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Competitive segmentation of the hippocampus and the amygdala from MRI scans

By M. CHUPIN, D. HASBOUN, É. BARDINET, S. BAILLET, L. LEMIEUX and L. GARNERO

Abstract

The hippocampus and the amygdala are two brain structures which play a central role in several fundamental cognitive\ud processes. Their segmentation from Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans is a unique way to measure their atrophy\ud in some neurological diseases, but it is made difficult by their complex geometry. Their simultaneous segmentation is\ud considered here through a competitive homotopic region growing method. It is driven by relational anatomical\ud knowledge, which enables to consider the segmentation of atrophic structures in a straightforward way. For both\ud structures, this fast algorithm gives results which are comparable to manual segmentation with a better reproducibility.\ud Its performances regarding segmentation quality, automation and computation time, are amongst the best published\ud data.L’hippocampe et l’amygdale sont deux structures cérébrales intervenant dans plusieurs fonctions cognitives\ud fondamentales. Leur segmentation, à partir de volumes d’imagerie par résonance magnétique (IRM), est un\ud outil essentiel pour mesurer leur atteinte dans certaines pathologies neurologiques, mais elle est rendue\ud difficile par leur géométrie complexe. Nous considérons leur segmentation simultanée par une méthode de\ud déformation homotopique compétitive de régions. Celle-ci est guidée par des connaissances anatomiques\ud relationnelles ; ceci permet de considérer directement des structures atrophiées. Rapide, l’algorithme donne,\ud pour les deux structures, des résultats comparables à la segmentation manuelle avec une meilleure\ud reproductibilité. Ses performances, concernant la qualité de la segmentation, le degré d’automatisation\ud et le temps de calcul, sont parmi les meilleures de la littérature

Topics: Imagerie médicale, Segmentation, IRM, Cerveau, a priori anatomiques, Medical imaging, segmentation, MRI, Brain, Anatomical priors
Publisher: GRETSI, Saint martin d'hères, France
Year: 2006
OAI identifier: oai:documents.irevues.inist.fr:2042/6753
Provided by: I-Revues
Journal:

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