Thèses et e-prints BICTEL/e
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    Integrative analyses of genome-wide transcriptomic and genomic thyroid cancer profiles

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    Cette thèse en bioinformatique a été réalisée entre 2010 et 2015 dans le groupe du Pr. Vincent Detours à l’Institut de Recherche Interdisciplinaire en Biologie Humaine et Moléculaire. Nous avons analysé des données génomiques et transcriptomiques provenant de carcinomes papillaires de la thyroïde (CPTs) et leurs tissus non-cancéreux adjacents. La première partie étudiait les différences transcriptomiques entre CPTs post-Tchernobyl et CPTs sporadiques, et leur tissus non-cancéreux adjacents. Dans notre cohorte, les cas sporadiques étaient en moyenne et significativement un an plus jeunes. Après un ajustement des données transcriptionnelles pour l'âge, près de 400 gènes étaient plus exprimés dans les tissus adjacents des patients exposés aux radiations. Cependant, nous n’avons pu détecter aucune surreprésentation de groupe de gènes participant à des fonctions biologiques connues. Il était possible de distinguer les cas sporadiques des cas post-Tchernobyl sur base des transcriptomes de leurs tissus adjacents, avec une précision de ~70%. Cette surexpression de gènes dans les tissus non-cancéreux adjacents pourrait être liée à une radiosensibilité accrue dans le groupe des patients exposés aux radiations de Tchernobyl. Dans la deuxième étude, nous avons intégré des données provenant des patients de la première partie, incluant les nombres de copies d'ADN des CPTs, le génotype de plus de 400.000 SNPs dans le sang et les données transcriptionnelles des CPTs et leurs tissus non-cancéreux adjacents. En reproduisant les résultats d'une étude précédente, nous avons retrouvé la région 7q11.23 dupliquée exclusivement dans un tiers des patients exposés aux radiations. Dans une étude indépendante, un autre groupe a montré que la duplication de cette région était plus fréquente dans une population de lignées cellulaires radiosensibles que dans la population humaine normale. Cependant, en analysant les transcriptomes des patients présentant cette duplication, nous n'avons pas détecté de différence d’expression des gènes codés dans cette région génomique. En outre, aucun génotype de SNP n'était significativement lié à l'exposition aux radiations. En conclusion, les résultats confirment qu'un tiers des CPTs post-Tchernobyl ont des traces d'un dégât radio-sensibilsant dans leur ADN. Dans une troisième étude, nous avons étudié les différences transcriptionnelles entre CPTs et leurs métastases ganglionnaires (MGs) associées, ainsi qu'entre des CPTs développant des MGs (N+) et des CPTs ne développant pas de MGs (N0). Des études précédentes comparant les MGs et leurs tumeurs associées impliquant d’autres organes ont montré une surexpression de gènes dans les MGs, liés aux cellules immunitaires. Ce signal provient du tissu contaminant environnant les MGs. Pour se défaire de ce signal contaminant, d’autres études ont microdisséqué au laser les parties tumorales des MGs. Cependant, la microdissection retire aussi le stroma associé à la tumeur, alors que celui-ci est justement impliqué dans la progression tumorale. Grâce à une méthode originale, nous avons corrigé nos données d’expression des MGs pour leur contenu en contaminant ganglionnaire non-cancéreux. Après cette correction, l’expression de gènes liés au stroma était plus élevée dans les MGs que dans leurs CPTs. Les différences d’expression entre N0 et N+ n’étaient pas reproductibles entre 4 jeux de données indépendants de CPTs. Ceci démontre l’absence d’un signal transcriptionnelle lié au statut nodal dans ces données. Cependant, en utilisant des données publiques comprenant des centaines de tumeurs, il est possible de prédire le statut nodal (N0 ou N+) des CPTs ainsi que des cancers du sein et du colon à partir de leurs transcriptomes. Des études précédentes montraient des taux de prédiction presque parfaits (>90%) du statut nodal à partir des données transcriptomiques. Nous avons décelés dans ces études le même biais technique de sélection des gènes, qui peut expliquer ces taux artificiellement élevés. Dans notre étude, ce biais n’était pas présent et la précision de nos prédictions était limitée (<70%), questionnant l’intérêt clinique de telles prédictions. La présence d’un signal permettant de prédire le statut nodal et l’irreproductibilité de ce signal dans des jeux de données indépendants peuvent s'expliquer par l’association entre le statut nodal et des caractéristiques d'agressivité des tumeurs, qui pourraient, elles, avoir une influence reproductible sur les transcriptomes. Dans notre dernière étude, nous avons analysé les différences entre CPTs, liées à la présence de BRAFV600E, une mutation commune à 60% des CPTs. En utilisant un jeu de données public, nous avons montré que les CPTs présentant la mutation étaient plus dédifférenciés, et plus infiltrés en stroma, probablement en lymphocytes et fibroblastes; et que ces CPTs présentaient plus de fibrose et proliféraient sans doute plus. Tout ceci suggère que les CPTs mutés pour BRAF constituent un groupe de CPTs plus agressif. Des caractéristiques d’agressivité pourraient être détectées au front invasif, c’est-à-dire la périphérie de la tumeur définissant son contact avec le stroma, notamment la présence de regroupement de cellules isolées du reste de la tumeur. Dans les CPTs, ces îlots cellulaires isolés sont observés sur des lames histologiques 2D et pourraient être expliqués soit par un détachement cellulaire, signe d’agressivité lié au processus métastatique, soit une conformation complexe compatible avec une tumeur connexe en 3D. Dans un CPT, nous avons analysé la conformation 3D du front invasif d'un CPT muté. Nous avons reconstruit son volume 3D grâce à une méthode originale. Les groupes de cellules cancéreuses qui semblaient isolées sur les images 2D d’histopathologie, étaient en fait connectés en 3D. L’hypothèse de la présence de détachement cellulaire suite à la transition épithélio-mésenchymateuse n’est donc pas requise pour expliquer la présence de ces îlots cellulaires en 2D. La forme 3D du front invasif impliquait une surface de contact entre tumeur et stroma bien plus importante qu'impliquée par la forme ellipsoïde habituellement décrite. Les fibroblastes participaient autant à la création de la masse tumorale que les cellules cancéreuses, puisque ces deux groupes de cellules proliféraient à la même vitesse. A l'avenir, le séquençage du matériel génétique de cellules individuelles facilitera notre interprétation des signaux génomiques et transcriptomiques, qui jusqu’alors provenaient de tissu complet, i.e. un mélange de populations de cellules tumorales, stromales et de contaminant. Une signature de radiation pourrait être extraite des profils mutationnels de cellules individuelles exposées aux radiations et à l’H2O2 in vitro et comparée à la signature des CTPs post-Tchernobyl. Les cellules tumorales et stromales individuelles des MGs pourraient être comparées aux cellules tumorales et stromales invividuelles des CPTs. De même les cellules individuelles mutées pour BRAFV600E pourraient être comparées aux cellules non mutées.Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Médecine)info:eu-repo/semantics/nonPublishe

    Antimicrobial resistance in Peruvian hospital settings

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    Antimicrobial resistance and antimicrobial misuse are of global concern but affect more the resource-constrained settings. Limited research has been done in Peru in order to address these topics. We interviewed 256 physicians of two hospitals of Lima in order to assess the knowledge, attitudes, and practices about antimicrobial resistance and antimicrobials use. Most of them agreed that antimicrobial resistance is a problem worldwide and within Peru, but only 20% correctly estimated the level of resistance of Klebsiella pneumoniae to third generation cephalosporins. We also developed a network of nine hospitals in Lima to perform a resistance surveillance of key isolates causing bacteremia. We found during a one-year period that Staphylococcus aureus was the most frequently Gram positive isolated (22%). K. pneumoniae and Escherichia coli were the most frequent Gram-negative bacilli, >75% of both produced extended-spectrum β-lactamases (ESBLs). ESBL-producers microorganisms had also higher level of co-resistance to ciprofloxacin and gentamicin. Finally, to explore the antimicrobial resistance and molecular characteristics of methicillin-resistant S. aureus, we analyzed isolates from patients and healthcare workers (HCWs). Fifty percent of 338 blood isolates were methicillin-resistant (MRSA); one predominant multidrug-resistant MRSA strain was found in all hospitals (ST 5 spa t149-SCCmec I-, the Cordobes-Chilean clone. MRSA nasal carriage rate of 8.7%, was found among HCWs. The two most common clones circulating among HCWs were also the two predominant among patients with bacteremia. There is a need to implement cost-effective infection control policies to reduce the transmission of multidrug resistant microorganisms in these settings.La résistance aux antibiotiques et leur utilisation inappropriée constituent un problème majeur de santé publique qui affecte particulièrement les pays à revenus faibles et intermédiaires. Les données concernant cette problématique sont très limitées au Pérou. Nous avons interrogé 256 médecins de deux hôpitaux à Lima afin d’évaluer leurs connaissances et leurs pratiques vis-à-vis de l’utilisation des antibiotiques et de la résistance aux antibiotiques. La plupart des médecins étaient conscientisés à la problématique de la multirésistance chez les entérobactéries, mais seulement 20% d’entre eux estimaient correctement le taux résistance de Klebsiella pneumoniae aux céphalosporines à large spectre au sein de leurs institutions. Au cours de ce travail, un réseau entre neuf hôpitaux de Lima a été implémenté afin de suivre la résistance aux antimicrobiens des souches isolées d’hémocultures. Au cours des années 2008-2009, le Staphylococcus aureus était la bactérie Gram-positive la plus fréquente (22%) ;K. pneumoniae et Escherichia coli représentaient les bactéries Gram-négatives les plus souvent isolées d’hémocultures. Parmi ces dernières entérobactéries, 75% produisaient des β-lactamases à spectre étendu (BLSE) avec un taux élevé de co- résistance à la ciprofloxacine et à la gentamicine. Les souches de S. aureus isolées d’hémocultures chez les patients hospitalisés et de dépistage chez les professionnels de santé (PS) ont été caractérisées pour leur profil de résistance aux antibiotiques et génotypées par biologie moléculaire. La moitié des 338 souches isolées d’hémocultures étaient résistantes à la méticilline (« MRSA ») et appartenaient à un clone prédominant disséminés dans ces différents hôpitaux, appelé le ST 5- spa t149-SCCmec I, ou le clone Cordobes-Chilien. Le taux de portage nasal de MRSA parmi les PS était à 8,7% ;les deux génotypes les plus fréquemment observés chez les PS appartenaient aux mêmes clones que ceux retrouvés majoritairement chez les patients hospitalisés. Cette observation suggère une transmission horizontale. L’implémentation de politiques de contrôle de l'infection est primordiale dans les établissements de santé au Pérou afin de réduire la transmission de micro-organismes multi-résistants.Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Médecine)info:eu-repo/semantics/nonPublishe

    Essays in Financial Economics

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    The financial crisis that started in 2007 has seen central banks play an unprecedented role both to ensure financial stability and to support economic activity. While the importance of the central bank in ensuring financial stability is well known (see e.g. Padoa-Schioppa (2014)), the unprecedented nature of the financial crisis led central banks to resort to new instruments for which the literature offered little guidance. This thesis aims to bridge this gap, using both theory and data to better understand one of the main instruments used by central banks: collateralized loans. The general contribution of the thesis is thus both retrospective and forward looking. On a retrospective point of view, it helps understanding the actions of the central bank during the crisis and the mechanisms involved. Looking forward, a better understanding of the tools used during the crisis allows to better inform future policies.The first chapter starts from the observation that the literature, starting with Bagehot (1873), has generally assumed that the central bank should lend against high quality collateral. However in the 2007-2013 crisis central banks lent mostly against low quality collateral. In this chapter, we explore when it is efficient for the central bank to relax its collateral policy. In our model, a commercial bank funds projects in the real economy by borrowing against collateral from the interbank market or the central bank. While collateral prevents the bank from shirking (in the spirit of Holmstrom and Tirole (2011)), it is costly to use as its value is lower for investors and the central bank than for the bank. We find that when the bank has high levels of available collateral, it borrows in the interbank market against low collateral requirements so that the collateral policy of the central bank has no impact on banks' borrowing. However, when the amount of available collateral falls below a threshold, the lack of collateral prevents borrowing. In this case, the collateral policy of the central bank can affect lending, and it can therefore be optimal for the central bank to relax its collateral requirements to avoid the credit crunch.The second chapter focuses on collateralized loans in the context of the euro area. According to the literature on optimum currency area, one of the main drawbacks of currency unions is the inability for the central bank to accommodate asymmetric shocks with its interest rate policy. Suppose that there are 2 countries in an economy and one suffers a negative shock while the other has a positive shock. Theory would suggest an accommodative policy - low interest rates - in the first country and a restrictive policy - high interest rates - in the second one. This is however impossible in a currency union because the interest rate must be the same for both countries (Mundell 1961, McKinnon 1963, de Grauwe 2012). In this chapter I show that collateral policy can accommodate asymmetric shocks. I extend the model of collateralized lending of the first chapter to two banks A and B and two collateral types 1 and 2 .I also introduce a central bank deposit facility which allows the interest rate instrument to be compared with the collateral policy instrument in the context of a currency area hit by asymmetric shocks. Macroeconomic shocks impact the investment opportunities available to banks and the value of their collateral and the central bank seeks to steer economy rates towards a target level. I show that when banks have different collateral portfolios (as in a monetary union where banks invest in the local economy), an asymmetric shock on the quality and value of their collateral can increase interest rates in the country hit by the negative shock while keeping them unchanged in the country with a positive shock.The third chapter provides an empirical illustration of this “collateral channel” of open market operations. We use data on assets pledged by banks to the ECB from 2009 to 2011 to quantify the “collateral substitution / smoother transmission of monetary policy” trade-off faced by the central bank. We build an empirical model of collateral choice that is similar in spirit to the model on institutional demand for financial assets of Koijen (2014). We show how the haircut of the central bank can affect the relative cost of pledging collateral to the central bank and how this cost can be estimated using the amount of assets pledged by banks. Our model allows to perform a broad set of policy counterfactuals. For example, we use the recovered coefficient to assess how a 5% haircut increase on all collateral belonging to a specific asset class (e.g. government bonds or ABS) would affect the type of collateral used at the central bank. The final chapter focuses on the use of loans as collateral by banks in the euro area. While collateral is generally viewed as consisting of liquid and safe assets such as government bonds, we show that banks in Europe do use bank loans as collateral. We identify two purposes of bank loan collateral: funding and liquidity purposes. The main distinction between the two purposes is with respect to the maturity of the instruments involved: liquidity purposes refer to the use of bank loans as collateral to obtain short term liquidity and manage unexpected liquidity shocks. In practice the central bank is the main acceptor of these collateral. The second type of use is for funding purposes, in which case bank loans are used as collateral in ABSs or covered bonds. The collateral in these transactions allow banks to obtain a lower long-term funding cost.Doctorat en Sciences économiques et de gestioninfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

    L'objet de la protection du droit d'auteur: Contribution à l'étude de la liberté de création

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    L’objectif de la recherche doctorale consiste en la définition de l’étendue du principe de la liberté de création en droit d’auteur, à travers l’analyse de l’objet de la protection du droit d’auteur. La partie introductive de la thèse est consacrée à la problématisation. Le principe de liberté de création est déduit des normes de droit international et constitutionnelles relatives d’une part à la liberté d’expression, d’autre part à la liberté d’entreprendre. Il est ensuite démontré que le droit d’auteur constitue une limite à cette liberté, contenue dans ses effets et dans son principe par le régime juridique afférent. Elle est contenue dans ses effets par le régime relatif à la durée, aux exceptions et limitations et à la mise en œuvre du droit d’auteur, lesquels sont étudiés de manière générale pour justifier leur exclusion de la recherche. Elle est par ailleurs contenue dans son principe par le régime juridique relatif à l’ « objet de la protection du droit d’auteur », dont une définition est donnée pour cerner le périmètre de l’étude. Au sens de la thèse, l’ « objet du droit d’auteur » vise l’œuvre littéraire, artistique et musicale, à l’exclusion des créations olfactives, gustatives et tactiles, des programmes d’ordinateur et des bases de données. Quant à la « protection du droit d’auteur », elle vise la protection conférée par les droits de reproduction et d’adaptation. Les première et deuxième partie de la thèse sont consacrées à l’étude critique de l’objet de la protection du droit d’auteur au sens précité, respectivement en droit positif de l’Union européenne et en droit belge. La structure générale est identique dans les deux parties. Un premier chapitre est consacré aux conditions de la protection, à savoir l’originalité et la forme (expression). Un second chapitre est consacré aux conditions de la contrefaçon, à savoir les similitudes et l’emprunt coupable. L’étude porte sur l’ensemble de la jurisprudence respectivement de la Cour de justice de l’Union européenne (spécialement depuis son arrêt Infopaq de 2009) et des juridictions belges (Cour de cassation et juridictions de fond) publiée depuis 1989 (date des premières interventions pertinentes de la Cour de cassation sur le sujet). Pour ce qui concerne le droit de l’Union européenne, l’étude de droit positif est accompagnée, pour tous les aspects qui ne reçoivent pas de réponse à l’heure actuelle, d’une lecture prospective au départ de la jurisprudence de la Cour de justice dans d’autres domaines de la propriété intellectuelle et/ou en droit d’auteur comparé. Pour ce qui concerne le droit belge, l’étude de droit positif est accompagnée d’une part, d’un examen de sa compatibilité (largement vérifiée) avec le droit de l’UE et d’autre part, d’une lecture prospective vers un affinement du droit de l’UE au départ des solutions jurisprudentielles nationales. La dernière partie propose en conclusion un modèle synthétique de l’objet du droit d’auteur en droit de l’Union européenne (précisé au départ des solutions jurisprudentielles belges) et de la liberté de création. Le modèle repose sur trois notions. Premièrement, la figure abstraite du « créateur », dont la fonction consiste à déterminer si une contribution intellectuelle déterminée peut être attribuée à un individu déterminé. Deuxièmement, la figure abstraite du « public destinataire », dont la fonction consiste à déterminer les contours d’une contribution intellectuelle. Troisièmement, le principe du « juste équilibre », dont la fonction consiste à déterminer, parmi les contours d’une contribution intellectuelle déterminée attribuée à un individu déterminé, lesquels doivent bénéficier de la protection du droit d’auteur et ceux qui doivent en être exclus. Une construction rationnelle et systématique du droit positif est fournie en application de ce modèle. Enfin, il est démontré que l’avènement de la société de l’information a modifié les termes du juste équilibre, commandant l’abandon de certaines solutions du passé.Doctorat en Sciences juridiquesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

    Contribution à la modélisation des doigts longs et développement d’un protocole clinique d’évaluation de la mobilité de la main

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    Ce travail de thèse investigue la cinématique des doigts longs par deux approches différentes et complémentaires ainsi que la faisabilité de la fusion entre celles-ci. La première approche comporte le développement complet d’un protocole d’évaluation fonctionnelle tridimensionnelle des doigts. Des mouvements continus sont étudiés de manière in vivo et la cinématique des cinq doigts est visualisée simultanément. La seconde approche consiste en l’application d’une méthodologie in vitro de modélisation des doigts afin de créer un modèle anatomiquement fidèle permettant d’apprécier la cinématique tridimensionnelle ainsi que différents paramètres biomécaniques des muscles mobilisant les doigts longs. Les deux approches sont finalement comparées et la faisabilité de leur couplage étudiée en vue d’une fusion des données issues de ces deux méthodologies. Les méthodes développées dans ce travail sont également considérées dans le cadre d’une utilisation clinique. La première partie de ce travail présente la méthodologie complète d’un protocole novateur d’évaluation de la cinématique des doigts in vivo. Plusieurs mouvements analytiques et fonctionnels des doigts ont été analysés sur un échantillon de vingt sujets sains. Les mouvements analytiques ont tout d’abord permis d’étudier le comportement physiologique des doigts mais également de constater des spécificités fonctionnelles de chacun. Les mouvements fonctionnels ont ensuite permis d’analyser la biomécanique des doigts lors de mouvements plus complexes. Les synergies intra- et inter-doigts ont été étudiées et les spécificités des muscles mobilisant les doigts sont discutées. Enfin, une base de données de sujets sains a été créée pour permettre de futures études incluant des sujets souffrant de pathologies de l’appareil neuro-musculo-squelettique de la main. Les limites mises en évidence ainsi que le rôle des muscles décrit dans cette première partie justifient l’emploi de la modélisation dans la suite de ce travail.La deuxième partie de ce travail apporte une contribution à la modélisation musculo-squelettique des doigts longs. Une nouvelle méthodologie de création de référentiels pour les segments des doigts longs est présentée et confrontée à une méthodologie faisant standard (recommandations de l’International Society of Biomechanics). Par ailleurs, le modèle développé sur base de données tomodensitométriques a permis d’étudier plusieurs paramètres de la cinématique par positions discrètes des doigts longs. Le modèle est apparu satisfaisant concernant la cinématique articulaire. Une méthodologie originale de modélisation des muscles extrinsèques des doigts est également présentée. Les résultats de l’étude des excursions tendineuses et des bras de levier musculaires ont permis de conclure que le modèle est pertinent pour l’étude de la cinématique articulaire des doigts longs et des paramètres musculaires présentés dans certaines limites. Le modèle musculo-squelettique décrit constitue une base pour de multiples améliorations futures dont certaines sont abordées dans ce travail. Afin de rendre le modèle le plus proche de la réalité, les données des deux premières parties du travail sont envisagées dans le cadre d’une fusion de données. La dernière partie de ce travail s’intéresse à la faisabilité de la fusion entre la méthodologie d’évaluation fonctionnelle de la cinématique des doigts in vivo et la modélisation musculo-squelettique des doigts longs. De nombreux paramètres cinématiques ont été comparés et les limitations identifiées ont été investiguées, dont notamment les artéfacts liés aux déplacements des tissus mous sur les segments osseux. Par ailleurs, les perspectives d’utilisation de ces deux méthodologies dans un environnement clinique sont également abordées. Dans sa globalité, ce travail apporte une contribution à la connaissance de la cinématique des doigts longs par deux approches différentes ainsi que par l’étude de la faisabilité de la fusion entre celles-ci. Les méthodologies présentées offrent de multiples possibilités. Les limitations inhérentes aux méthodologies employées dans ce travail sont étudiées et discutées. De multiples pistes de réflexion et d’études futures sont également présentées sur base des travaux décrits. La fusion des données abordée pourra dans les travaux futurs permettre de développer des outils pour l’analyse fonctionnelle des doigts dans des applications en recherche fondamentale ou en routine clinique.Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Médecine)info:eu-repo/semantics/nonPublishe

    Scalar boson decays to tau leptons: In the standard model and beyond

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    Cette thèse présente une étude du secteur scalaire dans le cadre du modèle standard (MS), ainsi que la recherche d'un secteur scalaire étendu dans des théories au-delà du MS. Ces analyses ont en commun la désintégration d'au moins un des bosons scalaires en une paire de leptons tau. Les résultats sont basés sur les données collectées par le détecteur CMS pendant le Run-1 du LHC, lors de collisions proton-proton à une énergie dans le centre de masse de 7 ou 8 TeV. Le boson découvert en 2012, H, semble compatible avec un boson de Brout-Englert-Higgs (BEH) du MS, mais ce constat se base essentiellement sur l'étude des modes de désintégration bosoniques. Le mode de désintégration H->tau tau est le canal fermionique le plus sensible, et permet de tester les couplages de Yukawa du nouveau boson. Cette thèse décrit dans un premier temps la recherche d'un boson scalaire se désintégrant en leptons tau et produit en association avec un boson vecteur. Les données du Run-1 ne sont pas sensibles aux petites sections efficaces de production prédites dans le SM, mais la combinaison avec les autres modes de production montre avec évidence l'existence de désintégrations du boson H en taus. De nombreux modèles au-delà du MS, tels que l'extension supersymétrique minimale du MS (MSSM) ou les modèles avec deux doublets scalaires (2HDM), prédisent l'existence de plusieurs boson scalaires. Quatre recherches d'un secteur scalaire étendu au-delà du MS sont présentées dans cette thèse. La première analyse recherche un pseudoscalaire avec une masse entre 220 et 350 GeV, se désintégrant en un boson scalaire similaire à celui du MS et en un boson Z, dans l'état final avec deux taus et deux leptons légers. La deuxième analyse explore la possibilité d'une désintégration exotique de la nouvelle particule en deux bosons scalaires plus légers dans l'état final avec deux muons et deux leptons tau. Dans le cadre de la troisième analyse, une région en masse quasiment inexplorée auparavant au LHC est testée par la recherche d'un pseudoscalaire avec une masse entre 25 et 80 GeV, se désintégrant en leptons tau et produit en association avec deux quarks b, dans le contexte des 2HDM. La dernière analyse recherche une résonance lourde se désintégrant en une paire de leptons tau dans le contexte du MSSM. Aucun indice de nouvelle physique n'a été trouvé dans les analyses décrites ci-dessus, mais des limites strictes sur les sections efficaces des différents signaux ont été déterminées.This thesis presents a study of the scalar sector in the standard model (SM), as well as different searches for an extended scalar sector in theories beyond the standard model (BSM). All analyses have in common the fact that at least one scalar boson decays to a pair of tau leptons. The results exploit the data collected by the CMS detector during LHC Run-1, in proton-proton collisions with a center-of-mass energy of 7 or 8 TeV.The particle discovered in 2012, H, looks compatible with a SM Brout-Englert-Higgs boson, but this statement is driven by the bosonic decay modes. The H-> tau tau decay mode is the most sensitive fermionic decay channel, and allows to test the Yukawa couplings of the new particle. The search for the SM scalar boson decaying to tau leptons, and produced in association with a massive vector boson W or Z, is described in this thesis. Even though a good background rejection can be achieved by selecting the leptons originating from the vector boson, Run-1 data are not sensitive to the small production cross sections predicted in the SM for the scalar boson. The combination with the gluon-gluon fusion and vector boson fusion production searches leads to an evidence for the decay of the H boson to tau leptons.Many BSM models, such as the minimal supersymmetric SM (MSSM) or models with two scalar doublets (2HDM), predict the existence of several scalar bosons. The decays of these bosons to tau leptons can be enhanced in some scenarios depending on the model parameters, which makes the di-tau decay mode powerful to discover BSM physics. Four searches for an extended scalar sector are detailed in this thesis. The first analysis searches for a pseudoscalar boson with a mass between 220 and 350 GeV, decaying to an SM-like scalar boson and a Z boson, in the final state with two light leptons and two tau leptons. Second, a search for the exotic decay of the new particle H to a pair of light pseudoscalar bosons, which is still allowed by all measurements made up to now, in the final state with two muons and two tau leptons is performed. Third, a mass region almost never explored at the LHC is probed by the search of a light pseudoscalar, with a mass between 25 and 80 GeV, decaying to tau leptons and produced in association with b quarks. The last analysis describes the search for a heavy resonance in the MSSM, decaying to a pair of tau leptons. None of these analyses has found any hint of new physics beyond the SM, but stringent limits on the cross section of such signals could be set.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

    Responses to the incidental parameter problem

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    In recent years, we have seen an explosion of data collected from individuals, firms, or countries across short or long periods of time. This type of data gives us an opportunity to study the dynamics of change while controlling for time-invariant unobserved heterogeneity. Unfortunately, this type of heterogeneity, which is usually in the form of individual-specific fixed effects, creates problems for identification, estimation, and inference, especially if we continue to use default procedures without modification or without critical exploration. This dissertation revolves around a common theme – what practices and methods can be considered appropriate responses to the incidental parameter problem in panel data models. My approach to research is firmly rooted in the examination of empirical and theoretical practices so that we can come to an understanding of what we can and cannot do.(ECGE - Sciences économiques et de gestion) -- UCL, 2016Accès embargo10/03/2016(ECGE - Sciences économiques et de gestion) -- UCL, 2016Anglai

    Migration et pentecôtisme brésiliens entre le Brésil et la Belgique :une analyse à partir des enjeux du "relationnement"

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    A partir des années ’90, un lien inédit s’est établi entre le Brésil et la Belgique, et plus précisément entre l’Etat de Goiás avec sa capitale Goiânia et le Triângulo Mineiro (Minas Gerais), et Bruxelles. Des dizaines de milliers de Brésiliens de ces régions ont décidé de s’établir à Bruxelles, le temps d’accumuler suffisamment d’argent (ou le plus possible) pour améliorer leurs conditions de vie au Brésil. A partir des années ’30, le Centre-Ouest du Brésil connut une urbanisation rapide qui alla de pair avec un discours violent de la modernité et du progrès. Il fit émerger une société capitaliste et consommatrice qui connaît une inégalité des plus aigües en Amérique latine. Les conditions de vie et les aspirations des populations appartenant aux bas échelons de la hiérarchie socio-économique contribuent à un sentiment croissant d’insécurité et de violence en contexte urbain. Mais aussi, une frustration douloureuse émerge de l’impossibilité de sortir définitivement de la précarité et d’accéder pleinement à des services de qualité (enseignement, santé) et à la consommation. Le présent travail part d’une analyse des effets de cette sociohistoire sur les relations sociales contemporaines. Pour saisir les enjeux, l’analyse se base sur la théorie oppositionnelle casa et rua élaborée par Roberto DaMatta, complétée par la notion de voisinage développée par Edio Soares. A partir de cette base, l’analyse porte sur les objectifs du format de l’église en cellules de la dénomination goianienne Videira, les motivations migratoires, les expériences migratoires en Belgique et le nouveau rapport à la foi pentecôtiste en contexte migratoire. L’importance accrue de la foi pour les pentecôtistes brésiliens à Bruxelles vient non seulement orienter les relations sociales et résorber les multiples expériences migratoires inattendues. Elle vient aussi définir les outils de légitimation privilégiés des pasteurs et offrir une nouvelle perspective géopolitique du monde, deux processus qui font du Brésil le centre de la légitimité pentecôtiste et de la « vrai foi ». Ce travail est le résultat d’une recherche menée de 2007 à 2014, sur base d’un long terrain à Bruxelles mais aussi à Anvers, et des séjours à Goiânia et à Uberlândia au Brésil. A Bruxelles, elle s’est déployée principalement à partir de lieux de culte, d’abord catholique (2007-08), puis pentecôtiste –à l’Igreja Universal do Reino de Deus (2009-10) et à Videira – Igreja em células (2012-2014), ainsi que dans d’autres églises.(POLS - Sciences politiques et sociales) -- UCL, 2016Accès libre20/04/2016(POLS - Sciences politiques et sociales) -- UCL, 2016Françai

    Vers la synthèse totale de l'halichlorine

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    L’halichlorine, molécule isolée d’une éponge marine, a suscité notre intérêt non seulement pour son activité biologique attrayante, mais également pour le véritable défi que représente sa synthèse. Cet alcaloïde, en inhibant l’induction des VCAM-1 (Vascular Cell Adhesion Molecule-1), pourrait être utile pour le traitement de certains cancers. Au cours de cette thèse, nous avons progressé de manière significative via une synthèse originale pour atteindre un intermédiaire clé. Dans ce but, plusieurs méthodologies développées au sein de notre laboratoire ont été utilisées, comme la formation d’orthoesters ou encore une réaction de spiroannélation. Diverses autres méthodologies intéressantes ont également fait l’objet de beaucoup d’attentions, dont un réarrangement de Beckmann et une contraction de sulfure d’Eschenmoser.(SC - Sciences) -- UCL, 2016Accès libre22/04/2016(SC - Sciences) -- UCL, 2016Françai

    Silicon nanostructures and coplanar waveguides for biosensors

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    The biosensors market had a considerable development in the last decade and is expected to increase at a quick pace in the coming years. The driving force behind this important expansion is a constant need to improve the current methods for environmental monitoring and for rapid pathogen detection. Mainly destined to point-of-care devices, biosensors are spreading through home diagnostics, bio-defense, and food industry. This high demand pushes for the development of new and more precise devices. Two fundamentally different types of sensing devices were built and studied in this work. Both types of devices were engineered using conventional micro- and nano-fabrication techniques in order to allow for a quick integration with electronic circuits. The first type is based on silicon nanowires (SiNWs) and the devices function similarly to field effect transistors. The full manufacturing protocol, which results in nanowires with trapezoidal shape, is carefully described. The effect of surface modification with (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES), on the electrical properties of the devices, was studied. Important changes in the threshold voltage and the subthreshold slope were observed between the as-fabricated devices and the APTES-conditioned ones. Furthermore, we show that the APTES significantly improves the stability of the SiNWs compared with more conventional micro-devices. The detection of proteins was studied with these SiNWs-based sensors. The second type of devices is based on coplanar waveguides and their functioning resembles that of capacitive sensors. These devices sense the change in the dielectric properties of the surrounding media and their use for the dielectric characterization of various materials is presented first. Subsequently, we employed these devices, operating in the radio-frequency range, in conjunction with gravitational sedimentation to develop a novel colloid-based biosensing method. This technique, in which the settling of bio-functionalized polystyrene beads clusters is monitored, was applied to the detection of proteins.(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Accès restreint08/04/2016(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Anglai

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