Clinical impact of using multiplex PCR pneumonia panel Filmarray in critically ill patients with suspected pneumonia

Abstract

ilustraciones a color, diagramasIntroducción: La neumonía es una causa frecuente de hospitalización. En pacientes en condición crítica, la identificación del agente podría permitir ajustes oportunos de antibióticos. El objetivo es evaluar si la realización del panel de PCR múltiple para neumonía en pacientes con neumonía en unidades de cuidado intensivo (UCI) tiene efecto sobre la mortalidad, estancia hospitalaria global y en UCI y duración de la terapia antimicrobiana. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de cohorte retrospectiva de pacientes adultos con neumonía que requirieron UCI en 4 hospitales de Bogotá entre noviembre 2019 y junio 2023. Se evaluó mortalidad a 30 días, estancia hospitalaria y en UCI, duración de antibióticos y su asociación con la realización del panel PCR múltiple de neumonía (Filmarray), utilizando un puntaje de propensión y asignación de pesos para ajustar por covariables y potenciales confundidores. Resultados: Se incluyeron 304 pacientes, 150 expuestos y 154 no expuestos, con una edad media de 65,0 años (DE 14,6), 206 hombres (67.8%) y con una escala de Charlson promedio de 4.5 (DE 2.8). 186 (61.2%) presentaron COVID-19 y 256 (84.2%) tuvieron neumonía adquirida en comunidad. La estancia hospitalaria fue de 20.8 (DE 17.0) días, la de UCI 12.2 (DE 10.9) días, con un promedio de antibióticos de 2.7 (DE 1.7). No se encontró asociación entre la mortalidad a 30 días y la exposición HR 1.14 (IC 95% 0.76-1.70), aunque la valoración por infectología se relaciona con menor mortalidad HR 0.29 (IC 95% 0.19-0.45). Tampoco se encontró asociación entre la duración de antimicrobianos con la exposición IRRa 1.17 (IC 95% 0.90-1.54). Discusión: El uso del panel Filmarray neumonía en pacientes adultos críticamente enfermos no se relaciona con cambios en la mortalidad ni en la duración de antibióticos. Se requiere integrar este tipo de pruebas a los programas de optimización de antimicrobianos para contribuir a la toma de decisiones más racionales. (Texto tomado de la fuente)Introduction: Pneumonia is a frequent cause of hospitalization. In critically ill patients, identification of the pathogen may allow timely adjustment of antibiotics. The aim of the study was to assess whether performing a multiplex PCR pneumonia panel in patients with pneumonia in Intensive Care Units (ICU), has any effect on mortality, overall hospital stay, ICU stay and duration of antimicrobial therapy. Materials and methods: A retrospective cohort study was conducted on adult patients with pneumonia who required ICU admission in four institutions in Bogotá between November 2019 and June 2023. Mortality at 30-day, length of hospital and ICU stay, and duration of antibiotics, and their association with the performance of the multiplex PCR pneumonia panel (Filmarray) were evaluated using an inverse propensity of the treatment weighting to adjust for covariates and potential confounders. Results: 304 patients were included, 150 exposed, 154 non exposed. Mean age 65,0 years (DE 14,6), 206 males (67.8%) and mean Charlson index 4.5 (SD 2.8). 186 (61.2%) patients had COVID-19 pneumonia and 256 (84.2%) community acquired pneumonia. Length of hospital stay was 20.8 days (SD 17.0), ICU stay was 12.2 days (SD 10.9), total number of antibiotics administered was 2.73 (SD 1.74). No association was found between 30-day mortality and exposition HR 1.14 (CI 95% 0.76-1.70), although the assessment by infectious diseases specialist is associated with a lower mortality HR 0.29 (CI 95% 0.19-0.45). There was no association between exposure and antimicrobial therapy duration IRRa 1.17 (CI 95% 0.90-1.54). Discussion: The use of multiplex PCR pneumonia panel Filmarray is not associated with changes in mortality or duration of antimicrobial therapy. It is necessary to integrate this type of testing into antimicrobial stewardship programs to contribute to more rational decision-making.Convocatoria Nacional para el Fortalecimiento a través del apoyo a proyectos de investigación, creación artística o innovación de la Universidad Nacional de Colombia. 2022-2024. Código Hermes 57576, QUIPÚ 202010040463.Especialidades MédicasEspecialista en InfectologíaEstudio de cohorte retrospectiva de pacientes adultos con neumonía grave en Unidad de Cuidados Intensivos (UCI) entre noviembre de 2019 y junio de 2023 con el fin de analizar los desenlaces de mortalidad a 30 días, estancia hospitalaria y estancia en UCI y su asociación con la realización de una prueba de PCR múltiple panel de neumonía; utilizando un puntaje de propensión y asignación de pesos ajustados por covariables y potenciales confundidores para balancear las variables en la población