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Divergence in genotypes of onion

By Gerson Henrique Wamser

Abstract

Considering that genetic variability is essential for any breeding program, one of the first steps to be taken by the breeder is to determine the genetic variability available. Is this study sought to determine teh divergence between the genotypes studied using predictive techniques, ie, those based on the morphological, physiological or molecular, quantified in a measure of similarity or dissimilarity, wich can express the degree of genetic diversity among the possible parentes. We studied fifteen genotypes used in the state of Santa Catarina: Super superprecoce, Bela Vista, Baia Indaial, Crioula Roxa and Crioula Branca (Populations); Empasc 352 Bola Precoce, Empasc 355 Juporanga, Epagri 362 Crioula Alto Vale and Epagri 363 Superprecoce (comercial populations Epagri) bela Catarina, Bella Vista and Bella Dura (Hybrid s comercial Sakata) Boreal and Gauchinha (Hortec Populations company s business); Catarina (population Agritu comercial company). The first part of the work was divided into two experiments were conducted in experimental stations of Epagri Ituporanga and Lages. The design was a randomized block designs with three replications at each location. Weevaluated the following characteristics: i) length of pseudostem in cm, ii) number of leaves per pseudostem iii) stem diameter in mm; iv) bulb diameter in cm, v) height of the bulb in cm; vi) weight bulb in grams; vii) ratio of height: diameter of the bulb (value obtained by the ratio between height and diameter of the bulb), viii) total production of bulbs in kg há-1, ix) bulkb shape, x) flowering percentage and xi) percentage of rotten bulbs. We performed multivariate analysis of variance and produced a matrix of dissimilarity based on Mahalanobis distance. The variables that contributed most to the divergence were the production of bulbs and total length of the pseudostem to the environment Ituporanga and percentage of flowering and bulb weight of the environment Lages. The second experimente was conducted at the Institute Molecular genetics and Breeding of UDESC IMEGEM. Genotype were planted in the greenhouse, thus, the extraction of DNA from plants are Young. We used eleven primers of 10 bases, which produce thirty and five bands, wirh twenty-eight polymorphic. We used the Jaccard index as a measure of similarity and UPGMA clustering method for the preparation of a dendrogram of genetic similarity. The results showed that there is divergence between the genotypes studied, Crioula Roxa and Bola Precoce the most divergente, with 0.27 similarity and were less divergente Bella Vista and Bella Dura wirh 0.89 similarityConsiderando que a variabilidade genética é essencial para qualquer programa de melhoramento, um dos primeiros passos a ser dado pelo melhorista, é determinar a variabilidade disponível. Neste trabalho procurou-se determinar a divergência existente entre os genótipos estudados através de técnicas preditivas, ou seja, que têm por base as diferenças morfológicas, fisiológicas ou moleculares, quantificadas em uma medida de dissimilaridade ou similaridade, que possa expressar o grau de diversidade genética entre os possíveis genitores. Foram estudados quinze genótipos utilizados no estado de Santa Catarina: Super Superprecoce, Bela Vista, Baia Indaial, Crioula Roxa e Crioula Branca (Populações); Empasc 352 - Bola Precoce, Empasc 355 - Juporanga Epagri 362 Crioula Alto Vale e Epagri 363 - Superprecoce (Populações comerciais da Epagri); Bella Catarina, Bella Vista e Bella Dura (Híbridos comerciais da empresa Sakata); Boreal e Gauchinha (Populações comerciais da empresa Hortec); Catarina (população comercial da empresa Agritu). A primeira parte do trabalho foi dividida em dois experimentos, sendo realizados nas estações experimentais da Epagri de Ituporanga e de Lages. O delineamento utilizado foi de blocos casualizados com três repetições em cada local. Foram avaliadas as seguintes características: i) comprimento do pseudocaule em cm; ii) número de folhas por pseudocaule; iii) diâmetro do pseudocaule em mm; iv) diâmetro do bulbo em cm; v) altura do bulbo em cm; vi) peso do bulbo em gramas; vii) relação altura: diâmetro do bulbo (valor obtido pela razão entre a altura do bulbo e o diâmetro); viii) produção total de bulbos em kg ha-1; ix) forma do bulbo; x) porcentagem de florescimento e xi) porcentagem de bulbos podres. Foi realizada a análise da variância multivariada e elaborada uma matriz de dissimilaridade, com base na distância de Mahalanobis. As variáveis que mais contribuíram para a divergência foram a produção total de bulbos e comprimento do pseudocaule para o ambiente Ituporanga e percentagem de florescimento e peso do bulbo para o ambiente Lages. O segundo experimento foi realizado no Instituto de Melhoramento e Genética Molecular da UDESC IMEGEM. Os genótipos foram semeados em casa de vegetação, sendo realizada a extração de DNA das plantas ainda jovens. Foram utilizados onze oligonucleotídeos iniciadores de 10 bases, que produziram trinta e cinco bandas, sendo vinte e oito polimórficas. Foi utilizado o coeficiente de Jaccard como medida de similaridade e o método de agrupamento UPGMA para a elaboração de um dendrograma de similaridade genética. Os resultados demonstraram que existe divergência entre os genótipos estudados, sendo Crioula Roxa e Bola Precoce os mais divergentes, com 0,27 de similaridade e os menos divergentes foram Bella Vista e Bella Dura, com 0,89 de similaridad

Topics: allium cepa L, variabilidade, RAPD, análise multivariada, allum cepa L., variability, RAPD, multivariate analysis., CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
Publisher: UDESC
Year: 2011
OAI identifier: oai:tede2-dev:tede/1314
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