Le défi des pratiques d’intervention interculturelle dans le champ de la santé sexuelle

Un quart des 10 millions de personnes qui habitent en Ontario sont des membres d’uneminorité raciale, des immigrantes et immigrants récents ou des personnes réfugiées. Cela veutdire que parmi ces personnes, il y a plus d’un million de jeunes filles et de femmes qui ont unproblème commun : elles ne reçoivent pas les services de santé qu’elles méritent. (ministère dela Santé de l’Ontario 1993)

Marine cyanolichens from different littoral zones are associated with distinct bacterial communities

The microbial diversity and function of terrestrial lichens have been well studied, but knowledge about the non-photosynthetic bacteria associated with marine lichens is still scarce. 16S rRNA gene Illumina sequencing was used to assess the culture-independent bacterial diversity in the strictly marine cyanolichen species Lichina pygmaea and Lichina confinis, and the maritime chlorolichen species Xanthoria aureola which occupy different areas on the littoral zone. Inland terrestrial cyanolichens from Austria were also analysed as for the marine lichens to examine further the impact of habitat/lichen species on the associated bacterial communities. The L. confinis and L. pygmaea communities were significantly different from those of the maritime Xanthoria aureola lichen found higher up on the littoral zone and these latter communities were more similar to those of the inland terrestrial lichens. The strictly marine lichens were dominated by the Bacteroidetes phylum accounting for 50% of the sequences, whereas Alphaproteobacteria, notably Sphingomonas, dominated the maritime and the inland terrestrial lichens. Bacterial communities associated with the two Lichina species were significantly different sharing only 33 core OTUs, half of which were affiliated to the Bacteroidetes genera Rubricoccus, Tunicatimonas and Lewinella, suggesting an important role of these species in the marine Lichina lichen symbiosis. Marine cyanolichens showed a higher abundance of OTUs likely affiliated to moderately thermophilic and/or radiation resistant bacteria belonging to the Phyla Chloroflexi, Thermi, and the families Rhodothermaceae and Rubrobacteraceae when compared to those of inland terrestrial lichens. This most likely reflects the exposed and highly variable conditions to which they are subjected daily

Concevoir des innovations couplées à l'échelle des territoires pour permettre la réduction des produits phytosanitaires en production maraichère. Les enseignements du projet INTERLUDE

National audienceLe secteur du maraichage français doit concilier de multiples enjeux : assurer la sécurité sanitaire des consommateurs, réduire les impacts environnementaux des systèmes, favoriser la durabilité des exploitations agricoles. Beaucoup de pratiques qui favorisent les régulations naturelles ont été validées par la R&D (biocontrôle, diversification des rotations, apport de matière organique pour favoriser la vie du sol). Pourtant, le développement de modes de production agroécologiques est limité par un système sociotechnique dominant, verrouillé autour de technologies héritées de la période du « tout-chimique ». Le projet INTERLUDE (2020-2023) vise à favoriser les réorganisations des acteurs des filières amont et aval à l’échelle des territoires pour permettre le déploiement de systèmes maraichers agroécologiques. Le territoire est vu comme une échelle pertinente pour faire évoluer les stratégies de ces acteurs et permettre l’adoption de leviers agroécologiques. Une première étape a consisté à analyser par enquête les facteurs qui freinent le déploiement de systèmes agroécologiques dans 4 territoires (Provence, Roussillon, Martinique, Guadeloupe), qui se situent à l’échelle des exploitations agricoles, des filières amont et aval, du conseil, de la recherche et des institutions. Puis, chercheurs et acteurs des territoires ont co-conçu des prototypes qui combinent des innovations techniques (pratiques ou systèmes de culture agroécologiques) et des innovations économiques, sociales ou organisationnelles (cf concept d’innovation couplée, Meynard et al 2021). Ces prototypes combinent différentes formes de coordination : entre producteurs (ex : achat en commun et/ou échange d'outils, regroupement des productions pour une meilleure valorisation commerciale), entre producteurs et acteurs amont de la filière (ex : création de filières de fourniture d'intrants agroécologiques), entre producteurs et aval de la filière (ex : commercialisation de lots de légumes issus de systèmes très diversifiés). Nous proposons une typologie des innovations couplées conçues dans les 4 cas d’étude selon différentes dimensions : la nature des innovations couplées (combinaisons entre innovations techniques, logistiques, commerciales, économiques, sociales) ; le degré de changement technique requis (entre substitution et reconception) ; les modalités de gouvernance nécessaires pour développer ces innovations (gouvernance individuelle, corporatiste, de territoire ou de filière). Cette approche multi-acteurs et pluridisciplinaire devrait aider les acteurs à se réorganiser pour permettre un déploiement plus large de systèmes de culture agroécologiques

Des innovations couplées pour réduire l'utilisation de produits phytosanitaires en production maraîchère. Analyse transversale de 4 territoires en France métropolitaine et aux Antilles

Ce numéro fait suite au carrefour de l'innovation agronomique dédié aux innovations organisationnelles pour la transition agroécologique et des systèmes agri-alimentaires durables qui s'est déroulée en mars 2024 à VetSup Agro à Lembdes.National audienceAt a time when citizens and governments are calling for a sharp reduction in pesticide use, to protect human health and the environment, the transition of market garden farms to agro-ecological cropping;systems is proving difficult, due to barriers on the scale of agri-food systems, or even socio-technical lockin situations. To massify and accelerate the agro-ecological transition of farms, we mobilize the concept;of coupled innovation, i.e. the coordination of innovation processes of different natures (technical, ;organizational, regulatory, institutional, and social). We present participatory research approaches carried;out in 4 territories in France and the French West Indies, where researchers organized and facilitated;workshops to design innovations with key actors likely to unlock the socio-technical systems. After describing the prototypes of coupled innovation designed in each territory, we propose a cross-cutting;analysis. Our study illustrates the importance of fostering situated innovation, taking into account ions of emergence specific to each territory, but also of producing generic interdisciplinary and transdisciplinary research approaches to support their emergence.Alors que les citoyens et les Etats appellent à une forte réduction de l'utilisation des produits phytosanitaires pour préserver la santé humaine et l'environnement, la transition des exploitations maraîchères vers des systèmes de culture agroécologiques se fait difficilement, du fait de freins à l'échelle des systèmes agri-alimentaires, voire de verrouillages, autour de l'usage des produits phytosanitaires. Pour massifier et accélérer la transition agroécologique des exploitations, nous mobilisons le concept d'innovation couplée, qui désigne la coordination de processus d'innovation de différentes natures (techniques, organisationnelles, réglementaires, institutionnelles, sociales). Nous présentons des démarches de recherches participatives conduites sur 4 territoires, deux situés dans le Sud de la France métropolitaine et deux aux Antilles, où des chercheurs ont organisé et animé des ateliers pour concevoir des innovations couplées avec les principaux acteurs susceptibles de déverrouiller les situations. Après avoir décrit les prototypes d'innovation couplée dans chaque territoire, nous en proposons une analyse transversale : ainsi, l'analyse montre que les innovations techniques des 4 territoires ne pourront se développer à large échelle que si elles sont couplées à d'autres innovations, qui nécessitent des coordinations entre acteurs du système agri-alimentaire pour fournir des intrants agroécologiques ou des équipements, ou encore valoriser commercialement les légumes résultant de ces innovations techniques. Nos travaux illustrent l'intérêt à la fois de favoriser une innovation située, qui tienne compte des conditions d'émergence propres à chaque territoire, mais aussi de produire des démarches de recherches interdisciplinaires et transdisciplinaires génériques pour accompagner leur émergence

Lichen associated bacteria 16S rRNA Illumina sequences

Demultiplexed paired read Illumina 16SrRNA tag sequencing data for bacteria associated with different lichen species or in seawater. The data also includes 1 mock bacterial community comprised of 20 bacterial species. The associated text file gives the correspondence between the illumina paired read file numbers and the lichen sample, seawater or mock community identity.<br

Patients with advanced lung cancer harboring oncogenic mutations should be admitted to intensive care units

International audienc

Hybrid Approaches for our Participation to the n2c2 Challenge on Cohort Selection for Clinical Trials

15 pagesObjective: Natural language processing can help minimize human intervention in identifying patients meeting eligibility criteria for clinical trials, but there is still a long way to go to obtain a general and systematic approach that is useful for researchers. We describe two methods taking a step in this direction and present their results obtained during the n2c2 challenge on cohort selection for clinical trials. Materials and Methods: The first method is a weakly supervised method using an unlabeled corpus (MIMIC) to build a silver standard, by producing semi-automatically a small and very precise set of rules to detect some samples of positive and negative patients. This silver standard is then used to train a traditional supervised model. The second method is a terminology-based approach where a medical expert selects the appropriate concepts, and a procedure is defined to search the terms and check the structural or temporal constraints. Results: On the n2c2 dataset containing annotated data about 13 selection criteria on 288 patients, we obtained an overall F1-measure of 0.8969, which is the third best result out of 45 participant teams, with no statistically significant difference with the best-ranked team. Discussion: Both approaches obtained very encouraging results and apply to different types of criteria. The weakly supervised method requires explicit descriptions of positive and negative examples in some reports. The terminology-based method is very efficient when medical concepts carry most of the relevant information. Conclusion: It is unlikely that much more annotated data will be soon available for the task of identifying a wide range of patient phenotypes. One must focus on weakly or non-supervised learning methods using both structured and unstructured data and relying on a comprehensive representation of the patients

Randomised trial of first-line bronchial artery embolisation for non-severe haemoptysis of mild abundance

CERVOXY CLINInternational audienceBackgroundWhereas first-line bronchial artery embolisation (BAE) is considered standard of care for the management of severe haemoptysis, it is unknown whether this approach is warranted for non-severe haemoptysis Research question To assess the efficacy on bleeding control and the safety of first-line BAE in non-severe haemoptysis of mild abundance. Study design and methods This multicentre, randomised controlled open-label trial enrolled adult patients without major comorbid condition and having mild haemoptysis (onset <72 hours, 100–200 mL estimated bleeding amount), related to a systemic arterial mechanism. Patients were randomly assigned (1:1) to BAE associated with medical therapy or to medical therapy alone. Results Bleeding recurrence at day 30 after randomisation (primary outcome) occurred in 4 (11.8%) of 34 patients in the BAE strategy and 17 (44.7%) of 38 patients in the medical strategy (difference −33%; 95% CI −13.8% to −52.1%, p=0.002). The 90-day bleeding recurrence-free survival rates were 91.2% (95% CI 75.1% to 97.1%) and 60.2% (95% CI 42.9% to 73.8%), respectively (HR=0.19, 95% CI 0.05 to 0.67, p=0.01). No death occurred during follow-up and no bleeding recurrence needed surgery. Four adverse events (one major with systemic emboli) occurred during hospitalisation, all in the BAE strategy (11.8% vs 0%; difference 11.8%, 95% CI 0.9 to 22.6, p=0.045); all eventually resolved. Conclusion In non-severe haemoptysis of mild abundance, BAE associated with medical therapy had a superior efficacy for preventing bleeding recurrences at 30 and 90 days, as compared with medical therapy alone. However, it was associated with a higher rate of adverse events. Trial registration number NCT0127819