Isolation and Characterization of Pseudomonas spp. Strains That Efficiently Decompose Sodium Dodecyl Sulfate

Due to their particular properties, detergents are widely used in household cleaning products, cosmetics, pharmaceuticals, and in agriculture as adjuvants tailoring the features of pesticides or other crop protection agents. The continuously growing use of these various products means that water soluble detergents have become one of the most problematic groups of pollutants for the aquatic and terrestrial environments. Thus it is important to identify bacteria having the ability to survive in the presence of large quantities of detergent and efficiently decompose it to non-surface active compounds. In this study, we used peaty soil sampled from a surface flow constructed wetland in a wastewater treatment plant to isolate bacteria that degrade sodium dodecyl sulfate (SDS). We identified and initially characterized 36 Pseudomonas spp. strains that varied significantly in their ability to use SDS as their sole carbon source. Five isolates having the closest taxonomic relationship to the Pseudomonas jessenii subgroup appeared to be the most efficient SDS degraders, decomposing from 80 to 100% of the SDS present in an initial concentration 1 g/L in less than 24 h. These isolates exhibited significant differences in degree of SDS degradation, their resistance to high detergent concentration (ranging from 2.5 g/L up to 10 g/L or higher), and in chemotaxis toward SDS on a plate test. Mass spectrometry revealed several SDS degradation products, 1-dodecanol being dominant; however, traces of dodecanal, 2-dodecanol, and 3-dodecanol were also observed, but no dodecanoic acid. Native polyacrylamide gel electrophoresis zymography revealed that all of the selected isolates possessed alkylsulfatase-like activity. Three isolates, AP3_10, AP3_20, and AP3_22, showed a single band on native PAGE zymography, that could be the result of alkylsulfatase activity, whereas for isolates AP3_16 and AP3_19 two bands were observed. Moreover, the AP3_22 strain exhibited a band in presence of both glucose and SDS, whereas in other isolates, the band was visible solely in presence of detergent in the culture medium. This suggests that these microorganisms isolated from peaty soil exhibit exceptional capabilities to survive in, and break down SDS, and they should be considered as a valuable source of biotechnological tools for future bioremediation and industrial applications

Piękno jako szczyt natury oraz kultury – filozoficzno-teologiczne ujęcie piękna

The beauty revealed oneself in two spheres of the one reality: in nature and in culture – but as trancendentalium, beauty as exceeding beyond this reality. This way temporary beauty which is present in nature and culture is leading to Absolute Beauty. Article is presenting specifity of the beauty for nature and culture. So article is presenting the natural, craft and artistic dimension of the beauty in nature and culture, which entails philosophical dimension whom identifying beauty with being and theological dimension which suiting Divine element for the Beauty

Ocena progresji POChP na podstawie badania spirometrycznego i zdolności wysiłkowej

 INTRODUCTION: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is characterized by an airflow limitation that is usually progressive. The progression of COPD expressed as the rate of an annual decline in FEV 1 is very heterogeneous. Exercise capacity in COPD patients is often diminished and becomes worsened over the time. The purpose of the study was to examine how the change in FEV 1 and exercise capacity would deteriorate over long-term observation.MATERIAL AND METHODS: A total of 22 men with COPD were examined. At the beginning the average age was 59 ± 8.1 years and the mean post-bronchodilator FEV 1 was 52 ± 14.9% predicted. Pulmonary function testing was performed at entry and then each year for 10 years, and exercise testing on a cycle ergometer was performed at entry and after 10 years.RESULTS: FEV 1 and maximum oxygen uptake (VO2max), maximum mechanical work (W max ), maximum minute ventilation (V Emax ) and maximum tidal volume (V Tmax ) declined significantly over the observation time. The mean annual decline in FEV 1 was 42 ± 37 mL, and the mean decline for VO 2max was 30 ± 15 mL/min/yr and 0.44 ± 0.25 mL/min/kg/yr. Regression analysis revealed that the changes in FEV 1 do not predict changes in VO2max. We observed a correlation between the annual change in V Emax and annual change in VO2max (r = 0.51 p < 0.05). The baseline FEV 1 (expressed as a percentage of predicted and in absolute values) is the predictor of FEV 1 annual decline (r = 0.74 and 0.82; p < 0.05).CONCLUSIONS: We observed over time deterioration in exercise capacity in COPD patients which is independent of decline in airflow limitation. The long term follow-up of exercise capacity is important in monitoring of COPD patients in addition to pulmonary function. WSTĘP: Przewlekła obturacyjna choroba płuc (POChP) charakteryzuje się trwałym ograniczeniem przepływu powietrza przez dolne drogi oddechowe, które zwykle postępuje. Tempo progresji POChP wyrażane wielkością rocznego ubytku natężonej objętości wydechowej pierwszosekundowej (FEV 1 ) jest bardzo zróżnicowane. Przewlekła obturacyjna choroba płuc powoduje zmniejszenie zdolności wysiłkowej, które zwykle pogłębia się w miarę upływu choroby. Celem pracy była ocena progresji POChP na podstawie wielkości rocznego ubytku FEV 1 oraz zdolności wysiłkowej wyrażonej maksymalną konsumpcją tlenu (VO 2max ) w okresie 10 lat obserwacji.MATERIAŁ I METODY: Grupę badaną stanowiło 22 mężczyzn chorych na POChP w wieku 59,4 ± 8,1 roku, u których wyjściowa wartość FEV 1 po leku rozszerzającym oskrzela wynosiła 52 ± 14,9%. Badania czynnościowe układu oddechowego były przeprowadzane na początku oraz co roku przez 10 lat. Badania wysiłkowe wykonano na początku i po 10 latach.WYNIKI: Wartość FEV 1 oraz wskaźniki uzyskane podczas badania wysiłkowego — maksymalne zużycie tlenu (VO2max), maksymalna praca mechaniczna (W max ), maksymalna wentylacja minutowa (V Emax ) oraz maksymalna objętość oddechowa (V Tmax ) uległy istotnym zmianom po 10 latach: FEV 1 obniżyło się średnio o 42 ± 37 ml na rok, a średni ubytek VO2max wynosił 30 ± 15 ml/min/roki 0,44 ± 0,25 ml/min/kg/rok. Nie stwierdzono korelacji między rocznym ubytkiem FEV 1 i rocznym ubytkiem VO2max. Wykazano dodatnią korelację między rocznym ubytkiem V Emax i rocznym ubytkiem VO 2max (r = 0,51 p < 0,05). Wyjściowe FEV 1 (wyrażone jako % wartości należnej i w wartościach bezwzględnych) koreluje z rocznym ubytkiem FEV 1 (r = 0,74 i 0,82; p < 0,05).WNIOSKI: Progresja POChP określana wielkością utraty FEV 1 w ciągu roku wykazuje bardzo zróżnicowane tempo. Wraz z czasem trwania choroby dochodzi do obniżenia zdolności wysiłkowej wyrażanej VO 2max i jest to niezależne od tempa utraty FEV1. Ocena progresji POChP może być zatem dokonywana nie tylko na podstawie badania czynnościowego układu oddechowego, ale także badań wysiłkowych.

Vitamin D status of severe COPD patients with chronic respiratory failure

Introduction: The aim of the study was to measure the concentrations of vitamin D in serum of COPD patients with chronic respiratoryfailure in comparison to healthy control group. The correlation between the levels of vitamin D in serum and the selectedclinical, spirometric and blood gas parameters was the additional aim of the study. Material and methods: The study included 61 patients with diagnosed COPD in stadium of chronic respiratory failure (45 menand 16 women) and 37 healthy controls (19 men and 18 women). The following procedure were performed in all studied subjects:detailed history (especially: daily activity, diet, tobacco and alcohol use), post-bronchodilator spirometry, assessment of 25(OH)Din serum and for COPD group only blood gas analysis. Recruitment for the study was conducted from November to April. Statisticalanalysis was performed using the following statistical methods: t-Student test, Mann-Whitney U test, Spearman correlationtest and Chi-kwadrat test. Results: There was no significant differences between COPD and control group for the levels of 25(OH)D in serum. Median andlower; upper quartile were respectively following: 24,75 nmol/l (16,9; 36,4) vs. 24,06 nmol/l (16,3; 37,2), p=0,69. Vitamin Ddeficiency was present in 60 COPD patients (98,3% of all patients) and in 36 control group subject (97,3% of all healthy volunteers).The difference was not statistically significant. The levels of vitamin D in serum did not significantly correlated with anyof studied parameters (spirometry, blood gas, age, the level of activity, BMI, tobacco smoke exposure and others). However, thelevel of activity in COPD group correlated positively with spirometry values and negatively with age and number of exacerbations. Conclusion: The results of the study showed that in autumn-winter time in Poland there are very frequent deficiency of vitaminD in serum not only in COPD patients in respiratory failure stage but also in elderly healthy persons. However, in contrary toexpectations the deficiency of vitamin D in COPD patients with respiratory failure were similar to that seen in healthy persons

Assessment of Reliability of Mixing Process in Diverse Mixers

Homogeneity of fodder blends is one of the primary fodder blend quality criteria. Inadequate mixing of fodder ingredients may cause insufficient growth of livestock and unsuccessful medical treatment in the case of healing fodder. Majority of fodder producers make use of the information contained in the fodder blend technical dossier for the purpose of target mixing parameters. However, average mixing time, that is very often specified, does not reflect the specific nature of a given fodder blend. Apart from the fodder blend construction parameters, physical properties of raw materials used for production purposes, in particular disintegration degree, fodder blend discharge manner, filling degree have an impact upon the homogeneity of mixing. The research on the homogeneity of mixing in various fodder producers has proven the necessity to control this stage of production

Role of C-C chemokines in the determination of pleural effusion etiology

Introduction: Pleural effusion secondary to various diseases is associated with the presence of different inflammatory cells. The C-C chemokines (MCP-1 and MIP-1α), produced by pleural mesothelial cells, plays an important role in the recruitment of inflammatory cells to the pleural space. The purpose of the study was to evaluate predictive value of MCP-1 and MIP-1α in the differential diagnosis of pleural effusion. Material and methods: Based on Light’s criteria in 29 cases exudates and in 10 transudates were recognized. We investigated 39 patients with pleural effusion (congestive heart failure - 10, parapneumonic - 11, tuberculous - 6, malignant - 12). The C-C chemokines MCP-1 and MIP-1α levels in pleural effusion and serum were measured by ELISA. Results: The MCP-1 was significantly higher (p = 0.009) in the patient with exudates than in patients with transudates (2436 pg/ml and 794 pg/ml respectively). ROC curve analysis revealed however that this parameter has limited value in the differentiation of exudates an transudates (MCP-1 cut off value 1060 pg/ml, sensitivity 48%, specificity 90%, PPV 93%, NPV 37%). The chemokine MIP-1α were significantly higher (p = 0.001) in tuberculous than in the malignant effusion (405 pg/ml and 30 pg/ml respectively). Based on the ROC curve analysis, as a cut off value in the differentiation of tuberculous and malignant pleural effusion a value 120 pg/ml was accepted. The sensitivity of this test was 66% and specificity 99%, PPV 80%, NPV 84%. Conclusions: The chemokine MCP-1 has a limited value in the differentiation between transudate and exudates; MIP-1α could be helpful in the differentiation between tuberculous and malignant pleural effusion.Wstęp: Płyn opłucnowy cechuje się obecnością różnych komórek zapalnych. Produkowane między innymi przez komórki śródbłonka opłucnej C-C chemokiny (MCP-1 i MIP-1α) odgrywają istotną rolę w procesie napływu komórek zapalnych do jamy opłucnowej. Celem pracy była ocena wartości tych cytokin w ustalaniu etiologii płynu opłucnowego. Materiał i metody: Chemokiny MCP-1 i MIP-1α oznaczono w surowicy i płynie opłucnowym u 39 chorych. W 29 przypadkach stwierdzono wysięk, a w 10 przesięk, opierając się na kryteriach Lighta. U 12 pacjentów przyczyną wysięku były przerzuty raka płuca, u 6 pacjentów rozpoznano wysięk gruźliczy, a u 11 parapneumoniczny. Stężenie MCP-1 i MIP-1α określono metodą ELISA. Stężenie MCP-1 w płynie było istotnie wyższe (p = 0,009) w wysięku niż w przesięku (odpowiednio 2436 pg/ml i 794 pg/ml). Stężenie MIP-1a było istotnie wyższe w wysięku gruźliczym niż w wysięku nowotworowym w przebiegu raka płuca. Na podstawie analizy krzywej ROC określono wartość progową stężenia MCP-1 wynoszącą 1060 pg/ml. Zdaniem autorów niniejszej pracy, z uwagi na małą czułość wartość tego wskaźnika w różnicowaniu wysięku i przesięku jest ograniczona (czułość 48%, specyficzność 90%, PPV 93%, NPV 37%). Wyniki: Stężenie MIP-1α było istotnie wyższe (p = 0,001) w wysięku gruźliczym niż w wysięku nowotworowym (odpowiednio 405 pg/ml i 30 pg/ml). Na podstawie analizy krzywej ROC zaakceptowano stężenie progowe różnicujące wysięk gruźliczy i nowotworowy równe 120 pg/ml (czułość 66%, specyficzność 99%, PPV 80%, NPV 84%). Wnioski: Chemokina MCP-1 ma ograniczoną wartość w różnicowaniu wysięku i przesięku. Chemokina MIP-1α może być pomocna w różnicowaniu wysięku o etiologii gruźliczej i nowotworowej

Modelling hurricane track memory

It has been observed that hurricanes that are close in time often follow similar paths. If this can be shown to be statistically significant, it could have implications for how insurance premiums are calculated in areas of the US prone to hurricanes. We developed two independent path distance metrics and while one suggested that sequential storms within a given hurricane season are more likely to follow each other than any other pair of storms within that season, this conclusion was not supported by the other metric. Some considerations of how local and large scale air pressure gradients might affect hurricane paths were considered. A point vortex model in the presence of a steering flow field was developed and used to simulate the path of two time displaced vortices. In order for the vortices to follow each other they had to be relatively weak compared to the steering flow field. At realistic vortex strength, the trajectories became chaotic. In summary, our metrics provided conflicting evidence towards the no- tion of hurricane track memory. A large-scale steering flow field did not appear to provide sufficient explanation for hurricanes following each other, though this does not preclude hurricane track memory being due to localised physical changes following a large storm

Ocena niedoborów witaminy D w grupie pacjentów z ciężką przewlekłą obturacyjną chorobą płuc w stadium przewlekłej niewydolności oddechowej

WSTĘP: Celem pracy była ocena stężenia witaminy D w surowicy chorych z niewydolnością oddechową w przebiegu przewlekłej obturacyjnej choroby płuc POChP w porównaniu z grupą kontrolną złożoną ze zdrowych osób. Dodatkowym celem badania była analiza korelacji stężenia witaminy D w surowicy z wybranymi parametrami klinicznymi, gazometrycznymi i spirometrycznymi. MATERIAŁ I METODY: Badaniem objęto 61 osób z POChP w stadium przewlekłej niewydolności oddechowej (45 mężczyzn oraz 16 kobiet) oraz 37 osób zdrowych w grupie kontrolnej (19 mężczyzn oraz 18 kobiet). W obydwu grupach wykonano następujące procedury: szczegółowy wywiad z uwzględnieniem aktywności ruchowej, diety i używek, spirometrię po leku rozszerzającym oskrzela, oznaczenie stężenia 25(OH)D w surowicy oraz w grupie badanej gazometrię krwi arterializowanej. Rekrutacja trwała od listopada do kwietnia. Analiza statystyczna została przeprowadzona za pomocą testu t-Studenta, testu U-Manna-Whitneya, korelacji porządku rang Spearmana i testu Chi-kwadrat. WYNIKI: Stężenia 25(OH)D w surowicy krwi nie różniły się istotnie statystycznie pomiędzy grupą badaną a grupą kontrolną. Mediana (dolny i górny kwartyl) wyniosły odpowiednio: 24,75 nmol/l (16,9; 36,4) v. 24,06 nmol/l (16,3; 37,2), p = 0,69. Niedobór witaminy D wystąpił u 60 chorych na POChP (98,3%) oraz 36 osób z grupy kontrolnej (97,3%), a różnica nie była znamienna statystycznie. Stężenie witaminy D nie korelowało istotnie statystycznie z żadnymi parametrami spirometrycznymi, gazometrycznymi, aktywnością, wiekiem, BMI ani paczkolatami palenia tytoniu. Natomiast oceniana aktywność korelowała dodatnio z parametrami spirometrycznymi i ujemnie z wiekiem oraz liczbą zaostrzeń. WNIOSKI: Wynik badania potwierdził, że w okresie jesienno-zimowym w Polsce niedobór witaminy D jest bardzo częsty nie tylko u chorych na POChP w stadium niewydolności oddechowej, ale także u osób zdrowych w podeszłym wieku. W przeciwieństwie do oczekiwań stężenia witaminy D w surowicy krwi u chorych na POChP z niewydolnością oddechową były podobne jak obserwowane w grupie kontrolnej złożonej z osób zdrowych.WSTĘP: Celem pracy była ocena stężenia witaminy D w surowicy chorych z niewydolnością oddechową w przebiegu przewlekłej obturacyjnej choroby płuc POChP w porównaniu z grupą kontrolną złożoną ze zdrowych osób. Dodatkowym celem badania była analiza korelacji stężenia witaminy D w surowicy z wybranymi parametrami klinicznymi, gazometrycznymi i spirometrycznymi. MATERIAŁ I METODY: Badaniem objęto 61 osób z POChP w stadium przewlekłej niewydolności oddechowej (45 mężczyzn oraz 16 kobiet) oraz 37 osób zdrowych w grupie kontrolnej (19 mężczyzn oraz 18 kobiet). W obydwu grupach wykonano następujące procedury: szczegółowy wywiad z uwzględnieniem aktywności ruchowej, diety i używek, spirometrię po leku rozszerzającym oskrzela, oznaczenie stężenia 25(OH)D w surowicy oraz w grupie badanej gazometrię krwi arterializowanej. Rekrutacja trwała od listopada do kwietnia. Analiza statystyczna została przeprowadzona za pomocą testu t-Studenta, testu U-Manna-Whitneya, korelacji porządku rang Spearmana i testu Chi-kwadrat. WYNIKI: Stężenia 25(OH)D w surowicy krwi nie różniły się istotnie statystycznie pomiędzy grupą badaną a grupą kontrolną. Mediana (dolny i górny kwartyl) wyniosły odpowiednio: 24,75 nmol/l (16,9; 36,4) v. 24,06 nmol/l (16,3; 37,2), p = 0,69. Niedobór witaminy D wystąpił u 60 chorych na POChP (98,3%) oraz 36 osób z grupy kontrolnej (97,3%), a różnica nie była znamienna statystycznie. Stężenie witaminy D nie korelowało istotnie statystycznie z żadnymi parametrami spirometrycznymi, gazometrycznymi, aktywnością, wiekiem, BMI ani paczkolatami palenia tytoniu. Natomiast oceniana aktywność korelowała dodatnio z parametrami spirometrycznymi i ujemnie z wiekiem oraz liczbą zaostrzeń. WNIOSKI: Wynik badania potwierdził, że w okresie jesienno-zimowym w Polsce niedobór witaminy D jest bardzo częsty nie tylko u chorych na POChP w stadium niewydolności oddechowej, ale także u osób zdrowych w podeszłym wieku. W przeciwieństwie do oczekiwań stężenia witaminy D w surowicy krwi u chorych na POChP z niewydolnością oddechową były podobne jak obserwowane w grupie kontrolnej złożonej z osób zdrowych