Association Testing of Previously Reported Variants in a Large Case-Control Meta-analysis of Diabetic Nephropathy

We formed the GEnetics of Nephropathy–an International Effort (GENIE) consortium to examine previously reported genetic associations with diabetic nephropathy (DN) in type 1 diabetes. GENIE consists of 6,366 similarly ascertained participants of European ancestry with type 1 diabetes, with and without DN, from the All Ireland-Warren 3-Genetics of Kidneys in Diabetes U.K. and Republic of Ireland (U.K.-R.O.I.) collection and the Finnish Diabetic Nephropathy Study (FinnDiane), combined with reanalyzed data from the Genetics of Kidneys in Diabetes U.S. Study (U.S. GoKinD). We found little evidence for the association of the EPO promoter polymorphism, rs161740, with the combined phenotype of proliferative retinopathy and end-stage renal disease in U.K.-R.O.I. (odds ratio [OR] 1.14, P = 0.19) or FinnDiane (OR 1.06, P = 0.60). However, a fixed-effects meta-analysis that included the previously reported cohorts retained a genome-wide significant association with that phenotype (OR 1.31, P = 2 × 10−9). An expanded investigation of the ELMO1 locus and genetic regions reported to be associated with DN in the U.S. GoKinD yielded only nominal statistical significance for these loci. Finally, top candidates identified in a recent meta-analysis failed to reach genome-wide significance. In conclusion, we were unable to replicate most of the previously reported genetic associations for DN, and significance for the EPO promoter association was attenuated

New genetic loci link adipose and insulin biology to body fat distribution.

Body fat distribution is a heritable trait and a well-established predictor of adverse metabolic outcomes, independent of overall adiposity. To increase our understanding of the genetic basis of body fat distribution and its molecular links to cardiometabolic traits, here we conduct genome-wide association meta-analyses of traits related to waist and hip circumferences in up to 224,459 individuals. We identify 49 loci (33 new) associated with waist-to-hip ratio adjusted for body mass index (BMI), and an additional 19 loci newly associated with related waist and hip circumference measures (P < 5 × 10(-8)). In total, 20 of the 49 waist-to-hip ratio adjusted for BMI loci show significant sexual dimorphism, 19 of which display a stronger effect in women. The identified loci were enriched for genes expressed in adipose tissue and for putative regulatory elements in adipocytes. Pathway analyses implicated adipogenesis, angiogenesis, transcriptional regulation and insulin resistance as processes affecting fat distribution, providing insight into potential pathophysiological mechanisms

A Genome-Wide Association Study of Diabetic Kidney Disease in Subjects With Type 2 Diabetes

Identification of sequence variants robustly associated with predisposition to diabetic kidney disease (DKD) has the potential to provide insights into the pathophysiological mechanisms responsible. We conducted a genome-wide association study (GWAS) of DKD in type 2 diabetes (T2D) using eight complementary dichotomous and quantitative DKD phenotypes: the principal dichotomous analysis involved 5,717 T2D subjects, 3,345 with DKD. Promising association signals were evaluated in up to 26,827 subjects with T2D (12,710 with DKD). A combined (T1D+T2D) GWAS was performed using complementary data available for subjects with T1D, which, with replication samples, involved up to 40,340 diabetic subjects (and 18,582 DKD cases). Analysis of specific DKD phenotypes identified a novel signal near GABRR1 (rs9942471, p=4.5×10-8) associated with 'microalbuminuria' in European T2D cases. However, no replication of this signal was observed in Asian subjects with T2D, or in the equivalent T1D analysis. There was only limited support, in this substantially enlarged analysis, for association at previously-reported DKD signals, except for those at UMOD and PRKAG2, both associated with 'EGFR'. We conclude that, despite challenges in addressing phenotypic heterogeneity, access to increased sample sizes will continue to provide more robust inference regarding risk-variant discovery for DKD.</p

New susceptibility loci associated with kidney disease in type 1 diabetes

WOS:000309817900008Diabetic kidney disease, or diabetic nephropathy (DN), is a major complication of diabetes and the leading cause of end-stage renal disease (ESRD) that requires dialysis treatment or kidney transplantation. In addition to the decrease in the quality of life, DN accounts for a large proportion of the excess mortality associated with type 1 diabetes (T1D). Whereas the degree of glycemia plays a pivotal role in DN, a subset of individuals with poorly controlled T1D do not develop DN. Furthermore, strong familial aggregation supports genetic susceptibility to DN. However, the genes and the molecular mechanisms behind the disease remain poorly understood, and current therapeutic strategies rarely result in reversal of DN. In the GEnetics of Nephropathy: an International Effort (GENIE) consortium, we have undertaken a meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) of T1D DN comprising ∼2.4 million single nucleotide polymorphisms (SNPs) imputed in 6,691 individuals. After additional genotyping of 41 top ranked SNPs representing 24 independent signals in 5,873 individuals, combined meta-analysis revealed association of two SNPs with ESRD: rs7583877 in the AFF3 gene (P = 1.2×10(-8)) and an intergenic SNP on chromosome 15q26 between the genes RGMA and MCTP2, rs12437854 (P = 2.0×10(-9)). Functional data suggest that AFF3 influences renal tubule fibrosis via the transforming growth factor-beta (TGF-β1) pathway. The strongest association with DN as a primary phenotype was seen for an intronic SNP in the ERBB4 gene (rs7588550, P = 2.1×10(-7)), a gene with type 2 diabetes DN differential expression and in the same intron as a variant with cis-eQTL expression of ERBB4. All these detected associations represent new signals in the pathogenesis of DN.Peer reviewe

Ljud eller oljud? En enkätundersökning om lärares kunskaper kring ljudnivån i skolan.

Undersökningar kring hur buller och höga ljudnivåer i skolan påverkar elever och pedagoger är något som det inte har gjort särskilt mycket forskning kring. Som metod valdes en enkätundersökning om och hur lärare upplever samt handskas med buller, ljudnivåer och ljudmiljön i skolan. Enkätundersökningen genomfördes på fyra skolor i skolår f-9. Enkätundersökningen besvarades av 50 lärare bosatta i en mellansvensk kommun. Enkätundersökningen påvisar hur lärarna ser på ljudmiljön på sina arbetsplatser. Valet föll på just enkäter då vi ville nå ett större antal respondenter för att få en så vid bild av område som möjligt. Då ljudnivån ofta är hög i skolan och påverkar både lärares och elevers vardag på olika sätt. En god ljudmiljö påverkar hälsan och inlärningen men den påverkar också arbetsförmåga och stress. Syftet med studien var dels att titta närmare på vilka uppfattningar som yrkesverksamma lärare har kring hur problemet med buller är i skolan samt hur stort problemet är. Vi ville också undersöka vilka kunskaper lärarna har i ämnet, då vi tror att dessa två påverkar varandra. Vi ansåg att undersökningsområdet var viktigt då det handlar om att belysa ett problemområde inom skolan som ofta hamnar i skymundan men som eventuellt skulle kunna leda till stora konsekvenser om det inte tas mer på allvar. Litteraturstudien betonar vikten av en god ljudmiljö i skolan. Samtliga författare är eniga om att ljudmiljön måste bli bättre men har olika förslag på hur det skulle kunna gå till. Resultatet visar att lärarna är väl medvetna om bullerproblemen som finns på skolan men de verkar inte ha redskapen och ekonomin att genomföra sina kunskaper i handling. Vi har försökt undersöka hur yrkesverksamma lärare arbetar didaktiskt med ljudmiljön i skolan. Det vi har kunnat konstatera genom vår undersökning är att det behövs mer didaktiska kunskaper bland lärarna kring hur de aktivt kan arbeta med ljudnivåer. Vi anser också att lärare behöver konkreta tips och idéer för hur de kan arbeta med ljudmiljön i skolan. Inom det didaktiska området ljudmiljö, finns idag obefintligt med tidigare forskning. Vår slutsats av undersökningen är att lärare idag behöver stöd, kunskap, resurser och utbildning för att kunna uppnå en god ljudmiljö på sitt arbete både för sig själva och för elevernas skul

Hands - essential for life : The healthcare worker's compliance to hand hygiene

Handhygien är den främsta handling som påverkar uppkomsten av vårdrelaterade in- fektioner (VRI). Trots detta är följsamheten till handhygien låg hos hälso- och sjuk- vårdspersonalen. Hälso- och sjukvårdsorganisationen ansvarar för att hälso- och sjukvårdspersonalen arbetar för hög patientsäkerhet. Syftet med studien var att belysa faktorer som påverkar hälso- och sjukvårdspersonalens följsamhet till handhygien. Studien utfördes som en litteraturstudie där resultatet grundades i 12 vetenskapliga artiklar. Resultatet visar att olika faktorer påverkar hälso- och sjukvårdspersonalens följsamhet till handhygien. Tidsbrist sågs som den viktigaste påverkande faktorn. Även kollegors beteende och förväntningar påverkade följsamheten. Nyutexaminerade sjuksköterskor och studenter belyste vikten av goda förebilder. Kunskap och att bli påmind om handhygien behövdes för att öka följsamheten. En faktor för utförande av handhygien var hälso- och sjukvårdspersonalens egen utsatthet. Mer kunskap behövs om handhygien och VRI. Följsamhet till handhygien är ett problem som bör uppmärksammas mer

Sleep deprivation among shift working nurses- a hazard for patient safety

Bakgrund: Sömnen är viktig för människor och har en stor betydelse för bland annat inlärningen, känslolivet och påfyllnaden av energi till hjärnan. Den naturliga dygnsrytmen reglerar människors sömnbehov och vid skiftarbete är det oundvikligt att inte mixtra med den. Skiftarbete är vanligt förekommande i sjuksköterskeyrket eftersom behovet av vård existerar dygnet runt. Sjuksköterskor har mycket ansvar och det krävs att de presterar i arbetet för att bibehålla en bra omvårdnadskvalitet och patientsäkerhet. Syfte: Att undersöka sömnbrist hos sjuksköterskor orsakat av skiftarbete och hur den påverkar patientsäkerheten. Metod: En allmän litteraturöversikt genomfördes och tolv kvantitativa originalartiklar inkluderades i resultatet. Artiklarna söktes fram i databaserna pubmed, cinahl och psycINFO och granskades, analyserades och sammanställdes. Resultatet delades upp i två huvudteman och sex underteman. Resultat: Sjuksköterskors arbetsprestation försämras av sömnbrist vilket påverkar patientsäkerheten negativt. Sömnbrist är vanligt förekommande bland skiftarbetande sjuksköterskor och de har högre risk att begå fel i sitt arbete än sjuksköterskor som inte arbetar skift. Sömnbrist kan i sin tur leda till fatigue vilket också har en negativ inverkan på arbetsprestationen. Möjligheten till god återhämtning mellan arbetsskiften minskar risken för att drabbas av sömnbrist eller fatigue. Ingen slutsats kan dras angående vilket av två- eller treskift som bidrar till sämst återhämtning. Däremot innebär långa arbetspass en ökad risk för sjuksköterskan att begå behandlingsfel i sitt arbete. Slutsats: Sömnbrist och fatigue är vanligt förekommande bland skiftarbetande sjuksköterskor och har en negativ påverkan på patientsäkerheten

Ljud eller oljud? En enkätundersökning om lärares kunskaper kring ljudnivån i skolan.

Undersökningar kring hur buller och höga ljudnivåer i skolan påverkar elever och pedagoger är något som det inte har gjort särskilt mycket forskning kring. Som metod valdes en enkätundersökning om och hur lärare upplever samt handskas med buller, ljudnivåer och ljudmiljön i skolan. Enkätundersökningen genomfördes på fyra skolor i skolår f-9. Enkätundersökningen besvarades av 50 lärare bosatta i en mellansvensk kommun. Enkätundersökningen påvisar hur lärarna ser på ljudmiljön på sina arbetsplatser. Valet föll på just enkäter då vi ville nå ett större antal respondenter för att få en så vid bild av område som möjligt. Då ljudnivån ofta är hög i skolan och påverkar både lärares och elevers vardag på olika sätt. En god ljudmiljö påverkar hälsan och inlärningen men den påverkar också arbetsförmåga och stress. Syftet med studien var dels att titta närmare på vilka uppfattningar som yrkesverksamma lärare har kring hur problemet med buller är i skolan samt hur stort problemet är. Vi ville också undersöka vilka kunskaper lärarna har i ämnet, då vi tror att dessa två påverkar varandra. Vi ansåg att undersökningsområdet var viktigt då det handlar om att belysa ett problemområde inom skolan som ofta hamnar i skymundan men som eventuellt skulle kunna leda till stora konsekvenser om det inte tas mer på allvar. Litteraturstudien betonar vikten av en god ljudmiljö i skolan. Samtliga författare är eniga om att ljudmiljön måste bli bättre men har olika förslag på hur det skulle kunna gå till. Resultatet visar att lärarna är väl medvetna om bullerproblemen som finns på skolan men de verkar inte ha redskapen och ekonomin att genomföra sina kunskaper i handling. Vi har försökt undersöka hur yrkesverksamma lärare arbetar didaktiskt med ljudmiljön i skolan. Det vi har kunnat konstatera genom vår undersökning är att det behövs mer didaktiska kunskaper bland lärarna kring hur de aktivt kan arbeta med ljudnivåer. Vi anser också att lärare behöver konkreta tips och idéer för hur de kan arbeta med ljudmiljön i skolan. Inom det didaktiska området ljudmiljö, finns idag obefintligt med tidigare forskning. Vår slutsats av undersökningen är att lärare idag behöver stöd, kunskap, resurser och utbildning för att kunna uppnå en god ljudmiljö på sitt arbete både för sig själva och för elevernas skul

A gene to organism approach-assessing the impact of environmental pollution in eelpout (Zoarces viviparus) females and larvae

A broad biomarker approach was applied to study the effects of marine pollution along the Swedish west coast using the teleost eelpout (Zoarces viviparus) as the sentinel species. Measurements were performed on different biological levels, from the molecular to the organismal, including measurements of messenger RNA (mRNA), proteins, cellular and tissue changes, and reproductive success. Results revealed that eelpout captured in Stenungsund had significantly higher hepatic ethoxyresorufin O-deethylase activity, high levels of both cytochrome P4501A and diablo homolog mRNA, and high prevalence of dead larvae and nuclear damage in erythrocytes. Eelpout collected in G\uf6teborg harbor displayed extensive macrovesicular steatosis, whereby the majority of hepatocytes were affected throughout the liver, which could indicate an effect on lipid metabolism. Results also indicate that eelpouts collected at polluted sites might have an affected immune system, with lower mRNA expression of genes involved in the innate immune system and a higher number of lymphocytes. Biomarker assessment also was performed on livers dissected from unborn eelpout larvae collected from the ovary of the females. No significant differences were noted, which might indicate that the larvae to some extent are protected from effects of environmental pollutants. In conclusion, usage of the selected set of biological markers, covering responses from gene to organism, has demonstrated site-specific biomarker patterns that provided a broad and comprehensive picture of the impact of environmental stressors