zynq technology. To accelerate the features computation, we designed a co-processor able to compute the features in parallel, implemented on the programmable logic of the Zynq FPGA. We achieved an acceleration of 30.1× over its software implementation for the features computation part of the RLM algorithm. Retinal blood vessel segmentation is a key task in the pipeline of retinal image processing. Blood vessels and their characteristics are good indicators of retina health. In addition, their segmentation can also help to segment the red lesions, indicators of diabetic retinopathy. Several techniques have been proposed in the literature to segment retinal blood vessels. Hardware architectures have also been proposed to accelerate blood vessel segmentation. The existing architectures lack in terms of performance and programming flexibility, especially for high resolution images. In this thesis, we targeted two techniques, matched filtering and line operators. The matched filtering technique was targeted mainly because of its popularity. For this technique, we proposed two different architectures, a custom hardware architecture implemented on FPGA, and an Application Specific Instruction-set Processor (ASIP) based architecture. The custom hardware architecture area and timing were optimized to achieve higher performances in comparison to existing implementations. Our custom hardware implementation outperforms all existing implementations in terms of throughput. For the ASIP based architecture, we identified two bottlenecks related to data access and computation intensity of the algorithm. We designed two specific instructions added to the processor datapath. The ASIP was made 7.7× more efficient in terms of execution time compared to its basic architecture. The second technique for blood vessel segmentation is the Multi-Scale Line Detector (MSLD) algorithm. The MSLD algorithm is selected because of its performance and its potential to detect small blood vessels. However, the algorithm works at multiple scales which makes it memory intensive. To solve this problem and allow the acceleration of its execution, we proposed a memory-efficient algorithm designed and implemented on FPGA. The proposed architecture reduces drastically the memory requirements of the algorithm by reusing the computations and SW/HW co-design. The two hardware architectures proposed for retinal blood vessel segmentation were made flexible to be able to process low and high resolution images. This was achieved by the development of a specific compiler able to generate low-level HDL descriptions of the algorithm from a set of the algorithm parameters. The compiler enabled us to optimize performance and development time. In this thesis, we introduce two novel architectures which are, to the best of our knowledge, the only ones able to process both low and high resolution images

Modélisation du comportement mécanique de la neige à partir d'images microtomographiques

Characterizing the complex microstructure of snow and its mechanics is a major challenge for avalanche forecasting and hazard mapping. While the effect of environmental conditions on the snow metamorphism, which leads to numerous snow types, is fairly known, the relation between snow microstructure and mechanical properties is poorly understood because of the very fragile nature of snow. In order to decipher this relation for dry snow, this thesis presents a modeling approach of snow mechanics based on the three-dimensional microstructure of snow captured by X-ray microtomography and the properties of ice. First, in order to automatically process the microtomographic data, we take advantage of the minimization of the snow surface energy through metamorphism to efficiently binary segment grayscale images. Second, assuming an elastic brittle behavior of the ice matrix, the tensile strength of snow is modeled via a finite element approach. The model reveals an apparent pseudo-plastic behavior caused by damage, and the highly heterogenous stress distribution in the ice matrix. Third, we develop a discrete element model, accounting for grain-rearrangements and the creation/failure of inter-granular contacts. The grains, geometric input of the model, are detected in the microstructure with mechanically-relevant criteria and described as rigid clumps of spheres. The model evidences that the compression behavior of snow is mainly controlled by density but that the first stage of deformation is also sensible to the snow type. Last, the inter-granular bonds, recognized to be critical for the mechanical properties, are characterized through a new microstructural indicator, which effectively highly correlates with the simulated mechanical and physical properties.Caractériser les propriétés mécaniques de la neige est un défi majeur pour la prévision et la prédétermination du risque d’avalanche. Du fait du grand nombre de types de neige et de la difficulté à effectuer des mesures sur ce matériau très fragile, la compréhension de la relation entre la microstructure de la neige et ses propriétés mécaniques est encore incomplète. Cette thèse aborde ce problème par le biais d’une approche de modélisation mécanique basée sur la microstructure tridimensionnelle de neige obtenue par microtomographie aux rayons X. Tout d’abord, afin d’automatiser et améliorer la segmentation des images microtomographiques, un nouvel algorithme tirant profit de la minimisation de l’énergie de surface de la neige a été développé et évalué. L’image air-glace est ensuite utilisée comme entrée géométrique d’un modèle éléments finis où la glace est supposée élastique fragile. Ce modèle permet de reproduire le comportement fragile en traction et révèle le comportement pseudoplastique apparent causé par l’endommagement microscopique, ainsi que la forte hétérogénéité des contraintes dans la matrice de glace. Pour reproduire les grandes déformations impliquant le ré-arrangement de grains, un modèle par éléments discrets a ensuite été développé. Les grains sont identifiés dans la microstructure en utilisant des critères géométriques dont la pertinence mécanique a été démontrée, et décrits dans le modèle par des blocs rigides de sphères. Le comportement simulé en compression est dominé par le rôle de la densité mais révèle également des différences liées au type de neige. Enfin, pour distinguer le degré de cohésion entre les types de neige, un indicateur microstructurel a été développé et s’est avéré être fortement corrélé aux propriétés mécaniques et physiques du matériau

Contribution à l'analyse de la dynamique des écritures anciennes pour l'aide à l'expertise paléographique

Mes travaux de thèse s inscrivent dans le cadre du projet ANR GRAPHEM1 (Graphemebased Retrieval and Analysis for PaleograpHic Expertise of Middle Age Manuscripts). Ilsprésentent une contribution méthodologique applicable à l'analyse automatique des écrituresanciennes pour assister les experts en paléographie dans le délicat travail d étude et dedéchiffrage des écritures.L objectif principal est de contribuer à une instrumetation du corpus des manuscritsmédiévaux détenus par l Institut de Recherche en Histoire des Textes (IRHT Paris) en aidantles paléographes spécialisés dans ce domaine dans leur travail de compréhension de l évolutiondes formes de l écriture par la mise en place de méthodes efficaces d accès au contenu desmanuscrits reposant sur une analyse fine des formes décrites sous la formes de petits fragments(les graphèmes). Dans mes travaux de doctorats, j ai choisi d étudier la dynamique del élément le plus basique de l écriture appelé le ductus2 et qui d après les paléographes apportebeaucoup d informations sur le style d écriture et l époque d élaboration du manuscrit.Mes contributions majeures se situent à deux niveaux : une première étape de prétraitementdes images fortement dégradées assurant une décomposition optimale des formes en graphèmescontenant l information du ductus. Pour cette étape de décomposition des manuscrits, nousavons procédé à la mise en place d une méthodologie complète de suivi de traits à partir del extraction d un squelette obtenu à partir de procédures de rehaussement de contraste et dediffusion de gradients. Le suivi complet du tracé a été obtenu à partir de l application des règlesfondamentales d exécution des traits d écriture, enseignées aux copistes du Moyen Age. Il s agitd information de dynamique de formation des traits portant essentiellement sur des indicationsde directions privilégiées.Dans une seconde étape, nous avons cherché à caractériser ces graphèmes par desdescripteurs de formes visuelles compréhensibles à la fois par les paléographes et lesinformaticiens et garantissant une représentation la plus complète possible de l écriture d unpoint de vue géométrique et morphologique. A partir de cette caractérisation, nous avonsproposé une approche de clustering assurant un regroupement des graphèmes en classeshomogènes par l utilisation d un algorithme de classification non-supervisé basée sur lacoloration de graphe. Le résultat du clustering des graphèmes a conduit à la formation dedictionnaires de formes caractérisant de manière individuelle et discriminante chaque manuscrittraité. Nous avons également étudié la puissance discriminatoire de ces descripteurs afin d obtenir la meilleure représentation d un manuscrit en dictionnaire de formes. Cette étude a étéfaite en exploitant les algorithmes génétiques par leur capacité à produire de bonne sélection decaractéristiques.L ensemble de ces contributions a été testé à partir d une application CBIR sur trois bases demanuscrits dont deux médiévales (manuscrits de la base d Oxford et manuscrits de l IRHT, baseprincipale du projet), et une base comprenant de manuscrits contemporains utilisée lors de lacompétition d identification de scripteurs d ICDAR 2011. L exploitation de notre méthode dedescription et de classification a été faite sur une base contemporaine afin de positionner notrecontribution par rapport aux autres travaux relevant du domaine de l identification d écritures etétudier son pouvoir de généralisation à d autres types de documents. Les résultats trèsencourageants que nous avons obtenus sur les bases médiévales et la base contemporaine, ontmontré la robustesse de notre approche aux variations de formes et de styles et son caractèrerésolument généralisable à tout type de documents écrits.My thesis work is part of the ANR GRAPHEM Project (Grapheme based Retrieval andAnalysis for Expertise paleographic Manuscripts of Middle Age). It represents a methodologicalcontribution applicable to the automatic analysis of ancient writings to assist the experts inpaleography in the delicate work of the studying and deciphering the writing.The main objective is to contribute to an instrumentation of the corpus of medievalmanuscripts held by Institut de Recherche en Histoire de Textes (IRHT-Paris), by helping thepaleographers specialized in this field in their work of understanding the evolution of forms inthe writing, with the establishment of effective methods to access the contents of manuscriptsbased on a fine analysis of the forms described in the form of small fragments (graphemes). Inmy PhD work, I chose to study the dynamic of the most basic element of the writing called theductus and which according to the paleographers, brings a lot of information on the style ofwriting and the era of the elaboration of the manuscript.My major contribution is situated at two levels: a first step of preprocessing of severelydegraded images to ensure an optimal decomposition of the forms into graphemes containingthe ductus information. For this decomposition step of manuscripts, we have proceeded to theestablishment of a complete methodology for the tracings of strokes by the extraction of theskeleton obtained from the contrast enhancement and the diffusion of the gradient procedures.The complete tracking of the strokes was obtained from the application of fundamentalexecution rules of the strokes taught to the scribes of the Middle Ages. It is related to thedynamic information of the formation of strokes focusing essentially on indications of theprivileged directions.In a second step, we have tried to characterize the graphemes by visual shape descriptorsunderstandable by both the computer scientists and the paleographers and thus unsuring themost complete possible representation of the wrting from a geometrical and morphological pointof view. From this characterization, we have have proposed a clustering approach insuring agrouping of graphemes into homogeneous classes by using a non-supervised classificationalgorithm based on the graph coloring. The result of the clustering of graphemes led to theformation of a codebook characterizing in an individual and discriminating way each processedmanuscript. We have also studied the discriminating power of the descriptors in order to obtaina better representation of a manuscript into a codebook. This study was done by exploiting thegenetic algorithms by their ability to produce a good feature selection.The set of the contributions was tested from a CBIR application on three databases ofmanuscripts including two medieval databases (manuscripts from the Oxford and IRHTdatabases), and database of containing contemporary manuscripts used in the writersidentification contest of ICDAR 2011. The exploitation of our description and classificationmethod was applied on a cotemporary database in order to position our contribution withrespect to other relevant works in the writrings identification domain and study itsgeneralization power to other types of manuscripts. The very encouraging results that weobtained on the medieval and contemporary databases, showed the robustness of our approachto the variations of the shapes and styles and its resolutely generalized character to all types ofhandwritten documents.PARIS5-Bibliotheque electronique (751069902) / SudocSudocFranceF

Mobile Robots Navigation

Mobile robots navigation includes different interrelated activities: (i) perception, as obtaining and interpreting sensory information; (ii) exploration, as the strategy that guides the robot to select the next direction to go; (iii) mapping, involving the construction of a spatial representation by using the sensory information perceived; (iv) localization, as the strategy to estimate the robot position within the spatial map; (v) path planning, as the strategy to find a path towards a goal location being optimal or not; and (vi) path execution, where motor actions are determined and adapted to environmental changes. The book addresses those activities by integrating results from the research work of several authors all over the world. Research cases are documented in 32 chapters organized within 7 categories next described

Modeling and Analysis of Neural Spike Trains

open

Lysosome-related organelles: an investigation into clinical disorders of endothelial cells and platelets

Lysosome-related organelles (LROs) are a heterogeneous group of organelles that have important functions in a number of specialised cell types. LROs, despite their distinct features and morphology, have been grouped together due to the observation that they are simultaneously functionally perturbed by single mutations in a number of genetic disorders, yet as a group they are still poorly understood. Firstly, it was investigated whether the genes that are important for the formation/maturation of other LROs can also affect Weibel-Palade bodies (WPBs) an endothelial LRO that is critical to haemostasis and inflammation. In the genetic disorder Hermansky Pudlak syndrome (HPS) a number of LROs are affected, but the effect of these mutations on WPBs is not yet established. It was investigated whether these genes are indeed important for the biogenesis and function of WPBs, potentially revealing a new aspect of the disease phenotype. siRNA ablation in human endothelial cells of genes identified as involved in LRO biogenesis proved to give inconclusive results as to their importance in WPB formation and function. Secondly, the understanding of LRO-related genetic disorders would be aided by an improvement in diagnostics. The diagnosis of platelet storage disorders (PSDs) is currently limited to the observation of symptoms (e.g. a bleeding disorder or albinism) that are often shared with other, more common diseases. Most HPS patients are initially misdiagnosed and many see 4 to 6 specialists before being correctly identified. I investigated whether Super Resolution Microscopy, allowing images to be taken with a higher resolution than the diffraction limit (<200 nm), has the potential for improving the imaging of platelet granules and thereby the diagnosis and characterisation of LRO-related disorders. The use of structured illumination microscopy, coupled with automated image analysis bioinformatics allowed for a highly efficient differentiation between control and patient platelets