Analisis In-Silico Senyawa Bioaktif Jahe (Zingiber officinale) sebagai Anti-Inflamasi melalui Penghambatan Sekresi Prostaglandin

Abstract

Inflamasi menimbulkan rasa nyeri yang disebabkan oleh peningkatan sekresi prostaglandin oleh protein siklooksigenase. Kinerja siklooksigenase perlu dihambat untuk mengurangi inflamasi. Penghambatan dilakukan oleh senyawa atau obat salah satunya acetaminophen dan bioaktif senyawa dari jahe.yang berikatan pada sisi katalitik siklooksigenase Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengidentifikasi interaksi acetaminophen, 10-shogaol, dan 10-gingerol terhadap COX-1/COX-2 dan mengetahui selektivitas acetaminophen, 10-shogaol, dan 10-gingerol dipengaruhi pelarut terhadap COX-1/COX-2 melalui energy binding. Analisis dilakukan secara in silico. Protein COX-1 (1EQG) dan COX-2 (6COX) diperoleh dari PDB dan ligan acetaminophen (CID1983), 10-shogaol (CID6442612), dan 10-gingerol (CID1681115) diperoleh dari PubChem. Preparasi protein dilakukan menggunakan Discovery Studio 3.5 dan ligan menggunakan PyRx 0.8. Perlakuan yang digunakan yaitu docking dengan HEX 8.0 kemudian membandingkan interaksi menggunakan Discovery Studio 3.5. Analisis energy binding dan penambahan pelarut menggunakan LeadIT Biosolve 2.3.2. Hasil penelitian ini menyatakan bahwa interaksi COX-1 dan/atau COX-2 dengan ligan berada pada sisi katalitik dan memiliki tiga residu asam amino yang diduga menjadi kunci dari interaksi tersebut, yaitu Pro 542, Leu 224, dan Leu 238. Senyawa 10-shogaol cenderung menghambat COX-1 sedangkan acetaminophen dan 10-gingerol menghambat COX-2. Efisiensi ligand an energy binding yang paling baik dimiliki oleh 10-gingerol yang diberi pelarut. Pelarut berupa DMSO dapat menurunkan energy binding dan meningkatkan efisiensi ligan. Selektivitas interaksi tidak dapat teridentifikasi maksimal dengan energy binding karena energi yang dibutuhkan ligan untuk berinteraksi dengan COX-1 atau COX-2 sama. Senyawa 10-gingerol dalam hal ini berinteraksi dengan residu asam amino yang sama dengan acetaminophen dan diprediksi 10-gingerol dapat menggantikan acetaminophen, namun penelitian ini masih membutuhkan identifikasi lebih lanjut

Similar works

Full text

bkgProvided a free PDF (195.62 KB)

168815oai:repository.ub.ac.id:168815
Last time updated on June 14, 2020

This paper was published in bkg.

Having an issue?

Is data on this page outdated, violates copyrights or anything else? Report the problem now and we will take corresponding actions after reviewing your request.